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DNAメチル化解析用RRBSライブラリー調製キット EpiNext RRBS Library Fast Kit

掲載日情報:2024/09/10 現在Webページ番号:72221

Reduced Representation Bisulfite Sequencing(RRBS)DNAライブラリーの調製を行う製品です。バイサルファイト処理後のDNAとアダプターを直接ライゲーションできるため、一般的なRRBS法でしばしば発生するアダプター結合断片の損失を防ぐことができます。本キットで調製したライブラリーは、Illumina社シークエンスプラットフォームと互換性があります。

本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。

製品画像

Reduced Representation Bisulfite Sequencingとは

Reduced representation bisulfite sequencing(RRBS)は、ゲノムワイドなDNAメチル化解析法の1つです。制限酵素によりCpGリッチなDNA断片を濃縮し、バイサルファイト処理により非メチル化シトシンをウラシルに変換する一方、5-メチルシトシンは変換しないため、1塩基単位の分解能でゲノムワイドにDNAメチル化シトシンを検出することができます。Whole-genome bisulfite sequencing(WGBS)と比較して、費用対効果の高い手法です。


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特長

  • 制限酵素処理から4時間以内でライブラリーDNAを調製できます。
  • 非メチル化シトシンの99%以上をウラシルに変換することができます。
  • バイサルファイト処理DNAへの革新的なアダプターライゲーションにより、フラグメントの損失や選択バイアスを排除し、インプットDNAの量を10 ngと低く抑えることができるため、貴重で限られた試料のメチル化プロファイリングに理想的です。
  • キットには、制限酵素処理からDNAライブラリー構築まで、すべての操作に必要な試薬が含まれています
  • Ultra HiFi増幅により、シークエンスバイアスを最小限に抑え、エラー率が低く、再現性の高いDNAライブラリーを得ることができます。
  • 新鮮または凍結組織を含む様々な組織/細胞、生体液、培養細胞などから単離されたゲノムDNAを出発試料とすることができます。
マルチプレックス法で解析するためのDNAライブラリー構築には別途、NGS Barcode(EpiNex NGS Barcode (Index) Set、#P-1060)が必要です。

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操作方法概略

Workflow of the EpiNext RRBS Library Fast Kit

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使用例

Size distribution of library fragments

ライブラリー断片のサイズ分布
本製品を使用して、HeLa細胞DNAからRRBS DNAライブラリーを調製した。
(赤)インプットDNA(20 ng)
(青)インプットDNA(200 ng)


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キット内容

  • MSPI
  • Digestion buffer
  • Modification buffer
  • Modification powder
  • DNA purification buffer
  • Desulphonation solution
  • Elution solution
  • F-Spin column
  • F-Collection tube
  • Reaction buffer
  • Reaction enzyme mix
  • 3’-Adaptor
  • 5’-Adaptor
  • MQ binding beads
  • HiFi PCR master mix
  • Primer U / I
  • Elution buffer

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価格

[在庫・価格 :2024年10月06日 00時00分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。

[在庫・価格 :2024年10月06日 00時00分現在]

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EpiNext RRBS Library Fast Kit(12 reactions)

文献数: 0

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保存条件 法規備考
掲載カタログ

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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