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リアルタイムRT-PCR法による新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)RNAスクリーニングキット MutaPLEX Coronavirus Real Time RT-PCR Kit

掲載日情報:2021/11/30 現在Webページ番号:69282

各種生物学的試料から抽出した新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)由来のRNAをリアルタイムRT-PCR法により検出するスクリーニングアッセイキットです。


オミクロン株も検出可能!

GenBank(米国NCBI)およびEpiCov(GISAID)の公共データベースに登録されている新型コロナウイルス変異株の配列情報を、Immundiagnostik社においてin silicoで解析したところ、本製品は以下の変異株を検出可能なことが示されました。

株名 α株
(アルファ)
β株
(ベータ)
γ株
(ガンマ)
δ株
(デルタ)
ε株
(イプシロン)
Pango系統 B.1.1.7 B.1.351 P.1/B.1.1.28 B.1.617.2
および
AY.4.2
B.1.429
および
B.1.427
株名 ζ株
(ゼータ)
η株
(イータ)
θ株
(シータ)
ι株
(イオタ)
κ株
(カッパ)
Pango系統 P.2 B.1.525 P.3 B.1.526 B.1.617.1
株名 λ株
(ラムダ)
μ株
(ミュー)
ο株
(オミクロン)
Pango系統 C.37 B.1.621 B.1.1.529

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測定原理

本キットには、各種生物学的試料から抽出したSARS-CoV-2由来のRNAの増幅および同時分析用の特異的プライマーと二重標識プローブが含まれています。RNAの存在は、増幅時におけるプローブの加水分解による蛍光の増加によって検出されます。
FAMチャネルはSARS-CoV-2のRdRP(RNA-dependent RNA Polymerase)遺伝子およびS(Spike)遺伝子を、Cy5チャネルはSARS-CoV-2またはSARS-CoVのE(Envelope)遺伝子を検出します。


さらに、キットにはRNA抽出の際に試料に添加し、HEX標識プローブにより同じ反応で検出されるControl RNA(Internal Process Control、IPC)が含まれています。このControl RNAによってRT-PCR阻害の検出が可能となり、核酸が生物学的試料から分離されたことを示すコントロールとして機能します。また、キットに含まれるInternal System Control (ISC)は、生物学的試料からの溶出液中に存在するハウスキーピング遺伝子(β-アクチン、Multi-Species)を検出するためのプライマーとプローブで構成されています。これは、不適切な試料の採取法や輸送による偽陰性の結果の防止に役立ちます。β-アクチンの標的配列の増幅は、ROXチャンネルで検出します。

得られる結果

シグナル/Ct値 結果
チャンネル FAM Cy5 ROX HEX
測定対象 RdRP遺伝子/
S遺伝子
E遺伝子 ISC Control RNA
測定結果 Positive Negative Positive or Negative Positive or Negative 新型コロナウイルスのRNAを含む
Positive Positive Positive or Negative Positive or Negative 新型コロナウイルスのRNAを含む
Negative Positive Positive or Negative Positive or Negative 新型コロナウイルスまたはSARS-CoVのRNAを含む
Negative Negative Positive ≦34 新型コロナウイルスおよびSARS-CoVのRNAを含まない。
Negative Negative Negative ≦34 判定不可。試料の量または品質の不十分が考えられる。
Negative Negative Positive Negative or >34 判定不可。リアルタイムRT-PCRの阻害、RNA/DNA抽出のミスが疑われる。
Negative Negative Negative Negative or >34 リアルタイムRT-PCRの阻害、RNA/DNA抽出のミス、もしくは試料の量または品質の不十分が疑われる。

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使用例

RT-PCR1

陽性試料とポジティブコントロールではFAMチャンネルで増幅が見られるが、陰性試料とネガティブコントロールでは蛍光シグナルが検出されない(図を示していないが、Cyチャンネルも同様)。

RT-PCR2

HEXチャンネル(IPC)のシグナルは、陽性試料、陰性試料、ポジティブコントロール、ネガティブコントロールのすべてで検出される。これにより、FAMおよびCy5チャンネルでシグナルが検出されない場合でも、RT-PCRの阻害やRNAの分離の失敗によるものではなく、真のネガティブであること示される。

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新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)とは

新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)とは (クリックで開閉します)

コロナウイルス(CoV)のファミリーには、一般的な風邪の原因ウイルスや、中東呼吸器症候群(MERS-CoV)や重症急性呼吸器症候群(SARS-CoV)などのより深刻な疾患に至る病気を引き起こすウイルスが含まれています。新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)は、肺疾患CoViD-19を引き起こす新しい株です。コロナウイルスは人畜共通感染ウイルスで、動物とヒトの間で感染します。詳細な調査によって、SARS-CoVはジャコウネコからヒトに、MERS-CoVはヒトコブラクダからヒトに感染したことが判明しました。いくつかの既知のコロナウイルスは、未だにヒトに感染しておらず動物間を循環しています。

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キット内容

  • Reaction mix
  • Enzyme
  • Positive control
  • Negative control
  • Control RNA

キットにはRNA抽出・精製キットは含まれていません。測定にはリアルタイムRT-PCR装置が必要です。

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適合が確認されているリアルタイムRT-PCR装置

  • LightCycler 480Ⅱ
  • Stratagene Mx3000P/Mx3005P
  • ABI 7500
  • AriaMx
  • Bio-Rad CFX96
  • Rotor-Gene Q/3000/6000
  • Mic qPCR Cycler

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特異性

Eluates with known status FAM Cy5
RdRP遺伝子/S遺伝子 E遺伝子
新型コロナウイルス Positive Positive
SARS-CoV Negative Positive

FAM / Cy5チャンネルともにNegativeとなるウイルス、微生物種

  • MERS-CoV, HCoV-229E, HCoV-OC43
  • Influenza A H3N2/H5N1, Influenza B, Respiratory Syncytial Virus A/B, Parainfluenzavirus 1/2/3/4
  • Metapneumovirus, Adenovirus, Rhinoviruses, Enteroviruses, Human Bocavirus
  • Legionella pneumophila, Mycoplasma pneumophila, Mycobacterium tuberculosis complex
  • Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis, S. aureus, MRSA, MSSA, Streptococcus spp.

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価格

[在庫・価格 :2024年04月27日 00時00分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
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  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
Coronavirus Real time RT-PCR Kit, MutaPLEX (96reactions)
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
法規制等
保存条件 -20℃,暗所保存 法規備考
掲載カタログ ニュース2022年2月15日号 p.25
ニュース2020年11月1日号 p.28

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Coronavirus Real time RT-PCR Kit, MutaPLEX (96reactions)

文献数: 0

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掲載カタログ ニュース2022年2月15日号 p.25
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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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