HOME > 試薬 > 遺伝子工学 > 遺伝子発現抑制 > shRNA/siRNA > DharmaconカスタムsiRNA合成受託サービス
HOME > 受託サービス・特注品 > 遺伝子合成(DNA・RNA・人工遺伝子・アンチセンス) > RNA合成 > DharmaconカスタムsiRNA合成受託サービス

Custom siRNA Synthesis DharmaconカスタムsiRNA合成受託サービス

掲載日情報:2019/10/29 現在Webページ番号:67994

Horizon Discovery社のWebサイトでの本記事掲載製品の検索方法はこちら!

お客様自身で配列デザインしたsiRNAや、各種修飾(蛍光標識やin vivo導入用のsiSTABLE修飾)を導入したsiRNAの合成を承ります。

本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
Dharmacon製品(メーカー略称:DHA)につきまして、2023年4月1日より製品ご注文時にHandling Fee(手数料)を本体価格とは別にご請求させていただきます。詳細は「Handling Feeについてのご案内」をご確認下さい。
Horizon|Dharmacon製品をご注文いただくには、事前にユーザー登録が必要です。ご注文方法の詳細はこちらをご覧下さい。

特長

  • 各種化学修飾(ON-TARGET、ON-TARGETplus、Accell、siSTABLE)を選択可能です。
  • 5'末端、3'末端にさまざまな修飾(下表)を導入可能です。
  • 合成後の処理は5種類のオプションから選択可能です。
  • 小容量から大容量までのカスタム合成に対応可能です。

目次に戻る

カスタムsiRNA合成受託サービスのタイプ

目次に戻る

お客様が配列を指定するCustom siRNAをご注文の場合

■Step 0:siDESIGN Centerで配列設計をする

siRNAの配列を設計する際は、WebツールsiDESIGN Centerをご活用下さい。ヒト・マウス・ラット以外の生物種の遺伝子や、特定の遺伝子バリアントをターゲットとするsiRNAの配列デザインに有用なツールです。
すでに配列がお決まりの方は、Step1からスタートして下さい。

  1. ターゲット遺伝子を検索する。
  2. 設計したいsiRNAの領域(5' UTR、ORF、3' UTR)を選択する。
  3. 最小および最大GC%を入力するか、デフォルト設定の値(推奨)を使用する。
  4. BLAST検索(オプション)の有無を選択し、Design RNAをクリックする。
  5. 表示された候補から目的の配列を選択し、カートに入れる。
  6. カート中のアイテムのEditからCustom siRNA入力フォームへ移動する。

■Step 1:合成タイプ・処理オプションの選択

  1. Custom siRNA入力フォームに入る。
  2. 任意の識別名を入力する(Oligo Name)。
  3. Dharmacon独自の化学修飾タイプを選択する(siRNA Type)。
  4. 合成後の処理オプション(Processing)タイプを選択する。
合成後の処理Single Strands(A1)Standard (A4)HPLCin vivoin vivo HPLC
エタノール沈殿あるいは逆相カラムによる脱塩処理
RNAは2'-ACE保護基を除去した状態
アニーリング(二本のRNAがアニーリングされ二本鎖になっている)
精製(イオン交換HPLCにより精製)
エンドトキシンテスト
カウンターイオン交換(Na
RNAは2'-ACE保護基の付いた状態
RNAはセンス鎖とアンチセンス鎖を別々のチューブで提供

5. 合成スケール(Scale)を選択する。
nmolスケールは未修飾合成の際の目安です。修飾合成品は収量が少なくなりますのでご注意下さい。
合成スケールは、納品物の量を保証するものではありません。


■Step 2:合成するsiRNAの配列情報を入力(siDESIGN Centerで設計した場合は自動入力されます)


■Step 3:修飾の有無、種類を指定

各種修飾(蛍光標識やin vivo導入用のsiSTABLE修飾)を導入したsiRNAの合成を承っています。
・下表のShort Codeでご指定下さい。
・容量:0.05 μmol、0.2 μmol、0.4 μmol、1.0 μmol、2.0 μmol

Modification Short Code
Standard RNA Bases A, C, G, U A,C,G,U
2'-OMethyl RNA Bases 2'-OMe RNA Bases (A, C, G, U) mA,mC,mG,mU
Standard DNA Bases 2'-Deoxy Bases (A, C, G, T) dA,dC,dG,dT
Backbone modifications Phosphorothioate *
Phosphorylation 5'-Phosphate 5'-P
2'-Modifications 2'-Fluoro-adenosine 2'-F-A
2'-Fluoro-cytidine2'-F-C
2'-Fluoro-guanosine2'-F-G
2'-Fluoro-uridine2'-F-U
Amino Modifiers 3'-Amino modifier C12 N12-3'
3'-Amino modifier C6N6-3'
5'-Amino modifier C12N12
5'-Amino modifier C3N3
5'-Amino modifier C5N5
5'-Amino modifier C6N6
Thiol Modifiers 3'-Disulfide thiol-modifier S-S-3'
5'-Disulfide thiol-modifierS-S
Chain Terminators 3' Inverted abasic b
3' Inverted deoxy-thymidineidT-3'
3'-Terminal 3'-Deoxy-Guanosine3'dG
3'-Terminal dideoxy-cytidineddC
5' Inverted deoxy-thymidineidT
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-adenosine5'dA
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-cytidine5'dC
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-guanosine5'dG
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-uridine5'dU
Labeling 3-Biotin 3'-Bi
3'-Cholesterol3'-Chl
3' TEG-CholesterolTEG-Chl-3'
3'-Cy3Cy3-3'
3'-Cy5Cy5-3' or N6-Cy5
3'-Cy5.5Cy5^5-3'
3' Black Hole Quencher 1BHQ-1-3'
3' Black Hole Quencher 2BHQ-2-3'
3'-Fluorescein3'-Fl
3'-Biotin LC3'-LCBi
3'-Biotin LC LC3'-2LCBi
3'-PuromycinPmn
3'-TAMRA3'-TAM
3'-N-Acetylgalactosamine (GalNAc) ClusterGalNAc-TEG
5'-BiotinBi
5'-CholesterolChl
5' Cholesterol-TEGChl-TEG
5'-Cy3Cy3
5'-Cy5Cy5
5'-Cy5.5Cy5^5
5' Black Hole Quencher 1BHQ-1
5' Black Hole Quencher 2BHQ-2
5'-DabcylDabcyl
5'-FluoresceinFl
5'-Pyrene5'-Pyr
5'-TAMRATAM
5'-TETTET
5'-(E)-vinylphosphonate (EVP, E-VP, VP) 2'-O-methyl Uridine (mU)EVP-mU
5'-N-Acetylgalactosamine (GalNAc) ClusterGalNAc

3'-N-Acetylgalactosamine Cluster(GalNAc-TEG)および5'-N-Acetylgalactosamine Cluster(GalNAc)

GalNAc(N-アセチルガラクトサミン)は小型の糖鎖リガンドであり、肝細胞への送達を目的として、しばしばオリゴヌクレオチドに化学的に結合されます。GalNAcは一般に、三分岐(トリアンテナリー、3アーム)構造のGalNAcクラスターとして、オリゴヌクレオチドの3'末端または5'末端に結合されますが、その具体的な構造は場合によって異なります。GalNAcは、siRNA、miRNA、DNAアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)、その他のRNA分子に広く使用されています。GalNAcはアシアロ糖タンパク質受容体(ASGPR)のリガンドとして機能し、肝細胞への高い特異性を有する取り込みを可能にします。また、GalNAcは、2'-フルオロ修飾や2'-O-メチル修飾塩基、ホスホロチオエート結合、さらに場合によっては5'-(E)-ビニルホスホネート修飾など、他の化学修飾と組み合わせて用いられることが多くあります。


EVP-mU

5'-(E)-ビニルホスホネートは、代謝的に安定な5'リン酸ミミックであり、Ago2による認識を保持したまま、siRNAおよびその他のRNAiオリゴヌクレオチドのin vivoにおける安定性、効力(ポテンシー)、および作用持続性を向上させます。この修飾は、2'-フルオロ修飾や2'-O-メチル修飾塩基、ホスホロチオエート結合などの他の化学修飾と併用されることが多く、さらにGalNAcやコレステロールを結合したsiRNAやRNA分子と組み合わせて使用されることも一般的です。



目次に戻る

Custom SMARTpool Design & Synthesisをご注文の場合

お客様が選択した遺伝子に対するデザイン済みsiRNAをお届けする受託サービスです。各siRNAは、ヒト・マウス・ラットのNCBI RefSeq データベースに登録されている遺伝子をほぼ完全に網羅したデザイン済みsiRNAです。遺伝子ごとに、ノックダウン効果と特異性の高いsiRNAがデザインされています。

デザイン済みsiRNAのご注文入力フォームは、こちらをクリックして下さい。

  • SMARTpoolフォーマットで納品:1つの遺伝子に対して配列デザインの異なる4種類のsiRNAをPool(混合物)として1本のチューブに入れた製品です。高確率で高効率にノックダウンでき、siRNAを用いる実験の手間や時間を抑えられる製品です。
  • 凍結乾燥品です。

■Step 1:配列デザイン済みのsiRNAの製品タイプをご指定下さい

製品の詳細は各項目をクリックして下さい。

  siGENOME ON-TARGETplus Accell
生物種Human/Mouse/Rat
容量80 nmol80 nmol120 nmol
  ノックダウン効果と特異性に優れたスタンダードタイプのsiRNA siGENOMEのアップグレード版として、ON-TARGETplus修飾を導入することでオフターゲット効果をより抑え、ターゲット遺伝子に対する特異性を向上。 独自の化学修飾により、トランスフェクション試薬を使わずに細胞へ導入できるsiRNA
ON-TARGET修飾*1
ON-TARGETplus修飾*2
siSTABLE修飾*3

*1 約20%のsiGENOME siRNAについて、センス鎖をON-TARGET修飾しています(デザインの段階でセンス鎖由来のオフターゲットの可能性が示唆された場合のみ)。
*2 Accell siRNAでは、ON-TARGETplus修飾に類似した化学修飾により特異性を高めています。
*3 Accell siRNAでは、siSTABLE修飾に類似した化学修飾によりヌクレアーゼに対する安定性を高めています。

■Step 2:修飾の有無または修飾の種類をご指定下さい

■ON-TARGET修飾:センス鎖由来のオフターゲット効果を低減

ON-TARGET修飾はセンス鎖に対する独自の化学修飾です。センス鎖とRISCの相互作用を妨げる修飾を行うことにより、RISCはセンス鎖を取り込むことなく、アンチセンス鎖とのみ複合体を形成するようになります。センス鎖がRISCに取り込まれることに起因するオフターゲット効果が抑制されます。

■ON-TARGETplus修飾:センス鎖、アンチセンス鎖由来のオフターゲット効果を低減

ON-TARGETplus修飾は、センス鎖とアンチセンス鎖の両鎖に対する独自の化学修飾です。オフターゲット効果を抑えるとともに、ターゲット遺伝子に対する特異性を高めます。

センス鎖:RISCとの相互作用を妨げる修飾により、センス鎖がRISCに取り込まれることに起因するオフターゲット効果が抑えられます。

アンチセンス鎖:RISCに取り込まれたアンチセンス鎖がターゲットmRNAを認識する際に、より厳密な相補性が必要となる化学修飾により、ターゲット遺伝子に対する特異性が高められます。

ON-TARGETplus修飾

ON-TARGETplus修飾によるオフターゲット効果の低減
各ターゲット遺伝子について、未修飾、センス鎖修飾、ON-TARGETplus修飾したsiRNAを用い、発現抑制(2倍以上)が確認されたオフターゲット遺伝子の数を示している。

■siSTABLE修飾in vivo実験用に安定性を向上

siSTABLE修飾は、ヌクレアーゼに対する安定性を高める化学修飾です。通常のsiRNAは血清中での安定性が十分ではないためin vivo実験には不向きですが、siSTABLE修飾されたsiRNAは血清中での安定性が大幅に向上するため、in vivo実験に適しています。同時にセンス鎖に対する修飾が施されるため、センス鎖由来のオフターゲット効果が低減されます。

siSTABLE修飾

siSTABLE修飾による安定性の向上
ヒト血清(100%)中におけるsiSTABLE修飾siRNAと未修飾siRNAの安定性の比較を示している。

目次に戻る

関連した特集記事

ノックダウン特集へのリンク

目次に戻る

ご注文方法

Horizon|Dharmacon製品をご注文いただくには、事前にユーザー登録が必要です。

初めてご注文いただくお客様はユーザー登録・ご注文方法の詳細をこちらでご覧下さい。

ユーザー登録済みのお客様はID(メールアドレス)とパスワードで、Horizon Discovery社のWebサイトトップページでログインして、製品を検索・ご指定の上ご注文下さい。

Horizon Discovery社Webサイトの利用には、Google ChromeおよびSafariが推奨されています。
Internet Explorerでは製品検索・ご注文の際の一部の機能が正常に作動しない場合があります。

目次に戻る

おすすめ製品記事

製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。