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Guide for selecting the best cross-linking reagent 架橋試薬(クロスリンカー)の選択ガイド
掲載日情報:2021/12/29 現在Webページ番号:8022
ProteoChem社は、米国ユタ州に本拠を置くバイオテクノロジー企業で、タンパク質化学やプロテオミクス研究用試薬、分析標準品などを製造販売しています。ここでは、お求めになりやすい価格のクロスリンカー(架橋試薬)をご紹介します。
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- 架橋試薬の原理と選択法
- ProteoChem社の架橋試薬選択ガイド
- ヘテロバイファンクショナル架橋試薬の選択テーブル(スペーサー長順)
- ホモバイファンクショナル架橋試薬選択テーブル(スペーサー長順)
- ゼロ長架橋試薬選択テーブル
- 重水素標識架橋試薬選択の選択テーブル(スペーサー長順)
架橋試薬の原理と選択法
タンパク質架橋試薬は、下図のようにスペーサーアームの両端に反応基(ここでは反応基1と反応基2)を有する化合物で、標的となる生体分子上の様々な官能基と特異的に反応して、これらを結び付けることができます。その主な用途としては、「タンパク質架橋試薬の利用」に書かれたような利用例が考えられています。
タンパク質架橋試薬の利用
タンパク質架橋試薬の使用例 | タンパク質架橋試薬選択の目安 |
---|---|
|
|
参考文献:
- Miernyk J.A. and Thelen J.J., "Biochemical approaches for discovering protein-protein interactions", Plant J., 53(4), 597~609 (2008). [PMID: 18269571] (Review)
- Belsom A and Rappsilber J., "Anatomy of a crosslinker", Curr. Opin. Chem. Biol., 60, 39~46 (2021). [PMID: 32829152] (Review)
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ProteoChem社の架橋試薬選択ガイド
ProteoChem社では、スペーサーアームの各末端に異なる反応基(例えば、スルフヒドリル反応性 ~ アミン反応性)を有する”Heterobifunctional Crosslinker”、スペーサーアームの両端に同じ反応基(例えば、アミン反応性 ~ アミン反応性)を有するような”Homobifunctional Crosslinker”、スペーサーアームをさらに追加することなく2つの対象分子を結合する”Zero-length Crosslinker”、質量分析に有用な”Deuterated Crosslinker”を、高純度かつお求めになりやすい価格で提供しています。
凡例
- ●:膜透過性
- ●:水溶性
- ―:該当せず
- Thiols(or Hydroxylamine):チオール基を持つ化合物(あるいはヒドロキシルアミン)などで架橋試薬を切断できる
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ヘテロバイファンクショナル架橋試薬の選択テーブル(スペーサー長順)
ヘテロバイファンクショナル(heterobifunctional)架橋試薬は、両端に2つの異なる反応基を持つ便利な試薬です。これを使えば、タンパク質共役反応を、制御された2段階反応で行うことができます。また、タンパク質を架橋する際に、二量体やポリマーの形成を避けることができます。
商品コード(cから始まる5桁の文字列)をクリックすると価格表をご覧いただけます。
クロスリンカーの略称と 構造式※ |
反応基1 | 標的1 | 反応基2 | 標的2 | スペー サー長 |
M.W. | 切断 |
膜透 過性 |
水溶性 |
商品 コード |
SBA![]() |
NHSエステル | -NH2 | -Bromoacetyl | -SH | 1.5 Å | 236.0 | ― | ● | ― | c1120 |
SIA![]() |
NHSエステル | -NH2 | -Iodoacetyl | -SH | 1.5 Å | 283.0 | ― | ● | ― | c1119 |
Sulfo-SIA![]() |
Sulfo- NHSエステル |
-NH2 | -Iodoacetyl | -SH | 1.5 Å | 385.1 | ― | ― | ● | c1135 |
BMPS![]() |
NHSエステル | -NH2 | Maleimide | -SH | 5.9 Å | 266.2 | ― | ● | ― | c1122 |
SPDP![]() |
NHSエステル | -NH2 | Pyridinyldisulfide | -SH | 6.8 Å | 312.4 | Thiols | ● | ― | c1116 |
GMBS![]() |
NHSエステル | -NH2 | Maleimide | -SH | 7.3 Å | 280.2 | ― | ● | ― | c1124 |
MBS![]() |
NHSエステル | -NH2 | Maleimide | -SH | 7.3 Å | 314.3 | ― | ● | ― | c1114 |
Sulfo-MBS![]() |
Sulfo- NHSエステル |
-NH2 | Maleimide | -SH | 7.3 Å | 416.3 | ― | ― | ● | c1115 |
ANB-NOS![]() |
NHSエステル | -NH2 | Nitrophenylazide* | -NH2 | 7.7 Å | 305.2 | ― | ● | ― | c1134 |
SMCC![]() |
NHSエステル | -NH2 | Maleimide | -SH | 8.3 Å | 334.3 | ― | ● | ― | c1108 |
Sulfo-SMCC![]() |
Sulfo- NHSエステル |
-NH2 | Maleimide | -SH | 8.3 Å | 436.4 | ― | ― | ● | c1109 |
PDPH![]() |
Hydrazide | -CHO | Pyridinyldisulfide | -SH | 9.2 Å | 229.3 | Thiols | ● | ● | c1113 |
EMCS![]() |
NHSエステル | -NH2 | Maleimide | -SH | 9.4 Å | 308.3 | ― | ● | ― | c1123 |
SMPB![]() |
NHSエステル | -NH2 | Maleimide | -SH | 11.6 Å | 356.3 | ― | ● | ― | c1121 |
SMPH![]() |
NHSエステル | -NH2 | Maleimide | -SH | 14.3 Å | 379.4 | ― | ● | ― | c1112 |
LC-SPDP![]() |
NHSエステル | -NH2 | Pyridinyldisulfide | -SH | 15.7 Å | 425.5 | Thiols | ● | ― | c1117 |
Sulfo-LC-SPDP![]() |
Sulfo- NHSエステル |
-NH2 | Pyridinyldisulfide | -SH | 15.7 Å | 527.6 | Thiols | ― | ● | c1118 |
Sulfo-SANPAH![]() |
Sulfo- NHSエステル |
-NH2 | Nitrophenylazide* | -NH2 | 18.2 Å | 492.4 | ― | ― | ● | c1111 |
*:320~350 nmの光照射で活性化され、-NH2を含む種々の官能基と反応する。
※:構造式は、必ずしも左側が反応基1/右側が反応基2とはなっていません。
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ホモバイファンクショナル架橋試薬選択テーブル(スペーサー長順)
ホモバイファンクショナル(homobifunctional)架橋試薬は、架橋試薬のスペーサーアームの両端に同じ反応基を持つため、一段階で2つのタンパク質の化学的架橋が行えます。また、この試薬は、タンパク質二量体やタンパク質ポリマーの形成にも応用できます。
商品コード(cから始まる5桁の文字列)をクリックすると価格表をご覧いただけます。
クロスリンカー の略称と構造式 |
反応基 | 標的 | スペー サー長 |
M.W. | 切断 |
膜透 過性 |
水溶性 |
商品 コード |
DST![]() |
NHSエステル | -NH2 | 6.4 Å | 344.2 | Periodate | ● | ● | c1133 |
BS2G![]() |
Sulfo- NHSエステル |
-NH2 | 7.7 Å | 530.4 | ― | ― | ● | c1126 |
DSG![]() |
NHSエステル | -NH2 | 7.7 Å | 326.3 | ― | ● | ― | c1104 |
BS3![]() |
Sulfo-NHSエステル | -NH2 | 11.4 Å | 572.4 | ― | ― | ● | c1103 |
DSS![]() |
NHSエステル | -NH2 | 11.4 Å | 368.3 | ― | ● | ― | c1105 |
DSP![]() |
NHSエステル | -NH2 | 12.0 Å | 404.4 | Thiols | ● | ― | c1106 |
DTSSP![]() |
Sulfo-NHSエステル | -NH2 | 12.0 Å | 608.5 | Thiols | ― | ● | c1107 |
DSSeb![]() |
NHSエステル | -NH2 | 14.1 Å | 396.4 | ― | ● | ― | c1136 |
EGS![]() |
NHSエステル | -NH2 | 16.1 Å | 456.4 | Hydroxylamine | ● | ― | c1130 |
Sulfo-EGS![]() |
Sulfo-NHSエステル | -NH2 | 16.1 Å | 660.5 | Hydroxylamine | ― | ● | c1129 |
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ゼロ長架橋試薬選択テーブル
ゼロ長(Zero-Length)架橋試薬はスペーサーアームを持たず、直に2つのタンパク質を結合します。例えば、架橋試薬のカルボジイミド塩酸塩 (EDC-HCl) は、ペプチド合成、免疫複合体の調製、およびタンパク質架橋のために一般的に使われます。また、触媒として作用しEDC-HClカップリング効率を高めるため、N-ヒドロキシスクシンイミド (NHS) またはN-ヒドロキシスルホスクシンイミド (スルホ-NHS) と併用して日常的に使用されます。
商品コード(cから始まる5桁の文字列)をクリックすると価格表をご覧いただけます。
クロスリンカー の略称 |
標的 | スペー サー長 |
M.W. | 切断 |
膜透 過性 |
水溶性 |
商品 コード |
CDI![]() |
-NH2と-COOH | 0.0 Å | 162.2 | ― | n/a | (加水分解) | c1131 |
DCC![]() |
-NH2と-COOH | 0.0 Å | 206.3 | ― | ● | ― | c1132 |
EDC-HCl![]() |
-NH2と-COOH | 0.0 Å | 191.7 | ― | ― | ● | c1100 |
NHS![]() |
-NH2と-COOH | 0.0 Å | 115.1 | ― | ● | ― | c1101 |
Sulfo-NHS![]() |
-NH2と-COOH | 0.0 Å | 217.1 | ― | ― | ● | c1102 |
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重水素標識架橋試薬選択の選択テーブル(スペーサー長順)
ここでご紹介する重水素標識(Deuterium-labeled)架橋試薬(Deuterated Crosslinker、重水素化クロスリンカー)は、質量分析 (MS)を利用した研究用に、タンパク質やペプチドを同位体標識するための高品質な試薬で、ProteoChem社が自社製造しています。利用法としては、例えば重水素(d 4またはd 8) および軽水素 (d 0) 架橋試薬を架橋反応中に1:1の比で同時に用い、次に架橋されたタンパク質またはタンパク質複合体を質量分析に供するために消化し、得られた、同位体標識を有する架橋ペプチドは、質量スペクトルにおいて、4または8質量単位だけ異なるピークとして容易に同定されるようになります。
商品コード(hから始まる5桁の文字列)をクリックすると価格表をご覧いただけます。
クロスリンカーの略称と 構造式 |
反応基 | 標的 | スペー サー長 |
M.W. | 切断 |
膜透 過性 |
水溶性 |
商品 コード |
BS2G-d4![]() |
Sulfo-NHSエステル | -NH2 | 7.7 Å | 534.4 | ― | ― | ● | h5101 |
DSG-d4![]() |
NHSエステル | -NH2 | 7.7 Å | 330.3 | ― | ● | ― | h5103 |
BS3-d4![]() |
Sulfo-NHSエステル | -NH2 | 11.4 Å | 576.5 | ― | ― | ● | h5100 |
DSS-d4![]() |
NHSエステル | -NH2 | 11.4 Å | 372.4 | ― | ● | ― | h5102 |
DSP-d8![]() |
NHSエステル | -NH2 | 12.0 Å | 412.5 | Thiols | ● | ― | h5104 |
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