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ヒストンジメチラーゼ活性測定キット DetectX Histone Demethylase (HDM) Fluorescent Detection Kit

掲載日情報:2020/10/09 現在Webページ番号:69576

試料のヒストンジメチラーゼ活性を蛍光法により簡便かつ高感度で測定するキットです。フラビンアデニンジヌクレオチド(FAD)依存性リジン特異的デメチラーゼ1(LSD1, Lysine Specific Demethylase 1)、またはFe(II)依存性Jumonji C(JmjC)の阻害物質のスクリーニングにも最適です。

検量線例

LSD1によるホルムアルデヒドの産生

LSD1 standard curve

LSD1の検量線例

LSD1-Formaldehyde standard curve

ホルムアルデヒドの検量線例

JmjD2Aによるホルムアルデヒドの産生

JmjD2A standard curve

JmjD2Aの検量線例

JmjD2A-Formaldehyde standard curve

ホルムアルデヒドの検量線例

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阻害試験例

Tranylcypromineによる用量依存的LSD1の阻害

LSD1 standard curve

N-Oxalylglycine(NOG)による用量依存的JmjD2Aの阻害

JmjD2A inhibition by NOG
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ヒストンジメチラーゼ活性(Thiol)の測定について

ホルムアルデヒドは、タンパク質、核酸、および生物学的小分子の酸化的脱メチル化で形成される一般的な副産物です。ホルムアルデヒド生成酵素には、DNAデメチラーゼ、ヒストンデメチラーゼ(HDM)、および薬物やその他の生体異物化合物を脱メチル化するシトクロムP450酵素などが含まれています1~6。HDMは、ヒストンのメチルリジン残基の部位特異的脱メチル化を触媒し、クロマチン構造、遺伝子発現、および潜在的に他のゲノム機能を動的に調節します。

2004年にリジン特異的HDMが最初に発見され、現在最も活発に研究されているホルムアルデヒド生成酵素の1つです7。HDMには今のところフラビンアデニンジヌクレオチド(FAD)依存性リジン特異的デメチラーゼ1(LSD1, Lysine Specific Demethylase 1)ファミリーとFe(II)依存性Jumonji C(JmjC)ファミリーの2つのクラスが知られています。LSD1とJmjCHDMは、異なる補因子と触媒メカニズムを採用していますが(下図を参照)、どちらも脱メチル化反応の副産物としてホルムアルデヒドを生成します。生物学的に重要であるにもかかわらず、HDMはターンオーバー数が比較的少く定量分析が困難であるため、速度論的特性、基質特異性、および反応機構の解明が妨げられています。

LSD1によるホルムアルデヒドの産生機構

LSD1によるホルムアルデヒド生成

JmjCHDMによるホルムアルデヒドの産生機構

LSD1によるホルムアルデヒド生成

参考文献

  1. Wolfe, AP., Jones, PL., and Wade, PA., "DNA Demethylation." PNAS., 96, 15894~15896 (1999).
  2. Parta, SK., et al., "Demethylation of (Cytosine-5-C-methyl) DNA and regulation of transcription in the epigenetic pathways of cancer development.", Cancer Metastasis Rev., 27(2), 315~324 (2008).
  3. Walsky, RL. and Obach, RS., "Validated assays for human cytochrome P450 activities.", Drug Metab. Disp., 32(6), 647~660 (2004).
  4. Hollenberg, PF.,"Mechanisms of Cytochrome P450 and peroxidase-catalyzed xenobiotic metabolism.", FASEB J., 6(2), 686~694 (1992).
  5. Klose, RJ. and Zhang, Y., "Regulation of histone methylation by demethylimination and demethylation.", Nature Mol. Biol. Rev., 8, 307~318 (2007).
  6. Takeuchi, T., Watanabe, Y., Takano-Shimizu, T. and Kondo, S., "Roles of jumonji and jumonji Family Genes in Chromatin Regulation and Development.", Dev. Dynamics, 235, 2449~2459 (2006).
  7. Shi, Y., et al., "Histone demethylation Mediated by the Nuclear Amine Oxidase Homolog LSD1.", Cell, 119, 941~953 (2004).

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特長

  • 測定試料:ペプチド、生物学的バッファー(中性pH付近のトリス、リン酸、クエン酸バッファー)
  • フォーマット:2×96 well plate
  • 測定方法:蛍光
  • 測定波長:励起 450 nm/蛍光 510 nm
  • 測定範囲:3.125~200μM
  • オンラインツール(MyAssays)のテンプレートへ測定結果を入力することで、濃度計算が簡単に行えます。*

* MyAssays

MyAssays

プレートリーダーで測定した生データをコピー&ペーストし、さらにプレートにおける試料のレイアウトや実験条件、標準試料濃度や希釈率などの数値を入力することで、未知試料の濃度を迅速に求められる便利なツールです。Arbor Assays社では、それぞれのアッセイキットに対応したMyAssayを提供しています。ご利用は無料ですが、最初にメンバー登録が必要です。該当WEBページは右図をクリックして下さい。

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キット内容

  • Black half area 96 well plate
  • LSD1-type assay buffer
  • JMJD2A-type assay buffer
  • Formaldehyde standard
  • DetectX formaldehyde reagent
  • Demethylase cell lysis buffer
  • Plate sealer

測定には蛍光プレートリーダーが必要です。

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Arbor Assays社アッセイキットデモビデオ

右のバナーをクリックすると、Arbor Assays社アッセイキットを使用する上での様々なヒントを解説しているビデオをご覧いただけます。

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価格

[在庫・価格 :2024年04月24日 00時00分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
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  • 価格
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  • 法規制等
納期 文献数
HDM Fluorescent Kit (2plate)
10日程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 2
説明文
ヒストンジメチラーゼ活性測定キット。測定試料:Purified or recombinant LSD-1, Jumonji HDMs in assay buffers, HDM samples from cells lysed with provided lysis buffer,測定範囲:3.125 - 200 uM,検出方法:蛍光,励起波長:450 nm,蛍光波長:510 nm,総インキュベーション時間:varying initial reaction depending upon demethylase of interes, signal development is 30 min @ 37C,必要試料量:100 ul,測定波長:510 nm,アッセイ数:2x96 well plate,アッセイ法:Activity,測定因子:Histone Demethylase (HDM)
法規制等
保存条件 4℃,-20℃ 法規備考
掲載カタログ

製品記事 DetectX アッセイキットシリーズ(Arbor Assays社)
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HDM Fluorescent Kit (2plate)

文献数: 2

説明文 ヒストンジメチラーゼ活性測定キット。測定試料:Purified or recombinant LSD-1, Jumonji HDMs in assay buffers, HDM samples from cells lysed with provided lysis buffer,測定範囲:3.125 - 200 uM,検出方法:蛍光,励起波長:450 nm,蛍光波長:510 nm,総インキュベーション時間:varying initial reaction depending upon demethylase of interes, signal development is 30 min @ 37C,必要試料量:100 ul,測定波長:510 nm,アッセイ数:2x96 well plate,アッセイ法:Activity,測定因子:Histone Demethylase (HDM)
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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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