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次世代シークエンスによる微生物群集構造(細菌叢)解析受託サービス
微生物解析受託サービス 次世代シークエンスによる微生物群集構造(細菌叢)解析受託サービス
掲載日情報:2020/02/26 現在Webページ番号:68933
中外テクノス株式会社では、次世代シークエンスによる微生物解析受託サービスを提供しています。
環境中に生息する微生物、腸内細菌、皮膚細菌などのDNA塩基配列を網羅的に調べることで、微生物の種類と存在比率を高感度かつ網羅的に解析します。
※ 中外テクノス株式会社の受託サービス一覧は「環境微生物解析の受託サービス」をご覧下さい。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
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特長
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実施内容
お客様は試料(環境、口腔、皮膚、糞便試料)を送付するだけ、中外テクノス株式会社で前処理を実施し、 解析後、菌叢分類リストや菌叢グラフ、解読した全配列を報告致します。
※ DNA/RNA抽出が困難な場合は別途費用を頂戴する場合があります。
※ ヒト試料の場合は匿名化など、個人情報の保護をお願い致します。
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報告内容
- 菌叢分類(門、網、目、科、属)リスト
- 分類群(門、網、目、科、属)の菌叢グラフ
- 解読した全配列、代表(OTU)全配列
■菌叢分類(門、網、目、科、属)リスト例
■分類群(門、網、目、科、属)の菌叢グラフ例
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オプションデータ解析
- 多様性解析(レアファンクション、主座標分析、α多様性、β多様性)
- BLAST解析
- 解析結果の考察、文献調査
■多様性解析例
■BLAST解析例
■解析結果の考察、文献調査
例)
- 活性汚泥、メタン発酵における運転条件、性能と主要な細菌の役割の関係性。
- バイオフィルム、金属腐食の原因調査。カビ等の発生原因。
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分析対象生物
対象生物 | 解析遺伝子領域 | 分析例 |
---|---|---|
原核生物(細菌、古細菌、ラン藻類) | 16S rRNA | 環境、環境技術 ヒトマイクロバイオーム |
真核生物(酵母、カビ、藻類) | 18S rRNA, ITS | 環境、生活環境 |
魚類*1 | 12S rRNA | 環境調査(環境DNA) |
哺乳類*2 | 12S rRNA | 環境調査(環境DNA) |
鳥類*3 | 12S rRNA | 環境調査(環境DNA) |
*1 Miya, et al., doi: 10.1098/rsos.150088;
*2 Ushio, et al., 2016. doi: 10.1111/1755-0998.12690;
*3 Ushio, et al., 2018. doi: 10.1038/s41598-018-22817-5.
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ご注文方法/価格
詳細は、下記の当社受託・特注品業務担当までお問い合わせ下さい。
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製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
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