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Custom siRNA Synthesis DharmaconカスタムsiRNA合成受託サービス

掲載日情報:2019/10/29 現在Webページ番号:67994

Horizon Discovery社のWebサイトでの本記事掲載製品の検索方法はこちら!

お客様自身で配列デザインしたsiRNAや、各種修飾(蛍光標識やin vivo 導入用のsiSTABLE修飾)を導入したsiRNAの合成を承ります。

本製品は研究用です。臨床用途には使用できません。
Dharmacon製品(メーカー略称:DHA)につきまして、2023年4月1日より製品ご注文時にHandling Fee(手数料)を本体価格とは別にご請求させていただきます。詳細は「Handling Feeについてのご案内」をご確認下さい。
Horizon|Dharmacon製品をご注文いただくには、事前にユーザー登録が必要です。ご注文方法の詳細はこちらをご覧下さい。

特長

  • 各種化学修飾(ON-TARGET、ON-TARGETplus 、Accell、siSTABLE)を選択可能です。
  • 5'末端、3 '末端にさまざまな修飾(下表)を導入可能です。
  • 合成後の処理は5種類のオプションから選択可能です。
  • 小容量(15 nmol スケール)から大容量までのカスタム合成に対応可能です。

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カスタムsiRNA合成受託サービスのタイプ

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お客様が配列を指定するCustom siRNAをご注文の場合

■Step 0:siDESIGN Centerで配列設計をする

siRNAの配列を設計頂く際は、WebツールsiDESIGN Centerをご活用下さい。ヒト・マウス・ラット以外の生物種の遺伝子や、特定の遺伝子バリアントをターゲットとするsiRNAの配列デザインに有用なツールです。
すでに配列がお決まりの方は、Step1からスタートして下さい。

  1. ターゲット遺伝子を検索する。
  2. 希望のデザインするsiRNAの領域(5' UTR、ORF、3' UTR)を選択する。
  3. 最小および最大GC%を入力するか、デフォルト設定の値(推奨)を使用する。
  4. BLAST検索(オプション)の有無を選択し、Design RNAをクリックする。
  5. 表示された候補から希望のものを選択し、カートに入れる。
  6. カート中のアイテムのEditからCustom siRNA入力フォームへ移動する。

■Step 1:合成タイプ・処理オプションの選択

  1. Custom siRNA入力フォームに入る
  2. 任意の識別名を入力する(Oligo Name)。
  3. Dharmacon独自の化学修飾タイプを選択する(siRNA Type)。
  4. 合成後の処理オプション(Processing)タイプを選択する。
合成後の処理Single Strands(A1)Standard (A4)HPLCin vivoin vivo HPLC
エタノール沈殿あるいは逆相カラムによる脱塩処理
RNAは2'-ACE保護基を除去した状態
アニーリング(2本のRNAがアニーリングされ2本鎖になっている)
精製(イオン交換HPLCにより精製)
エンドトキシンテスト
カウンターイオン交換(Na+)
RNAは2'-ACE保護基の付いた状態
RNAはセンス鎖とアンチセンス鎖を別々のチューブで提供

5. 合成後スケール(Scale)を選択する。
nmolサイズは未修飾合成の際のサイズです。修飾合成品は収量が少なくなりますのでご注意下さい。
合成スケールは、納品物の量を保証するものではありません。


■Step 2:合成するsiRNAの配列情報を入力(siDESIGN Centerで設計した場合は自動入力されます)


■Step 3:修飾の有無、種類を指定

各種修飾(蛍光標識やin vivo導入用のsiSTABLE修飾)を導入したsiRNAの合成を承っています。
・下表のShort Codeでご指定下さい。
・容量:0.05 μmol、0.2 μmol、0.4 μmol、1.0 μmol、2.0 μmol

色素修飾

5’修飾Short Code 3’修飾Short Code
5'-BiotinBi 3'-Biotin3'-Bi
 3'-Biotin LC3'-LCBi
 3'-Biotin LC LC3'-2LCBi
5'-CholesterolChl 3'-Cholesterol3'-Chl
5'-Cy3Cy3 3'-Cy3Cy3-3'
5'-Cy5Cy5 3'-Cy5Cy5-3'
5'-Cy5.5Cy5^5 3'-Cy5.5Cy5^5-3'
5'-DabcylDabcyl 
5'-DY547 (Cy3 alternate)DY547 3'-DY547 (Cy3 alternate)DY547-3'
5'-DY647 (Cy5 alternate)DY647 
5'-DY677 (Cy5.5 alternate)DY677 
5'-FluoresceinFl 3'-Fluorescein3'-Fl
 3'-PuromycinPmn
5'-Pyrene5'-Pyr 
5'-TAMRATAM 3'-TAMRA3'-TAM
5'-TETTET 

化学修飾

siRNA化学修飾
Standard RNA BasesShort Code
(A,C,G,U) rA, rC, rG, rU
2'-Omethyl RNA BasesShort Code
2'-OMe-(A,C,G,U) mA, mC, mG, mU
Standard DNA BasesShort Code
2'-Deoxy-(A,C,G,T)dA, dC, dG, dT
Backbone modificationsShort Code
Phosphorothioate*
PhosphorylationShort Code
5'-Phosphate5'-P
2'-ModificationsShort Code
2'-Fluoro-adenosine2'-F-A
2'-Fluoro-cytidine2'-F-C
2'-Fluoro-guanosine2'-F-G
2'-Fluoro-uridine2'-F-U
Amino ModifiersShort Code
3'-Amino modifier C12N12-3'
3'-Amino modifier C6N6-3'
3'-Amino modifier C3N3-3'
5'-Amino modifier C12N12
5'-Amino modifier C3N3
5'-Amino modifier C5N5
5'-Amino modifier C6N6
Thiol ModifiersShort Code
3'-Disulfide-thiol modifierS-S-3'
5'-Disulfide-thiol modifierS-S
Chain TerminatorsShort Code
3' Inverted abasicb
3' Inverted deoxy-thymidineidT-3'
3' Terminal 3'-deoxy-guanosine3'dG
3' Terminal dideoxy-cytidineddC
5' Inverted deoxy-thymidineidT
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-adenosine5'dA
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-cytidine5'dC
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-guanosine5'dG
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-uridine5'dU


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Custom SMARTpool Design & Synthesisをご注文の場合

お客様が選択した遺伝子に対するデザイン済みsiRNAをお届けする受託サービスです。各siRNAは、ヒト・マウス・ラットのNCBI RefSeq データベースに登録されている遺伝子をほぼ完全に網羅したデザイン済みsiRNAです。遺伝子ごとに、ノックダウン効果と特異性の高いsiRNAがデザインされています。

デザイン済みsiRNAのご注文入力フォームは、こちらをクリックして下さい。

  • SMARTpoolフォーマットで納品:1つの遺伝子に対して配列デザインの異なる4種類のsiRNAをPool(混合物)として1本のチューブに入れた製品です。高確率で高効率にノックダウンでき、siRNAを用いる実験操作・時間を抑えられる製品です。
  • 凍結乾燥品です。

■Step 1:配列デザイン済みのsiRNAの製品タイプをご指定下さい

製品の詳細は各項目をクリックして下さい。

  siGENOME ON-TARGETplus Accell
生物種Human/Mouse/Rat
容量80 nmol80 nmol120 nmol
  ノックダウン効果と特異性に優れたスタンダードタイプのsiRNA siGENOMEのアップグレード版として、ON-TARGETplus 修飾を導入することでオフターゲット効果をより抑え、ターゲット遺伝子に対する特異性を向上。 独自の化学修飾により、トランスフェクション試薬を使わずに細胞へ導入できるsiRNA
ON-TARGET修飾*1
ON-TARGETplus 修飾*2
siSTABLE 修飾*3

*1 約20%のsiGENOMEsiRNAについて、センス鎖をON-TARGET修飾しています(デザインの段階でセンス鎖由来のオフターゲットの可能性が示唆された場合のみ)。
*2 Accell siRNAでは、ON-TARGETplus 修飾に類似した化学修飾により特異性を高めています。
*3 Accell siRNAでは、siSTABLE修飾に類似した化学修飾によりヌクレアーゼに対する安定性を高めています。

■Step 2:修飾の有無または修飾の種類をご指定下さい

■ON-TARGET修飾:センス鎖由来のオフターゲット効果を低減

ON-TARGET修飾はセンス鎖に対する独自の化学修飾です。センス鎖とRISCの相互作用を妨げる修飾を行うことにより、RISCはセンス鎖を取り込むことなく、アンチセンス鎖とのみ複合体を形成するようになります。センス鎖がRISCに取り込まれることに起因するオフターゲット効果が抑制されます。

■ON-TARGETplus 修飾:センス鎖、アンチセンス鎖由来のオフターゲット効果を低減

ON-TARGETplus 修飾は、センス鎖とアンチセンス鎖の両鎖に対する独自の化学修飾です。オフターゲット効果を抑えるとともに、ターゲット遺伝子に対する特異性を高めます。

センス鎖:RISCとの相互作用を妨げる修飾により、センス鎖がRISCに取り込まれることに起因するオフターゲット効果が抑えられます。

アンチセンス鎖:RISCに取り込まれたアンチセンス鎖がターゲットmRNAを認識する際に、より厳密な相補性が必要となる化学修飾により、ターゲット遺伝子に対する特異性が高められます。

ON-TARGETplus修飾

ON-TARGETplus 修飾によるオフターゲット効果の低減
各ターゲット遺伝子について、未修飾、センス鎖修飾、ON-TARGETplus 修飾したsiRNAを用い、発現抑制(2倍以上)が確認されたオフターゲット遺伝子の数を示している。

■siSTABLE修飾in vivo 実験用に安定性を向上

siSTABLE修飾は、ヌクレアーゼに対する安定性を高める化学修飾です。通常のsiRNAは血清中での安定性が不十分なためin vivo 実験には不向きですが、siSTABLE修飾されたsiRNAは血清中での安定性が大幅に向上するため、in vivo 実験に適しています。同時にセンス鎖に対する修飾が施されるため、センス鎖由来のオフターゲット効果が低減されます。

siSTABLE修飾

siSTABLE修飾による安定性の向上
ヒト血清(100%)中におけるsiSTABLE修飾siRNAと未修飾siRNAの安定性の比較を示している。

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ご注文方法

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