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微生物解析受託サービス 次世代シークエンスによる微生物群集構造(細菌叢)解析受託サービス

掲載日情報:2020/02/26 現在Webページ番号:68933

中外テクノス株式会社では,次世代シークエンスによる微生物解析受託サービスを提供しています。
環境中に生息する微生物,腸内細菌,皮膚細菌などのDNA塩基配列を網羅的に調べることで,微生物の種類と存在比率を高感度かつ網羅的に解析します。

中外テクノス株式会社の受託サービス一覧は「環境微生物解析の受託サービス」をご覧下さい。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。

特長

  • 信頼性の高いIllumina社MiSeqによるペアエンドシークエンスを採用。
  • 1試料当たり3万リードを保証(5万リードを目安に取得)。
  • 真正細菌,古細菌,藻類,真核生物などを網羅的に解析。
  • 存在比率0.01~0.1%の微生物が検出可能。
  • 菌叢分類(97% OTU)
Illumina社MiSeq

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実施内容

お客様は試料(環境,口腔,皮膚,糞便試料)を送付するだけ,中外テクノス株式会社で前処理を実施し, 解析後,菌叢分類リストや菌叢グラフ,解読した全配列を報告致します。

DNA/RNA抽出が困難な場合は別途費用を頂戴する場合があります。
ヒト試料の場合は匿名化など,個人情報の保護をお願い致します。

微生物群集構造解析の実施内容

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報告内容

  • 菌叢分類(門,網,目,科,属)リスト
  • 分類群(門,網,目,科,属)の菌叢グラフ
  • 解読した全配列,代表(OTU)全配列

■菌叢分類(門,網,目,科,属)リスト例

菌叢分類リスト例

■分類群(門,網,目,科,属)の菌叢グラフ例

分類群円グラフ例 分類群グラフ例

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オプションデータ解析

  • 多様性解析(レアファンクション,主座標分析,α多様性,β多様性)
  • BLAST解析
  • 解析結果の考察,文献調査

■多様性解析例

多様性解析例

■BLAST解析例

BLAST解析例

■解析結果の考察,文献調査

例)

  • 活性汚泥,メタン発酵における運転条件,性能と主要な細菌の役割の関係性。
  • バイオフィルム,金属腐食の原因調査。カビ等の発生原因。

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分析対象生物

対象生物 解析遺伝子領域 分析例
原核生物(細菌,古細菌,ラン藻類) 16S rRNA 環境,環境技術
ヒトマイクロバイオーム
真核生物(酵母,カビ,藻類) 18S rRNA, ITS 環境,生活環境
魚類*1 12S rRNA 環境調査(環境DNA)
哺乳類*2 12S rRNA 環境調査(環境DNA)
鳥類*3 12S rRNA 環境調査(環境DNA)

*1 Miya, et al., doi: 10.1098/rsos.150088;
*2 Ushio, et al., 2016. doi: 10.1111/1755-0998.12690;
*3 Ushio, et al., 2018. doi: 10.1038/s41598-018-22817-5.

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ご注文方法/価格

詳細は,下記の当社受託・特注品業務担当までお問い合わせ下さい。


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