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ATCC®の呼吸器疾患研究用製品 ATCC® Respiratory Disease Research Materials

掲載日情報:2020/06/01 現在Webページ番号:69510

多くの感染性呼吸器疾患の症状は、非特異的であるために迅速かつ正確な検出方法を開発し続けることが不可欠です。そのため、ATCC®では、人間や動物おいてインフルエンザ、肺炎、結核、がんなどの呼吸器疾患を引き起こすことが知られている細菌、ウイルス、真菌などの様々な株や遺伝に基づく障害の研究を支援する幅広い認証済み製品を提供しています。

respiratory disease

製品の種類

下の各項目をクリックすると、詳細な製品ラインナップをご覧いただけます。

microbial strains cell lines, primary cells, stem cells nucleic acids


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分子ベースアッセイの開発と検証における課題と解決方法(要約)

分子ベースのアッセイは、臨床関連の感染因子を検出するための強力で正確な診断手段です。この新技術は、感度と特異性の向上、迅速な応答時間、多重化、再現性、扱いの困難な生物の検出能力など、従来の培養ベースのアプローチに比べて多くの利点を有しています。分子ベースアッセイには多くの利点がある一方で、パフォーマンスとデータ精度を保証するために、適切なアッセイの検証が要求されます。

新しい分子ベースのアッセイの開発と検証における主要な考慮事項の1つは、分析の特異性(標的配列と非標的配列とを区別する分析能力)と感度の評価です1。非標的生物には存在せず、特定の遺伝的標的に対し特異性を備えた高度な選択的アッセイは、排他性を有します。それに対し、交差反応を引き起こす可能性のある他の関連する生物を除外しながら、ある種における複数の系統または血清型、または属にまたがる遺伝的配列を対象とする包括的なアッセイがあります1。結果が公衆衛生に影響を与える可能性のある診断アッセイの場合、特に理想的な包括性/排他性のパラメーターを確立することがアッセイの開発と検証において重要となります。多くの場合、治療薬をタイムリーに提供するために感染性物質の迅速かつ正確な特定が重要です。そのため、新しいアッセイの精度の確保には、適切なリファレンスマテリアルを選択することが不可欠となります。

分析特異性を確立するための参考株の選定は、アプリケーションと標的に関する重要な情報に依存し、時にその作業は困難になる場合もあります。例えば、ヒトの泌尿生殖器クラミジアの症例の診断に使用されるスクリーニングアッセイの場合では、Chlamydia trachomatisの検出と同定のため、子宮頸部、尿道、膣、直腸、または尿の検体をテストする必要があります2。包括性試験では、主に泌尿生殖器から分離されたC. trachomatisの血清型(D、Da、E、F、G、Ga、H、I、J、K)のそれぞれを表す核酸を使用することが推奨されます3。それに対し、排他性アッセイは、さらに血清型を表す結膜および鼠径リンパ節(それぞれA、B、Ba、C、およびL1、L2、L2'、L2a、L2b、およびL3)、他のクラミジア種、関連する属のクラミドフィラ内の菌株、および標的生物と同じ臨床部位を共有する非関連の属をリファレンスマテリアルとして用い3,4、確立および評価のために注意深く選択される必要があります。

リファレンスマテリアルの入手準備に次いで、認証済みスタンダードを提供する信頼できる情報源が必要となります。分析特異性を評価するための調製物は、種または株までが同定されており、さらに機能的特性包括性および排他性パネルの作成のための血清型、毒素型、または薬剤耐性も同定されていることが理想的です。分析感度に関しては、リファレンススタンダードの濃度またはゲノムのコピー数が定量化されており、完全性、純度、機能的活性、および同一性を保証するために認証されていることがアッセイの検出限界を決定するうえで理想的です。。ATCC®では、リファレンスマテリアルとして用いるため、厳密な品質管理下で製造された高品質の認証済みの幅広い培養物や核酸を提供してます。また、ATCC®は、核酸の精製、定量および滴定サービス、不活性化された材料、ならびにマスターおよびワーキングセルバンク拡張などの複雑な生物学的課題の解決に向けて設計されたカスタム製品およびサービスを提供しています。

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white paper

Challenges and Solutions in the Development and Validation of Molecular-Based Assays

参考文献

  1. OIE. Validation Guideline 3.6.3., "Development and Optimisation of Nucleic Acid Detection Assays" (2014).
  2. Mishori, R., McClaskey, EL., and WinklerPrins, VJ., "Chlamydia trachomatis infections: screening, diagnosis, and management.", Am. Fam. Physician, 86, 1127~1132 (2012).
  3. Morre, SA., et al., "Urogenital Chlamydia trachomatis serovars in men and women with a symptomatic or asymptomatic infection: an association with clinical manifestations?", J. Clin. Microbiol., 38(6), 2292~2296 (2000).
  4. Somboonna, N., Mead, S., Liu, J., and Dean, D., "Discovering and differentiating new and emerging clonal populations of Chlamydia trachomatis with a novel shotgun cell culture harvest assay.", Emerg. Infect. Dis., 14(3), 445~453 (2008).

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製品ラインナップ

Microbial strains(微生物株)

microbial strains

多くの感染性呼吸器疾患の症状は非特異的であり、その迅速かつ正確な検出方法の継続的な開発が不可欠です。その支援のため、ATCC®では人間や動物に呼吸器疾患を引き起こすことが知られている細菌、ウイルス、真菌類の様々な株を提供しています。各項目をクリックすると、ATCC®ウェブサイトにて、対応する製品のリストをご覧いただけます。

Bacteria(細菌) Viruses(ウイルス) Fungi(真菌類) Microbial panels
(微生物パネル)
Respiratory disease resources(呼吸症候群関連製品)

Bronchiolitis

Bronchiolitis

Hep-2細胞(ATCC® CCL-23™)は、細気管支炎を引き起こすヒト呼吸器合胞体ウイルス(ATCC® VR-1540™)を増殖させるために使用できる。 Bronchopneumonia

Bronchopneumoni

Hep-2細胞(ATCC® CCL-23™)およびHeLa細胞(ATCC® CCL-2™)を用い、気管支肺炎を引き起こすウイルスを増殖させることができる。

Cryptococcus sp. Reference Strains

Cryptococcus sp.

実験室のスタンダードとなっているK.J. Kwon-Chungによって寄託されたコントロール株で、Cryptococcus neoformansおよびCryptococcus gattiiの8つの分子型を表わす。これらの菌株は、臨床または環境分離株の同定、および疫学研究に有益なツールとなっている。

Influenza

Influenza

ニワトリ胚および組織培養で作製した様々なソース由来の各ウイルス型。ヒト集団における主要な病気の発生は、インフルエンザウイルスA型およびB型の循環に関連している。

Laryngotracheo-bronchitis

Laryngotracheo-bronchitis

ATCC® CCL-7.1™は、喉頭気管気管支炎を引き起こすヒトParainfluenza virus 2(ATCC® VR-92™)の増殖に用いられる。

Severe Acute Respiratory Syndrome

Severe Acute Respiratory Syndrome

SARS研究用の様々な種のコロナウイルスと、それらの培養用細胞株。

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Cell lines, Primary cells, Stem cells(細胞株、初代細胞、人工多能性幹細胞)

cell lines, primary cells, stem cells

複数の種の正常組織と病変組織を代表する肺組織由来の様々な細胞株、より生物学的関連性が高い初代ヒト気道細胞とhTERT不死化細胞、嚢胞性線維症のドナーの線維芽細胞由来の人工多能性幹細胞(iPS cells)です。がん研究のほか、感染症や遺伝的素因のある呼吸器疾患の分析にも最適です。各項目をクリックすると、ATCC®ウェブサイトにて、対応する製品のリストをご覧いただけます。

Cell lines
(細胞株)
Induced pluripotent stem cells - cystic fibrosis
(幹細胞)
Lung cancer resources(肺がん関連製品)

Lung cancer cell lines

肺または複数の種の頭頸部細胞に由来する細胞株の膨大なコレクション。患者や動物から分離された腫瘍に由来する、がんの理想的なモデル。またATCC®は、CRISPR/Cas9テクノロジーを使用して同質細胞株を作製しており、EML4-ALK Fusion-A549 Isogenic Cell Lineは、親の非小細胞肺がん細胞株のA549に由来する最初の細胞株である。

Physiologically relevant controls

ATCC®は、正常なコントロールとして、初代細胞、hTERT不死化気管支上皮細胞、およびNSCLCまたはSCLC細胞と併用できる小さな気道細胞を提供している。初代細胞およびhTERT不死化細胞を使用し、3D細胞培養モデルの作製や、ex vivoin vivo環境をより適切に表すこともできる。

Lung tumor cell panels

がんおよび創薬研究に有用な、十分に特徴付けられた認証済みの細胞株とがんの体細胞変異のSanger Institute Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC)の変異データを組み合わせて作製した肺腫瘍細胞のパネル。

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Nucleic acids(核酸)

nucleic acids

ATCC®は、世界中で利用可能な細胞および微生物のゲノム、合成および認証済みリファレンスマテリアルで、最大かつ最も多様な配列を保有しています。各調製物は無菌条件下で分離または合成されており、DNAおよびRNAは完全性、純度、量、機能的活性、および同一性の保証のため、完全な認証および特徴付けがなされています。各項目をクリックすると、ATCC®ウェブサイトにて、対応する製品のリストをご覧いただけます。

Genomic nucleic acids(ゲノム核酸)

NGS-ready DNA

NGS-ready DNA

DNA抽出手順を標準化により調製したNGSのための長いフラグメントの高分子量DNA。

Bacterial Nucleic Acids

Bacterial Nucleic Acids

世界で最も多くの原生動物コレクションの中の≧18,000の株由来のゲノムDNA。

Cell Line DNA

Cell Line DNA

ATCC®の保有する高度に特徴付けられ、認証された細胞株のゲノムDNA。

Fungal and Yeast Nucleic Acids

Fungal and Yeast Nucleic Acids

コウモリの白鼻症候群の原因となる病原体であるGeomyces destructansを含む様々な真菌由来のゲノムDNA。

NIST DNA Standards

NIST DNA Standards

National Institute of Science and Technology(NIST)のバイオマーカー、法医学、父性、およびその他の品質保証手順のためのDNA標準。

Protist Nucleic Acids

Protist Nucleic Acids

約750種と340属を代表する2600系統の原生生物(265系統の藻類を含む)のゲノムDNA。

Viral Nucleic Acids

Viral Nucleic Acids

感染した細胞または尿膜腔液のウイルス由来のゲノムDNA。

Quantitative Cell Line DNA

Quantitative Cell Line DNA

ラボで開発したアッセイや市販のアッセイのコントロールに最適な次世代シーケンシングなどの検証済みの方法で定量化されたバイオマーカーが含まれたqDNA。
Synthetic nucleic acids(合成核酸)

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