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メーカー：	Horizon社Dharmacon製品 OriGene Technologies
	Horizon社Dharmacon製品(メーカー略称：DHA)のRNAiコレクション，cDNAコレクション，Yeastコレクションなど，遺伝子機能研究に有用な遺伝子リソースを検索することができます。クローンコレクション検索の使い方はこちら OriGene Technologies社(メーカー略称：ORI)のTrueClone / TrueORF / TrueORF Gold cDNAクローンなど，遺伝子機能研究に有用な遺伝子リソースを検索することができます。クローンコレクション検索の使い方はこちら
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RNAシークエンシング解析受託サービス（Zymo Research社） RNA-Seq Analytical Service

掲載日情報：2024/08/01 現在Webページ番号：70924

生物学的試料において差次的に発現する遺伝子を明らかにし、差次的発現遺伝子に関連する機能やパスウェイを解明する受託解析サービスです。

特長


少量の試料、FFPE試料、あらゆる生物（哺乳類、植物、細菌など）に対応		検証済みの手法により偏りのない遺伝子発現プロファイリングを実現		論文化に対応した包括的なバイオインフォマティクス遺伝子発現解析報告書をご提供


効率的なマイクロRNAの捕捉と分離		血漿および血清試料からのcfRNAと互換性あり		論文化に対応した包括的なバイオインフォマティクス遺伝子発現解析報告書をご提供

QCデータおよび基本的なシークエンシング結果をご提供するBasic Serviceと、それらにバイオインフォマティクス解析を加えたFull Serviceからご選択いただけます。
※ RNA抽出はサービスパッケージには含まれていません。

サービス項目		Total RNA-Seq Service Package		microRNA-Seq Service Package		3'mRNA-Seq Service Package
サービス項目		Basic Service	Full Service	Basic Service	Full Service	Basic Service	Full Service
サービスコード		Q1400	Q1404	Q1401	Q1405	Q1402	Q1406
RNAのQCと試料の正規化		●	●	●	●	●	●
ライブラリーの調製とQC		●	●	●	●	●	●
シークエンスデータの作成		●^*1	●^*1	●	●	●^*1	●^*1
FASTQファイルの提供		●	−	●	−	●	−
シークエンスデータの品質評価		−	●^*2	−	●^*3	−	●^*2
距離／類似性解析		−	●	−	●	−	●
遺伝子（mRNA）発現差：発現差のある遺伝子のリストと多重検定補正による有意性検定		−	●	−	●	−	●
遺伝子セットのエンリッチメント解析		−	●	−	−	−	●
クラスタリング解析	試料ごとの解析	−	●	−	−	−	●
クラスタリング解析	ヒートマップ解析	−	−	−	●	−	−

＊1 1試料当たり約30,000,000 read pair。
＊2 統計分析、fastQC、STAR、RSeQC、ライブラリー構成バイオタイプ、featureCountsを含む。
＊3 統計分析、fastQC、miRTraceを含む。

結果報告書（Full Serviceの場合）には、以下の内容が含まれます。
☞ 結果報告書例についてはこちら（メーカーサイトに飛びます）をご覧下さい。

シークエンシングプラットフォーム	NovaSeq 6000またはNovaSeq X
測定範囲	2 × 150 bp、Unique Dual Inedxing（UDI）
シークエンシング深度	約30,000,000 read pair（カスタマイズ可）
適応可能な試料の種類	RNA、細胞、組織、FFPE組織
ライブラリー作製に使用するキット	☞ Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit（#R3000）
rRNAの除去	あらゆる生物に対応した酵素法によるrRNAの除去
データの可視化	サンプル類似性マトリックス MDSプロット上位遺伝子発現パターンのヒートマップ散布図 MAプロット
統計分析	DESeq2パッケージによる遺伝子発現差解析遺伝子セットエンリッチメント解析 (パスウェイアノテーションが利用可能な場合)