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CRISPR-Cas9スクリーニングライブラリー CRISPR-Cas9 Screening Library

掲載日情報:2020/05/12 現在Webページ番号:68927

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guide RNAによるゲノム編集ツール CRISPR-Cas9特集

プール化(pooled)sgRNAまたはアレイ化(arrayed)crRNAによってハイスループットゲノム編集実験が可能となります。
アレイ化(arrayed)crRNAは,マルチパラメーターの表現型解析,ハイコンテント表現型解析や形態学的またはレポーターアッセイなどを含むシングルウェルで行う様々な表現型アッセイを可能にします。

機能喪失スクリーニングは,遺伝子機能および相互作用を発見するための強力な前向き遺伝的アプローチです。多数のターゲット遺伝子に対応した多種類のsgRNA発現用レンチウイルス粒子を混合したプール化sgRNAライブラリーは,DNAレベルで数百,数千の遺伝子をノックアウトする機能喪失スクリーニングを,NGSを用いることによって大規模なインフラを必要とせずに簡素化しました。

本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
Horizon|Dharmacon製品をご注文いただくには,事前にユーザー登録が必要です。ご注文方法の詳細はこちらをご覧下さい。

導入事例

  • 比較的短時間で簡便な創薬ターゲット探索を⽬的
      ⇒ Edit-R Pooled Lentiviral sgRNA Library
  • 様々なアッセイ系を用いた遺伝⼦機能の網羅的解析を⽬的
      ⇒ Edit-R Synthetic sgRNA Library,Edit-R CRISPR (knockout) crRNA Library
  • 複数の候補遺伝子が決定しており、小容量でのスクリーニングを目的
      ⇒ Cherry-Pick Synthetic sgRNA Library,Cherry-Pick CRISPR (knockout) crRNA Library

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選択ガイド

製品名 Edit-R synthetic sgRNA Library
Cherry-Pick synthetic sgRNA Library
Edit-R CRISPR (knockout) crRNA Library
Cherry-Pick CRISPR (knockout) crRNA Library
Edit-R Arrayed Lentiviral sgRNA Library
Cherry-Pick CRISPR (Knockout) Lentiviral sgRNA Library
Edit-R Pooled Lentiviral sgRNA Library
製品形態 化学合成sgRNA あるいはcrRNAをマルチウェルプレートに分注して凍結乾燥 sgRNA発現用レンチウイルスベクターを導入した大腸菌の培養液にグリセロールを加えたものをマルチウェルプレートに分注 sgRNA発現用レンチウイルス粒子プールをマイクロチューブに分注
細胞への導入方法 トランスフェクション試薬またはエレクトロポレーション法 トランスフェクション試薬またはエレクトロポレーション法またはレンチウイルスで導入(レンチウイルスにパッケージングした場合) レンチウイルスで導入
アッセイ方法 1遺伝子1ウェルのレイアウトのため,様々な表現型を測定可能(表現型の観察に十分な ゲノム編集効率を得る必要あり)
・High Content Analysis,レポーター,酵素活性解析など
1遺伝子1ウェルのレイアウトのため,様々な表現型を測定可能(表現型の観察に十分な ゲノム編集効率を得る必要あり)
・High Content Analysis,レポーター,酵素活性解析など
sgRNAを保有する細胞のポピュレーション変化を次世代シーケンサーで測定
・細胞死または生存率
・セルソーターによって選択可能 (蛍光または細胞表面マーカーの発現が必要)
スクリーニング実施時間 遺伝子の数が増えるにつれ時間と手間がかかる 遺伝子の数が増えるにつれ時間と手間がかかる
sgRNA発現用レンチウイルスベクターの大腸菌からの精製が必要
相対的に短時間,少数の培養器で実験可能
データ解析 表現型は1遺伝子1ウェルベースで直接解析可能 表現型は1遺伝子1ウェルベースで直接解析可能 次世代シーケンサーから出るデータの解析が必要


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特長

■豊富な組み合わせ済みライブラリーとカスタムライブラリー

遺伝子ファミリー全体,Druggable,または生物学的パスウェイ研究用の組み合わせ済ライブラリーをご用意しています。カスタムライブラリーはCherry-Pick Library Toolで遺伝子名やリストをアップロードすることにより簡単にライブラリーを作製し,オーダーすることができます。

■遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いCRISPR-Cas9ライブラリー

アレイ化およびプール化ライブラリーはいずれも,Horizonのアルゴリズム(Edit-R algorithm)による遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いデザイン済みガイドRNAでライブラリー化されています。

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Edit-R Synthetic sgRNA (化学合成sgRNA)ライブラリー

(クリックで開閉します)
  • シングルガイドフォーマットで,複雑でゲノム編集が難しい細胞タイプに適しています。
  • デザインアルゴリズムは,タンパク質の機能的なノックアウトの可能性を最大化すると同時に,厳密な特異性チェックによりオフターゲット編集を最小限に抑えます。ヌクレアーゼ耐性を改善するために化学修飾がされています。
  • 信頼性の高い表現型解析のために,遺伝子ごとに3つのユニークなsgRNAデザインがプールされています。
  • 遺伝子ファミリーコレクションが,96または384ウェルプレートで提供されます。
  • 包装容量は0.1,0.25,0.5,1.0 nmol から選択可能です。
  • 製品形態は凍結乾燥品です。

品名をクリックするとHorizon Discovery社のご注文WEBサイトをご覧いただけます。

Edit-R Synthetic sgRNA Library
Human sgRNA Libraries 遺伝子数*1 0.1 nmol library 0.25 nmol library 0.5 nmol library 1.0 nmol library
Whole Genome 19,037 GA-005000-01 GA-005000-025 GA-005000-05 GA-005000-10
Druggable Genome*2 8,340 GA-004600-01 GA-004600-025 GA-004600-05 GA-004600-10
GPCRs 390 GA-003600-01 GA-003600-025 GA-003600-05 GA-003600-10
Ion Channels 417 GA-003800-01 GA-003800-025 GA-003800-05 GA-003800-10
Phosphatases 256 GA-003700-01 GA-003700-025 GA-003700-05 GA-003700-10
Proteases 527 GA-005100-01 GA-005100-025 GA-005100-05 GA-005100-10
Protein Kinases 746 GA-003500-01 GA-003500-025 GA-003500-05 GA-003500-10
Ubiquitin Enzymes 738 GA-006200-01 GA-006200-025 GA-006200-05 GA-006200-10
Transcription Factors 1,580 GA-005800-01 GA-005800-025 GA-005800-05 GA-005800-10
Drug Targets 3,686 GA-004650-01 GA-004650-025 GA-004650-05 GA-004650-10

*1 参照するデータベースにより予告なく変更になる場合があります。
*2 Proteases,Protein Kinases,Phosphatases,Transcription Factors,Ubiquitin Enzymes,GPCRs,Ion Channels,Drug Target各ライブラリーをセットとした製品です。



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Cherry-Pick Synthetic sgRNA Library

(クリックで開閉します)

お客様が選択した遺伝子に対するデザイン済みEdit-R Synthetic sgRNA (化学合成sgRNA)を,96あるいは384ウェルプレートに分注してお届けするサービスです。

  • Cherry-pick library toolは,お客様独自の実験ニーズに合わせてフレキシブルにライブラリーを構築し,プレートレイアウトをカスタマイズできます。
  • ご希望のウェルにコントロールを追加できます。
  • 遺伝子あたり3種類のデザイン済みSynthetic sgRNAを混合したPoolフォーマットと,1配列毎に分注したIndividualフォーマットがあります。Individualフォーマットは1遺伝子につき1~3配列から選択できます。
  • 最低注文数:20ウェル分の製品(96ウェルプレートの場合),40ウェル分の製品(384ウェルプレートの場合)
  • 製品形態は凍結乾燥品です。
製品 動物種 包装
Pool: Edit-R synthetic sgRNA Cherry-pick Library
(3配列の混合物/ウェル)
Human 0.1, 0.25, 0.5, 1.0 nmol
(1 poolあたり)
Individual: Edit-R synthetic sgRNA Cherry-pick Library
(1配列/ウェル)
0.1, 0.25, 0.5, 1.0 nmol
(1 配列あたり)


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Edit-R CRISPR (knockout) crRNA Library

(クリックで開閉します)

より堅牢で信頼性の高い遺伝子ノックアウトのために,Edit-R algorithmによる遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) crRNA(化学合成品)から選択されています。アレイ化ライブラリーフォーマットは,ハイコンテント表現型解析や形態学的またはレポーターアッセイなど,シングルウェルで行う様々な表現型アッセイを可能にします。

  • ヒト・マウス用のデザイン済みcrRNAを,遺伝子ファミリーやパスウェイごとに分類して96あるいは384ウェルプレートに分注した製品です。
  • 遺伝子あたり4種類のデザイン済みcrRNAを混合したPoolフォーマットと,4種類をセットにしたSet of 4フォーマットをご用意しています。
  • 包装容量は0.1,0.25,0.5 nmol
  • 製品形態は凍結乾燥品です。

品名をクリックするとHorizon Discovery社のご注文WEBサイトをご覧いただけます。

Human Edit-R Human crRNA Library
Human crRNA Library 遺伝子数*3 Poolフォーマット Set of 4フォーマット
Cell Cycle Regulation169GP-003205-xxGC-003205-xx
Cytokine Receptors110GP-004005-xxGC-004005-xx
Deubiquitinating Enzymes94GP-004705-xxGC-004705-xx
DNA Damage Response240GP-006005-xxGC-006005-xx
Drug Targets3,686GP-004650-xxGC-004650-xx
Druggable Genome*38,422GP-004605-xxGC-004605-xx
Epigenetics835GP-006105-xxGC-006105-xx
G Protein-coupled Receptors390GP-003605-xxGC-003605-xx
Genome19,127GP-005005-xxGC-005005-xx
Ion channels417GP-003805-xxGC-003805-xx
Membrane Trafficking140GP-005505-xxGC-005505-xx
Nuclear Receptors52GP-003405-xxGC-003405-xx
Phosphatases248GP-003705-xxGC-003705-xx
Proteases527GPGC-005105-xxGC-005105-xx
Protein Kinases746GP-003505-xxGC-003505-xx
Transcription Factors1,580GP-005805-xxGC-005805-xx
Tyrosine Kinases90GP-003105-xxGC-003105-xx
Ubiquitin Enzymes738GP-006205-xxGC-006205-xx
Mouse crRNA Libraries 遺伝子数*1 Poolフォーマット Set of 4フォーマット
Cell Cycle Regulation105GP-013200-xxGC-013200-xx
Cytokine Receptors139GP-014000-xxGC-014000-xx
Deubiquitinating Enzymes100GP-014700-xxGC-014700-xx
Epigenetics724GP-016100-xxGC-016100-xx
G Protein-coupled Receptors515GP-013600-xxGC-013600-xx
Ion Channels340GP-013800-xxGC-013800-xx
Membrane Trafficking113GP-015505-xxGC-015505-xx
Nuclear Receptors46GP-013400-xxGC-013400-xx
Phosphatases273GP-013700-xxGC-013700-xx
Proteases599GP-015100-xxGC-015100-xx
Protein Kinases774GP-013500-xxGC-013500-xx
Transcription Factors1,419GP-015800-xxGC-015800-xx
Tyrosine Kinases92GP-013105-xxGC-013105-xx
Ubiquitin Enzymes752GP-016200-xxGC-016200-xx

*3 参照するデータベースにより予告なく変更になる場合があります。
*4 Proteases,Protein Kinases,Phosphatases,Transcription Factors,Ubiquitin Enzymes,GPCRs,Ion Channels,Drug Target各ライブラリーをセットとした製品です。



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Cherry-Pick CRISPR (knockout) crRNA Library

(クリックで開閉します)

お客様が選択した遺伝子に対するデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) crRNAを,96あるいは384ウェルプレートに分注してお届けするサービスです。

  • Cherry-pick library toolは,お客様独自の実験ニーズに合わせてフレキシブルにライブラリーを構築し,プレートレイアウトをカスタマイズできます。
  • ご希望のウェルにコントロールを追加できます。
  • 遺伝子あたり4種類のデザイン済みcrRNAを混合したPoolフォーマットと,1配列毎に分注したIndividualフォーマットがあります。Individualフォーマットは1遺伝子につき1~5配列から選択できます。
  • 最低注文数:20ウェル分の製品(96ウェルプレートの場合),40ウェル分の製品(384ウェルプレートの場合)
  • 製品形態は凍結乾燥品です。
製品 動物種 包装
Pool: Edit-R CRISPR (knockout) crRNA Cherry-pick Library
(4配列の混合物/ウェル)
Human, Mouse 0.1, 0.25, 0.5, 1.0, 2.0 nmol
(1 poolあたり)
Individual: Edit-R CRISPR (knockout) crRNA Cherry-pick Library
(1配列/ウェル)
0.1, 0.25, 0.5, 1.0, 2.0 nmol
(1 配列あたり)


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Edit-R Arrayed Lentiviral sgRNA Library

(クリックで開閉します)
  • Edit-R algorithmによる遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) sgRNAから選択されています。
  • デザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNAベクターを導入した大腸菌の培養液にグリセロールを加えた溶液を,遺伝子ファミリーやパスウェイごとに分類して96ウェルプレートに分注した製品です。
  • 遺伝子あたり4種類のデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNAをご用意しています。
  • ヒト用のみです。

品名をクリックするとHorizon Discovery社のご注文WEBサイトをご覧いただけます。

Edit-R Arrayed Lentiviral sgRNA Library
Human sgRNA Libraries - arrayed glycerol stocks 遺伝子数*4 商品コード
Druggable Genome*57,826GSGH11761
Drug Targets3,737GSGH11848
G Protein-coupled Receptors381GSGH11763
Ion channels348GSGH11764
Phosphatases253GSGH11767
Proteases478GSGH11768
Protein Kinases698GSGH11769
Transcription Factors1,507GSGH11855
Ubiquitin Conjugation583GSGH11772

*4 参照するデータベースにより予告なく変更になる場合があります。
*5 Proteases,Protein Kinases,Phosphatases,Transcription Factors,Ubiquitin Enzymes,GPCRs,Ion Channels,Drug Target各ライブラリーをセットとした製品です。



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Cherry-Pick CRISPR (knockout) sgRNA Library

(クリックで開閉します)

お客様が選択した遺伝子に対するデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNAベクター導入した大腸菌の培養液にグリセロールを加えた溶液を,96ウェルプレートに分注してお届けするサービスです。

  • Cherry-pick library toolは,お客様独自の実験ニーズに合わせてフレキシブルにライブラリーを構築し,プレートレイアウトをカスタマイズできます。
  • ご希望のウェルにコントロールを追加できます。
  • 最低注文数:20ウェル分の製品
  • 製品形態は凍結乾燥品です。
製品 動物種 包装
Edit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNA Cherry-pick Library Human, Mouse glycerol Stock


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Edit-R Pooled Lentiviral sgRNA Library

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Edit-R algorithmによる遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNAから選択されています。多数のターゲット遺伝子に対応した多種類のsgRNA発現用レンチウイルス粒子を混合したプール化sgRNAライブラリーは,DNAレベルで数百,数千の遺伝子をノックアウトする機能喪失スクリーニングを,NGSを用いることによって大規模なインフラを必要とせずに簡素化することができます。

  • ヒト,マウス,ラットの各ゲノムにわたる遺伝子あたり5~10のsgRNAを幅広く網羅し,ヒットの信頼性と包括的なゲノムスクリーニングを向上します。
  • 使用する細胞に最適なEdit-RレンチウイルスCas9ヌクレアーゼ試薬と組み合わせて使用します。
  • 製品形態はレンチウイルス粒子です。

■納品物

  • 分注済みの5×108 TU/ml(±20%)のレンチウイルス粒子
  • 8×25μl(合計200μl):5,000コンストラクト以下のライブラリーの場合
  • 16×25μl(合計400μl):5,000コンストラクト以上のライブラリーの場合
  • NCBI参照配列データベースの遺伝子を標的とする遺伝子あたり5~10個のsgRNA
  • ヒト,マウスおよびラットのゲノム中のいかなる遺伝子もターゲットとしないことが生物情報学的に確認された100個のnon-targeting sgRNAネガティブコントロール。
  • 最大34のタンパク質をコードする遺伝子(1遺伝子あたり10 sgRNA)を標的とする,最大340の遺伝子特異的sgRNAポジティブコントロール。共通のリファレンス遺伝子(ACTB,GAPDH,LAMB1,およびPPIB)を含みます。
  • 遺伝子アノテーション,sgRNAターゲット配列,コントロールのリストなどのライブラリー情報を含むデータファイル

■検証済みのプロトコルのために推奨される必要な試薬

  • 形質導入最適化のためのベクター対応Edit-R Lentiviral sgRNA Non-targeting Control
  • それぞれ12種類のユニークなインデックスプライマーを含み,以下のために最適化されているEdit-R Pooled sgRNA Indexing PCR and Sequencing Primer Kit A/B
    • ゲノムDNAを鋳型としたsgRNA配列のPCR増幅。
    • ヒット識別のためのIlluminaフローセルを用いるハイスループット&マルチプレックス次世代DNAシーケンス。

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Edit-R Pooled Lentiviral sgRNA Library
製品 ヒト
遺伝子数*6
商品コード
Whole Genome18,525VSGH11113
Druggable Genome*77,359VSGH11112
GPCR378VSGH11106
Ion Channels345VSGH11108
Protein Kinases700VSGH11105
Phosphatases247VSGH11107
Proteases473VSGH11109
Ubiquitin Conjugation564VSGH11110
Apoptosis**VSGH11126
Cell Cycle Regulation**VSGH11123
De-ubiquitinating Enzymes**VSGH11121
Membrane Trafficking**VSGH11119
DNA Damage Response**VSGH11114
Epigenetics**VSGH11230
Nuclear Receptor**VSGH11125
Cytokine Receptors**VSGH11117
Serine Proteases**VSGH11120
Tyrosine Kinases**VSGH11124
製品 マウス
遺伝子数*6
商品コード
Whole Genome19,683VSGM11135
Druggable Genome*79,827VSGM11134
GPCR498VSGM11128
Ion Channels340VSGM11130
Protein Kinases708VSGM11127
Phosphatases269VSGM11129
Proteases533VSGM11131
Ubiquitin Conjugation517VSGM11132
Apoptosis**VSGM11148
Cell Cycle Regulation**VSGM11145
De-ubiquitinating Enzymes**VSGM11143
Membrane Trafficking**VSGM11141
Epigenetics**VSGM11137
Nuclear Receptor**VSGM11147
Cytokine Receptors**VSGM11139
Serine Proteases**VSGM11142
Tyrosine Kinases**VSGM11146

*6 参照するデータベースにより予告なく変更になる場合があります。
*7 Proteases,Protein Kinases,Phosphatases,Transcription Factors,Ubiquitin Enzymes,GPCRs,Ion Channels,Drug Target各ライブラリーをセットとした製品です。
** 当社Dharmacon製品担当までお問い合わせ下さい。

品名をクリックするとHorizon Discovery社のご注文WEBサイトを,品名をクリックすると製品の詳細をご覧いただけます。

製品 商品コード
Edit-R Pooled sgRNA Indexing PCR and Sequencing Primer Kit A PRM10184
Edit-R Pooled sgRNA Indexing PCR and Sequencing Primer Kit B PRM10185


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ご注文方法

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Internet Explorer では製品検索・ご注文の際の一部の機能が正常に作動しない場合があります。

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製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。