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ddPCRの分子スタンダードとして有用な各種ウイルス由来の化学合成核酸 ATCC® Synthetic Nucleic Acids

掲載日情報:2019/05/16 現在Webページ番号:68757

ATCC®では,各種疾患関連ウイルスについて,ddPCR(Droplet Digital PCR )の分子スタンダードとして使用できる化学合成核酸(DNAおよびRNA)をご提供しています。これらの核酸は,ddPCRのプライマーが標的としているウイルスゲノム内の重要な領域を含んでいます。

デングウイルス由来化学合成RNAの製造プロセス

製造プロセス例

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研究分野

各研究分野をクリックすると,対応する製品のリストをご覧いただけます。

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特長

  • 合成核酸の配列設計の際に,多重整列(Multiple sequence alignment)を行っており,コンセンサス配列を含んでいます。
  • 核酸としてご提供するため,微生物の培養は必要ありません。
  • BSL-1施設で使用でき,出荷に制限はありません。
  • ISO 13485:2003に準拠して製造されています。
  • ddPCRで定量済みです。
  • 合成DNAおよび合成RNAは,それぞれBiomatrica社のDNAstableまたはRNAstable中への保存により安定化されており,一貫性のある結果が得られます。
  • ロット間またはアッセイ間のモニタリングに有用です。

Biosafety Level(BSL)とは

(詳しくはこちらをクリックして下さい。)

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使用例

合成デングウイルスRNA(DENV-4:ATCC® VR-3231SDTM)を用いたqRT-PCRによる検量線の作成

DENV-4検量線

参考資料


合成ノロウイルスGⅠ(ATCC® VR-3234SDTM )/ノロウイルス GⅡフラグメントRNA(ATCC® VR-3235SDTM)を用いた新規アッセイ系の構築

Norovirus新アッセイ法

出典

  • Ashraf, et al., "Utility of ATCC® Synthetic Molecular Standards for Norovirus GⅠ and GⅡ for Assay Development and as an Independent Control"[Poster], AMP, November 2015

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製品リスト

商品コードをクリックすると価格表を,ATCC® ロゴATCC<sup>®</sup> WebサイトロゴをクリックするとATCC® Webサイトの製品情報をご覧いただけます。

研究用途 由来ウイルス 商品コード コピー数 包装 由来 ATCC®
Webサイト
血液感染症研究
Blood-borne Disease
BK virus VR-3249SDTM 1×105~ 1×106 100μl Full length genome of BK virus derived from a plasmid cloneATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Hepatitis C virus VR-3233SDTM 1×105~ 1×106 100μlFragments from 5’UTR and X-tail region (3’UTR)ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus)VR-3247SDTM 1×105~ 1×106100μl Fragments from LMP2, BNRF-1, EBER-1, BAMH1W (1 copy, virus genome contains 7), EBNA-2, BHRF-1, EBNA-1 Region (BERF3, BKRF1), BXLF-1, BALF-5, and LMP-1ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Human herpesvirus 8 VR-3261SDTM 1×105~ 1×106100μlFragments from the minor capsid protein (ORF 26) and the latency-associated nuclear antigen (LANA or ORF 73) ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
消化器疾患研究
Digestive Disease
Astrovirus VR-3238SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from ORF1a, ORF1b, ORF2, and 3’ UTR regionsATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Cyclospora cayetanensis PRA-3000SDTM 1×105~ 1×106100μlFull 18S rRNA gene sequence, and full ITS1 and ITS2 sequences ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Dientamoeba fragilisPRA-3007SDTM1×105~ 1×106100μlFragmetns from the 18S ribosomal RNA, internal transcribed spacer 1 (ITS1), and 5.8S ribosomal RNA regionsATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Giardia lamblia PRA-3006SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the 18S ribosomal RNA, beta-giardin, triosephosphate isomerase, and glutamate dehydrogenase regions. ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Hepatitis A virus VR-3257SDTM 1×105~ 1×106 100μlFragments from the 5’ untranslated region, viral capsid proteins (VP1- 4), self-cleaving peptide 2A, proteinase 3C, and 3D RNA polymerase. ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Hepatitis E virus VR-3258SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the 5’ untranslated region, methyl transferase, Y domain, X domain, helicase, RNA-directed RNA polymerase, and open reading frames 2 and 3 (ORF2 and ORF3) ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Human parechovirus 3 VR-3260SDTM 1×105~ 1×106 100μlFragments from the 5’UTR and the viral protein VP1.ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Murine Norovirus VR-3255SDTM 1×105~ 1×106 100μlFragments from the 5’UTR, NS1/2, NS5, NS6, NS7, Gp1, VF1, GP2, GP3, and 3’UTR ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Norovirus GIVR-3234SDTM 1×105~ 1×106 100μlFragments from the RNA-dependent RNA polymerase and VP1 regions ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Norovirus GII VR-3235SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the RNA-dependent RNA polymerase, VP1, and VP2 regions ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Sapovirus VR-3237SDTM 1×105~ 1×106100μl Fragments from the RNA-dependent RNA polymerase, VP1, and polyprotein regions. ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
呼吸器疾患研究
Digestive Disease
Human bocavirus VR-3251SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the 5’UTR, NS1, NP1, VP1, VP2, and 3’ UTR genes. ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Human coronavirus VR-3262SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from from the acidic tandem repeat region, growth factor-like protein, NTPase/helicase domain, RNA-dependent RNA polymerase, spike, and nucleocapsid regions ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Human coronavirus VR-3263SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from NSP3 (ORF 1A), Rdrp (nsp12), NTPase (nsp13), nsp16, spike protein, nucleocapsid, and 3’ UTR ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Human metapneumovirus (hMPV) VR-3250SDTM 1×105~ 1×106100μl Fragments from the N, P, M, F, and L genes ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Middle East respiratory syndrome coronavirus VR-3248SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the ORF1ab, ORF5, upper envelope (upE), ORF8b, nucleocapsid (N) protein gene, and 3’UTR regions ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
性感染症および
血液感染症研究
Digestive Disease
Hepatitis B virus VR-3232SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the highly conserved precore, core, P, S and X regions ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)VR-3245SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the 5' LTR, gag gene, polgene (including protease, reverse transcriptase, and integrase regions), tat gene, rev gene, and nef gene. ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Human T-cell leukemia virus 2 (HTLV-2) VR-3259SDTM 1×105~ 1×106 100μl Proviral genome sequence of HTLV-2 except the long terminal repeats (LTRs)ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
性感染症研究 Human papillomavirus 16 VR-3240SDTM 1×105~ 1×106100μlFull length genome of HPV 16 derived from a plasmid clone ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Human papillomavirus 18VR-3241SDTM1×105~ 1×106100μlFull length genome of HPV 18 derived from a plasmid clone ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Human papillomavirus 31 VR-3256SDTM 1×105~ 1×106 100μl Full length genome of HPV 31 derived from a plasmid clone ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Mycoplasma genitalium BAA-2641SDTM 1×105~ 1×106100μl Fragments from the 16S gene, mgpA, and gapATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Treponema pallidum BAA-2642SDTM 1×105~ 1×106100μl Fragments from the polA, tpr, 23S gene, arp,16S gene, flaA, 47kDa protein gene, and bmp ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
ウイルス媒介疾患研究
Digestive Disease
Plasmodium malariae PRA-3001SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragment from the 18S rRNA gene, untranslated region(UTR), cyclooxygenase 1 and 3 (Cox1 & Cox3), and Cytochrome B (Cytb) region ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Babesia canis PRA-3008SDTM 1×105~ 1×106 100μl Partial sequence of 18S ribosomal RNAATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Chikungunya virusVR-3246SDTM 1×105~ 1×106 100μlFragments from the 5’ UTR, nsP1, nsP2, nsP3, nsP4, E2, and E1 genes ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Dengue virus type 1VR-3228SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the capsid, membrane, and envelope regions ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Dengue virus type 2VR-3229SDTM 1×105~ 1×106 100μlFragments from the capsid, membrane, and envelope regions ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Dengue virus type 3VR-3230SDTM 1×105~ 1×106 100μlFragments from the capsid, membrane, and envelope regions ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Dengue virus type 4VR-3231SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the capsid, membrane, and envelope regions ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Eastern equine encephalitis virus VR-3239SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the capsid, NSP1, NSP3, 3’UTR, E1 envelope glycoprotein, and the E2 envelope glycoprotein regions ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Rift Valley fever virusVR-3254SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the long, medium, and small genome segments, including the Gn gene and the nonstructural genes (NSs and NSm). ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Saint Louis encephalitis virus VR-3236SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the NS1 gene, premembrane, envelope, NS5 gene, and 3’ UTR regionsATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
West Nile virus VR-3198SDTM1×105~ 1×106 100μl Fragments from the 5' UTR, capsid protein C, membrane glycoprotein precursor prM, envelope protein E, nonstructural proteins NS1, NS2A, NS3, and NS5, and the 3' UTR regions ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Yellow fever virus VR-3253SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the capsid protein C, Pre-M, Envelope protein, NS1, NS2A, NS3, and NS5 regions. ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ
Zika virusVR-3252SDTM 1×105~ 1×106 100μl Fragments from the membrane glycoprotein precursor M, Envelope, NS1, NS2B, NS3, NS4B, and NS5 regions ATCC<sup>®</sup> Webサイトロゴ

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ご注文方法

ご注文は専用の分譲依頼書またはオンラインオーダーフォームをご利用下さい。

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ご注文方法及びMTA締結・ユーザー登録についてのお問い合わせはフナコシ(株)®製品担当(受託・特注品担当)Tel:03-5684-1645,Fax:03-5684-6539,E-Mail:atcc@funakoshi.co.jp までご連絡下さい。

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