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DharmaconカスタムsiRNA合成受託サービス
Custom siRNA Synthesis DharmaconカスタムsiRNA合成受託サービス
掲載日情報：2019/10/29 現在Webページ番号：67994
Horizon Discovery社のWebサイトでの本記事掲載製品の検索方法はこちら！
お客様自身で配列デザインしたsiRNAや、各種修飾（蛍光標識やin vivo 導入用のsiSTABLE修飾）を導入したsiRNAの合成を承ります。
※ 本製品は研究用です。臨床用途には使用できません。
※ Dharmacon製品（メーカー略称：DHA）につきまして、2023年4月1日より製品ご注文時にHandling Fee（手数料）を本体価格とは別にご請求させていただきます。詳細は「Handling Feeについてのご案内」をご確認下さい。
※ Horizon｜Dharmacon製品をご注文いただくには、事前にユーザー登録が必要です。ご注文方法の詳細はこちらをご覧下さい。
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- 特長
- カスタムsiRNA合成受託サービスのタイプ
- お客様が配列を指定するCustom siRNAをご注文の場合
- Custom SMARTpool Design & Synthesisをご注文の場合
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- ご注文方法
特長
- 各種化学修飾（ON-TARGET、ON-TARGETplus 、Accell、siSTABLE）を選択可能です。
- 5'末端、3 '末端にさまざまな修飾（下表）を導入可能です。
- 合成後の処理は5種類のオプションから選択可能です。
- 小容量（15 nmol スケール）から大容量までのカスタム合成に対応可能です。
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カスタムsiRNA合成受託サービスのタイプ
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お客様が配列を指定するCustom siRNAをご注文の場合
Custom siRNAのご注文入力フォームは、こちらをクリックして下さい。
■Step One：合成タイプとスケールをご指定下さい
1. siDESIGN Centerで配列設計する
siRNAの配列を設計頂く際は、WebツールsiDESIGN Centerをご活用下さい。ヒト・マウス・ラット以外の生物種の遺伝子や、特定の遺伝子バリアントをターゲットとするsiRNAの配列デザインに有用なツールです。
- 検索タイプを選択する。
- 希望のデザインするsiRNAの領域（5' UTR、ORF、3' UTR）を選択する。
- 最小および最大GC%を入力するか、デフォルト設定の値（推奨）を使用してください。
- BLAST検索（オプション）を選択する。
2. 合成後の処理オプション（Processing）タイプを選択する
| 合成後の処理 | Single Strands(A1) | Standard (A4) | HPLC | in vivo | in vivo HPLC |
|---|---|---|---|---|---|
| エタノール沈殿あるいは逆相カラムによる脱塩処理 | － | ● | ● | ● | ● |
| RNAは2'-ACE保護基を除去した状態 | － | ● | ● | ● | ● |
| アニーリング（2本のRNAがアニーリングされ2本鎖になっている） | － | ● | ● | ● | ● |
| 精製（イオン交換HPLCにより精製） | － | － | ● | － | ● |
| エンドトキシンテスト | － | － | － | ● | ● |
| カウンターイオン交換（Na+） | － | － | － | ● | ● |
| RNAは2'-ACE保護基の付いた状態 | ● | － | － | － | － |
| RNAはセンス鎖とアンチセンス鎖を別々のチューブで提供 | ● | － | － | － | － |
3. 合成後スケール（Scale）を選択する
| 10 nmol (0.015μmol Scale) | 20 nmol (0.025μmol Scale) | 40 nmol (0.05μmol Scale) |
| 150 nmol (0.2μmol Scale) | 300 nmol (0.4μmol Scale) | 750 nmol (1.0μmol Scale) |
| 1,500 nmol (2.0μmol Scale) | 3,750 nmol (5.0μmol Scale) | 7,500 nmol (10μmol Scale) |
※ nmolサイズは未修飾合成の際のサイズです。修飾合成品は収量が少なくなりますのでご注意下さい。
※ 合成スケールは、納品物の量を保証するものではありません。
■Step Two：Enter または paste (ctrl+V) の15-25 nt target sequenceをご指定下さい
■Step Three：修飾の有無または修飾の種類をご指定下さい
各種修飾（蛍光標識やin vivo導入用のsiSTABLE修飾）を導入したsiRNAの合成を承っています。
・下表のShort Codeでご指定下さい。
・容量：0.05 μmol、0.2 μmol、0.4 μmol、1.0 μmol、2.0 μmol
色素修飾
| 5’修飾 | Short Code | 3’修飾 | Short Code | |
|---|---|---|---|---|
| 5'-Biotin | Bi | 3'-Biotin | 3'-Bi | |
| － | － | 3'-Biotin LC | 3'-LCBi | |
| － | － | 3'-Biotin LC LC | 3'-2LCBi | |
| 5'-Cholesterol | Chl | 3'-Cholesterol | 3'-Chl | |
| 5'-Cy3 | Cy3 | 3'-Cy3 | Cy3-3' | |
| 5'-Cy5 | Cy5 | 3'-Cy5 | Cy5-3' | |
| 5'-Cy5.5 | Cy5^5 | 3'-Cy5.5 | Cy5^5-3' | |
| 5'-Dabcyl | Dabcyl | － | － | |
| 5'-DY547 (Cy3 alternate) | DY547 | 3'-DY547 (Cy3 alternate) | DY547-3' | |
| 5'-DY647 (Cy5 alternate) | DY647 | － | － | |
| 5'-DY677 (Cy5.5 alternate) | DY677 | － | － | |
| 5'-Fluorescein | Fl | 3'-Fluorescein | 3'-Fl | |
| － | － | 3'-Puromycin | Pmn | |
| 5'-Pyrene | 5'-Pyr | － | － | |
| 5'-TAMRA | TAM | 3'-TAMRA | 3'-TAM | |
| 5'-TET | TET | － | － |
化学修飾
| Standard RNA Bases | Short Code |
|---|---|
| (A,C,G,U) | rA, rC, rG, rU |
| 2'-Omethyl RNA Bases | Short Code |
| 2'-OMe-(A,C,G,U) | mA, mC, mG, mU |
| Standard DNA Bases | Short Code |
| 2'-Deoxy-(A,C,G,T) | dA, dC, dG, dT |
| Backbone modifications | Short Code |
| Phosphorothioate | * |
| Phosphorylation | Short Code |
| 5'-Phosphate | 5'-P |
| 2'-Modifications | Short Code |
| 2'-Fluoro-adenosine | 2'-F-A |
| 2'-Fluoro-cytidine | 2'-F-C |
| 2'-Fluoro-guanosine | 2'-F-G |
| 2'-Fluoro-uridine | 2'-F-U |
| Amino Modifiers | Short Code |
| 3'-Amino modifier C12 | N12-3' |
| 3'-Amino modifier C6 | N6-3' |
| 3'-Amino modifier C3 | N3-3' |
| 5'-Amino modifier C12 | N12 |
| 5'-Amino modifier C3 | N3 |
| 5'-Amino modifier C5 | N5 |
| 5'-Amino modifier C6 | N6 |
| Thiol Modifiers | Short Code |
| 3'-Disulfide-thiol modifier | S-S-3' |
| 5'-Disulfide-thiol modifier | S-S |
| Chain Terminators | Short Code |
| 3' Inverted abasic | b |
| 3' Inverted deoxy-thymidine | idT-3' |
| 3' Terminal 3'-deoxy-guanosine | 3'dG |
| 3' Terminal dideoxy-cytidine | ddC |
| 5' Inverted deoxy-thymidine | idT |
| 5' Terminal 5'-deoxy-ribo-adenosine | 5'dA |
| 5' Terminal 5'-deoxy-ribo-cytidine | 5'dC |
| 5' Terminal 5'-deoxy-ribo-guanosine | 5'dG |
| 5' Terminal 5'-deoxy-ribo-uridine | 5'dU |
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Custom SMARTpool Design & Synthesisをご注文の場合
お客様が選択した遺伝子に対するデザイン済みsiRNAをお届けする受託サービスです。各siRNAは、ヒト・マウス・ラットのNCBI RefSeq データベースに登録されている遺伝子をほぼ完全に網羅したデザイン済みsiRNAです。遺伝子ごとに、ノックダウン効果と特異性の高いsiRNAがデザインされています。
デザイン済みsiRNAのご注文入力フォームは、こちらをクリックして下さい。
- SMARTpoolフォーマットで納品：1つの遺伝子に対して配列デザインの異なる4種類のsiRNAをPool（混合物）として1本のチューブに入れた製品です。高確率で高効率にノックダウンでき、siRNAを用いる実験操作・時間を抑えられる製品です。
- 凍結乾燥品です。
■Step One：配列デザイン済みのsiRNAの製品タイプをご指定下さい
製品の詳細は各項目をクリックして下さい。
| siGENOME | ON-TARGETplus | Accell | |
|---|---|---|---|
| 生物種 | Human/Mouse/Rat | ||
| 容量 | 80 nmol | 80 nmol | 120 nmol |
| ノックダウン効果と特異性に優れたスタンダードタイプのsiRNA | siGENOMEのアップグレード版として、ON-TARGETplus 修飾を導入することでオフターゲット効果をより抑え、ターゲット遺伝子に対する特異性を向上。 | 独自の化学修飾により、トランスフェクション試薬を使わずに細胞へ導入できるsiRNA | |
| ON-TARGET修飾 | ●*1 | － | － |
| ON-TARGETplus 修飾 | － | ● | ●*2 |
| siSTABLE 修飾 | － | － | ●*3 |
*1 約20％のsiGENOMEsiRNAについて、センス鎖をON-TARGET修飾しています（デザインの段階でセンス鎖由来のオフターゲットの可能性が示唆された場合のみ）。
*2 Accell siRNAでは、ON-TARGETplus 修飾に類似した化学修飾により特異性を高めています。
*3 Accell siRNAでは、siSTABLE修飾に類似した化学修飾によりヌクレアーゼに対する安定性を高めています。
■Step Two：修飾の有無または修飾の種類をご指定下さい
■ON-TARGET修飾：センス鎖由来のオフターゲット効果を低減
ON-TARGET修飾はセンス鎖に対する独自の化学修飾です。センス鎖とRISCの相互作用を妨げる修飾を行うことにより、RISCはセンス鎖を取り込むことなく、アンチセンス鎖とのみ複合体を形成するようになります。センス鎖がRISCに取り込まれることに起因するオフターゲット効果が抑制されます。
■ON-TARGETplus 修飾：センス鎖、アンチセンス鎖由来のオフターゲット効果を低減
ON-TARGETplus 修飾は、センス鎖とアンチセンス鎖の両鎖に対する独自の化学修飾です。オフターゲット効果を抑えるとともに、ターゲット遺伝子に対する特異性を高めます。
センス鎖：RISCとの相互作用を妨げる修飾により、センス鎖がRISCに取り込まれることに起因するオフターゲット効果が抑えられます。
アンチセンス鎖：RISCに取り込まれたアンチセンス鎖がターゲットmRNAを認識する際に、より厳密な相補性が必要となる化学修飾により、ターゲット遺伝子に対する特異性が高められます。
ON-TARGETplus 修飾によるオフターゲット効果の低減
各ターゲット遺伝子について、未修飾、センス鎖修飾、ON-TARGETplus 修飾したsiRNAを用い、発現抑制（2倍以上）が確認されたオフターゲット遺伝子の数を示している。
■siSTABLE修飾：in vivo 実験用に安定性を向上
siSTABLE修飾は、ヌクレアーゼに対する安定性を高める化学修飾です。通常のsiRNAは血清中での安定性が不十分なためin vivo 実験には不向きですが、siSTABLE修飾されたsiRNAは血清中での安定性が大幅に向上するため、in vivo 実験に適しています。同時にセンス鎖に対する修飾が施されるため、センス鎖由来のオフターゲット効果が低減されます。
siSTABLE修飾による安定性の向上
ヒト血清（100％）中におけるsiSTABLE修飾siRNAと未修飾siRNAの安定性の比較を示している。
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ご注文方法
Horizon｜Dharmacon製品をご注文いただくには、事前にユーザー登録が必要です。
初めてご注文いただくお客様はユーザー登録・ご注文方法の詳細をこちらでご覧下さい。
ユーザー登録済みのお客様はID（メールアドレス）とパスワードで、Horizon Discovery社のWebサイトトップページでログインして、製品を検索・ご指定の上ご注文下さい。
※ Horizon Discovery社Webサイトの利用には、Google ChromeおよびSafariが推奨されています。
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