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Custom siRNA Synthesis DharmaconカスタムsiRNA合成受託サービス

掲載日情報:2019/10/29 現在Webページ番号:67994

Horizon Discovery社のWebサイトでの本記事掲載製品の検索方法はこちら!

お客様自身で配列デザインしたsiRNAや,各種修飾(蛍光標識やin vivo 導入用のsiSTABLE修飾)を導入したsiRNAの合成を承ります。
本製品は研究用です。臨床用途には使用できません。
Horizon|Dharmacon製品をご注文いただくには,事前にユーザー登録が必要です。ご注文方法の詳細はこちらをご覧下さい。

特長

  • 各種化学修飾(ON-TARGET,ON-TARGETplus ,Accell,siSTABLE)を選択可能です。
  • 5'末端,3 '末端にさまざまな修飾(下表)を導入可能です。
  • 合成後の処理は5種類のオプションから選択可能です。
  • 小容量(15 nmol スケール)から大容量までのカスタム合成に対応可能です。

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カスタムsiRNA合成受託サービスのタイプ

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お客様が配列を指定するCustom siRNAをご注文の場合

Custom siRNAのご注文入力フォームは,こちらをクリックして下さい。

■Step One:合成タイプとスケールをご指定下さい

1. siDESIGN Centerで配列設計する

siRNAの配列を設計頂く際は,WebツールsiDESIGN Centerをご活用下さい。ヒト・マウス・ラット以外の生物種の遺伝子や,特定の遺伝子バリアントをターゲットとするsiRNAの配列デザインに有用なツールです。

  1. 検索タイプを選択する。
  2. 希望のデザインするsiRNAの領域(5' UTR,ORF,3' UTR)を選択する。
  3. 最小および最大GC%を入力するか,デフォルト設定の値(推奨)を使用してください。
  4. BLAST検索(オプション)を選択する。

2. 合成後の処理オプション(Processing)タイプを選択する

合成後の処理Single Strands(A1)Standard (A4)HPLCin vivoin vivo HPLC
エタノール沈殿あるいは逆相カラムによる脱塩処理
RNAは2'-ACE保護基を除去した状態
アニーリング(2本のRNAがアニーリングされ2本鎖になっている)
精製(イオン交換HPLCにより精製)
エンドトキシンテスト
カウンターイオン交換(Na+)
RNAは2'-ACE保護基の付いた状態
RNAはセンス鎖とアンチセンス鎖を別々のチューブで提供

3. 合成後スケール(Scale)を選択する

10 nmol (0.015μmol Scale)20 nmol (0.025μmol Scale)40 nmol (0.05μmol Scale)
150 nmol (0.2μmol Scale)300 nmol (0.4μmol Scale)750 nmol (1.0μmol Scale)
1,500 nmol (2.0μmol Scale)3,750 nmol (5.0μmol Scale)7,500 nmol (10μmol Scale)

nmolサイズは未修飾合成の際のサイズです。修飾合成品は収量が少なくなりますのでご注意下さい。

合成スケールは,納品物の量を保証するものではありません。

■Step Two:Enter または paste (ctrl+V) の15-25 nt target sequenceをご指定下さい

■Step Three:修飾の有無または修飾の種類をご指定下さい

各種修飾(蛍光標識やin vivo導入用のsiSTABLE修飾)を導入したsiRNAの合成を承っています。
・下表のShort Codeでご指定下さい。
・容量:0.05 μmol,0.2 μmol,0.4 μmol,1.0 μmol,2.0 μmol

色素修飾

5’修飾Short Code 3’修飾Short Code
5'-BiotinBi 3'-Biotin3'-Bi
 3'-Biotin LC3'-LCBi
 3'-Biotin LC LC3'-2LCBi
5'-CholesterolChl 3'-Cholesterol3'-Chl
5'-Cy3Cy3 3'-Cy3Cy3-3'
5'-Cy5Cy5 3'-Cy5Cy5-3'
5'-Cy5.5Cy5^5 3'-Cy5.5Cy5^5-3'
5'-DabcylDabcyl 
5'-DY547 (Cy3 alternate)DY547 3'-DY547 (Cy3 alternate)DY547-3'
5'-DY647 (Cy5 alternate)DY647 
5'-DY677 (Cy5.5 alternate)DY677 
5'-FluoresceinFl 3'-Fluorescein3'-Fl
 3'-PuromycinPmn
5'-Pyrene5'-Pyr 
5'-TAMRATAM 3'-TAMRA3'-TAM
5'-TETTET 

化学修飾

siRNA化学修飾
Standard RNA BasesShort Code
(A,C,G,U) rA, rC, rG, rU
2'-Omethyl RNA BasesShort Code
2'-OMe-(A,C,G,U) mA, mC, mG, mU
Standard DNA BasesShort Code
2'-Deoxy-(A,C,G,T)dA, dC, dG, dT
Backbone modificationsShort Code
Phosphorothioate*
PhosphorylationShort Code
5'-Phosphate5'-P
2'-ModificationsShort Code
2'-Fluoro-adenosine2'-F-A
2'-Fluoro-cytidine2'-F-C
2'-Fluoro-guanosine2'-F-G
2'-Fluoro-uridine2'-F-U
Amino ModifiersShort Code
3'-Amino modifier C12N12-3'
3'-Amino modifier C6N6-3'
3'-Amino modifier C3N3-3'
5'-Amino modifier C12N12
5'-Amino modifier C3N3
5'-Amino modifier C5N5
5'-Amino modifier C6N6
Thiol ModifiersShort Code
3'-Disulfide-thiol modifierS-S-3'
5'-Disulfide-thiol modifierS-S
Chain TerminatorsShort Code
3' Inverted abasicb
3' Inverted deoxy-thymidineidT-3'
3' Terminal 3'-deoxy-guanosine3'dG
3' Terminal dideoxy-cytidineddC
5' Inverted deoxy-thymidineidT
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-adenosine5'dA
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-cytidine5'dC
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-guanosine5'dG
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-uridine5'dU


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Custom SMARTpool Design & Synthesisをご注文の場合

お客様が選択した遺伝子に対するデザイン済みsiRNAをお届けする受託サービスです。各siRNAは,ヒト・マウス・ラットのNCBI RefSeq データベースに登録されている遺伝子をほぼ完全に網羅したデザイン済みsiRNAです。遺伝子ごとに,ノックダウン効果と特異性の高いsiRNAがデザインされています。

デザイン済みsiRNAのご注文入力フォームは,こちらをクリックして下さい。

  • SMARTpoolフォーマットで納品:1つの遺伝子に対して配列デザインの異なる4種類のsiRNAをPool(混合物)として1本のチューブに入れた製品です。高確率で高効率にノックダウンでき,siRNAを用いる実験操作・時間を抑えられる製品です。
  • 凍結乾燥品です。

■Step One:配列デザイン済みのsiRNAの製品タイプをご指定下さい

製品の詳細は各項目をクリックして下さい。

  siGENOME ON-TARGETplus Accell
生物種Human/Mouse/Rat
容量80 nmol80 nmol120 nmol
  ノックダウン効果と特異性に優れたスタンダードタイプのsiRNA siGENOMEのアップグレード版として,ON-TARGETplus 修飾を導入することでオフターゲット効果をより抑え,ターゲット遺伝子に対する特異性を向上。 独自の化学修飾により,トランスフェクション試薬を使わずに細胞へ導入できるsiRNA
ON-TARGET修飾*1
ON-TARGETplus 修飾*2
siSTABLE 修飾*3

*1 約20%のsiGENOMEsiRNAについて,センス鎖をON-TARGET修飾しています(デザインの段階でセンス鎖由来のオフターゲットの可能性が示唆された場合のみ)。
*2 Accell siRNAでは,ON-TARGETplus 修飾に類似した化学修飾により特異性を高めています。
*3 Accell siRNAでは,siSTABLE修飾に類似した化学修飾によりヌクレアーゼに対する安定性を高めています。

■Step Two:修飾の有無または修飾の種類をご指定下さい

■ON-TARGET修飾:センス鎖由来のオフターゲット効果を低減

ON-TARGET修飾はセンス鎖に対する独自の化学修飾です。センス鎖とRISCの相互作用を妨げる修飾を行うことにより,RISCはセンス鎖を取り込むことなく,アンチセンス鎖とのみ複合体を形成するようになります。センス鎖がRISCに取り込まれることに起因するオフターゲット効果が抑制されます。

■ON-TARGETplus 修飾:センス鎖,アンチセンス鎖由来のオフターゲット効果を低減

ON-TARGETplus 修飾は,センス鎖とアンチセンス鎖の両鎖に対する独自の化学修飾です。オフターゲット効果を抑えるとともに,ターゲット遺伝子に対する特異性を高めます。

センス鎖:RISCとの相互作用を妨げる修飾により,センス鎖がRISCに取り込まれることに起因するオフターゲット効果が抑えられます。

アンチセンス鎖:RISCに取り込まれたアンチセンス鎖がターゲットmRNAを認識する際に,より厳密な相補性が必要となる化学修飾により,ターゲット遺伝子に対する特異性が高められます。

ON-TARGETplus修飾

ON-TARGETplus 修飾によるオフターゲット効果の低減
各ターゲット遺伝子について,未修飾,センス鎖修飾,ON-TARGETplus 修飾したsiRNAを用い,発現抑制(2倍以上)が確認されたオフターゲット遺伝子の数を示している。

■siSTABLE修飾in vivo 実験用に安定性を向上

siSTABLE修飾は,ヌクレアーゼに対する安定性を高める化学修飾です。通常のsiRNAは血清中での安定性が不十分なためin vivo 実験には不向きですが,siSTABLE修飾されたsiRNAは血清中での安定性が大幅に向上するため,in vivo 実験に適しています。同時にセンス鎖に対する修飾が施されるため,センス鎖由来のオフターゲット効果が低減されます。

siSTABLE修飾

siSTABLE修飾による安定性の向上
ヒト血清(100%)中におけるsiSTABLE修飾siRNAと未修飾siRNAの安定性の比較を示している。

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ご注文方法

Horizon|Dharmacon製品をご注文いただくには,事前にユーザー登録が必要です。

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ユーザー登録済みのお客様はID(メールアドレス)とパスワードで,Horizon Discovery社のWebサイトトップページでログインして,製品を検索・ご指定の上ご注文下さい。

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製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
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