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トップクラスの特異性、検出感度を実現! miRNA検出・定量試薬ID3EALシリーズ

掲載日情報:2023/05/11 現在Webページ番号:68276

MiRXES社では独自のID3EAL(アイディール)テクノロジーによって、RT-qPCRによる高感度かつ高精度なmiRNAの検出・定量を行う製品をラインナップしています。相同性の高いmiRNA配列の判別や微量試料の検出に極めて優れたパフォーマンスを示します。
ID3EALテクノロジーを用いてお客様の試料に含まれるmiRNAのプロファイリング解析を行う受託サービスについてはこちらをご覧下さい。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


miRNAの検出・定量におけるRT-qPCR法の問題点

マイクロRNA(miRNA)は22塩基程度(成熟型の場合)からなる微小なRNAです。miRNAと相補的な配列を含む標的メッセンジャーRNA(mRNA)と結合し、mRNAの分解を引き起こすことで標的遺伝子の発現を抑制します。このようにmiRNAは遺伝子発現調節過程において重要な役割を果たしており、miRNAを定量的に検出することは遺伝子機能の理解に不可欠です。

miRNAを定量的に検出する手法としてはRT-qPCR法が広く用いられています。miRNAには互いに1塩基程度の違いしかないような非常に相同性の高いものが複数存在するため、高精度な定量を行うにはこれらの類似したmiRNA を正確に識別することが必要です。しかし、miRNAは通常のmRNAと比較して非常にサイズが小さく、個々のmiRNAに特異的なプライマーを設計することは困難でした。


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製品の原理

RT-qPCR法によるmiRNAの検出は、逆転写によるcDNAの合成とその後のqPCRによる検出の2段階の反応を経て行われます。これらの反応のうち、逆転写には逆転写用のRTプライマー1種類、qPCR検出にはForwardとReverseの2種類のプライマーが必要となります。これら合計3つのプライマーのうち、既存手法では1つまたは2つのユニバーサルプライマー(すべての標的miRNAに共通のプライマー)が使われています。一方でMiRXES社のID3EALテクノロジーでは、ステムループ構造も特異的な設計を施した、成熟型miRNAのみに特異的なRTプライマーを用いており、qPCR用のプライマー2つも標的miRNA特異的に設計することで、既存手法よりも優れた検出特異性と検出感度を実現しています。また、MiRXES社の製品は主要メーカーのほとんどのqPCR装置に対応し、幅広いニーズに応えることが可能です。

ID3EALテクノロジーの原理

ID3EALテクノロジーの原理

各社製品で使用されているプライマーの特異性の比較
MiRXES社のID3EALテクノロジーでは、RTプライマー、
qPCRのForward / Reverseプライマーのすべてで
miRNAに特異的なプライマーが設計されています。

メーカーRT
プライマー
qPCR Forward
プライマー
qPCR Reverse
プライマー
ID3EAL
(MiRXES社)
SpecificSpecificSpecific
A社SpecificSpecificUniversal
B社UniversalSpecificSpecific
C社UniversalSpecificUniversal

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特長

特長1:極めて高い検出特異性

ID3EALテクノロジーはmiRNA定量において重要となる、相同性の高いmiRNA間の識別においても極めて高い精度を実現しています。下図のlet-7 miRNAファミリーを用いた特異性の検討例では、各アイソフォームは1塩基程度の差しかない高い相同性を有するにもかかわらず、明確に識別することができました。

let7ファミリーそれぞれの相対的検出率

let7ファミリーそれぞれに対応するqPCR用プライマーペアを用いた場合の相対的検出率
let-7ファミリーの各アイソフォームcDNAをテンプレートとし、let7ファミリーそれぞれに対応するプライマーペアを用いてqPCRを行った。相対的検出率はプライマーペアごとに得られたCt値の差から計算している。


特長2:優れた検出感度と増幅効率

ID3EALテクノロジーでは既存製品と比較して、高い増幅効率を実現し微量なmiRNAを検出することが可能です。また、通常は増幅が難しいとされるAT含有率の高いmiRNAでも他社製品に比べて高効率に検出できます。

他社競合品との増幅効率の比較

他社競合品との増幅効率の比較

miRNA名%ATID3EAL
(MiRXES社)
A社B社C社
hsa-miR-27a-5p45%12.616.518.1N/A
hsa-miR-500a-5p52%12.516.319.815.8
hsa-miR-30e35p55%13.114.817.814.5
hsa-miR-215-5p62%12.816.019.515.6
hsa-miR-32-3p73%13.021.121.2N/A

値はCt値


特長3:高い再現性

ID3EALテクノロジーは高い再現性も実現しています。異なる2つの研究室で、1年以上の期間中に30人のがん患者由来の血清中に含まれる200種の標的miRNAを解析した例では、相関係数0.92~0.96という非常に高い再現性が得られました。

2つの実験における再現性

独立した2つの実験における測定結果の再現性
X軸は手作業でのRNA単離とBio-Rad CFX-384を用いたqPCRによって得られた測定結果を示しています。Y軸は自動でのRNA単離とLifeTech ViiA7によるqPCRでの測定結果を示しています。グラフ上には測定した200種類の標的miRNAすべてがプロットされています。


特長4:シンプルで迅速なワークフロー

他社の一般的な製品ではmiRNAの逆転写からqPCRによる検出まで3時間程度必要ですが、ID3EALシステムでは高速な反応によってcDNAの合成からqPCRの結果を得るまでが2時間で完了し、スピーディーなmiRNAの検出が可能です。

ID3EALシステムによるmiRNA検出の流れ

ID3EALシステムによるmiRNA検出の流れ


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製品ラインナップ

ID3EALシステムは正確なmiRNA検出を行うのに必要な試薬類をすべて網羅しています。すべてのプライマーおよびアッセイ系は独自開発のアルゴリズムによって最適化され、カタログ品、特注品のどちらも出荷前に合成miRNAテンプレートおよび生体試料から得たRNAを使った実証実験で有効性を確認しています。

表中の項目名をクリックすると、該当箇所にページ内ジャンプします。

ステップ 逆転写 qPCR
専用試薬 cDNA Synthesis System qPCR Master Mix*1
Spike-in Control RNA
プライマー単独製品 RTプライマー*2(カタログ品、特注品) qPCR用プライマーペア*3(カタログ品、特注品)
パネル製品*1 特定の疾患などに関連するmiRNAを網羅的に検出できる製品。
キット内容:マルチプレックスRTプライマー、Spike-in Control RNA、qPCR用プライマーペアをコート済みのプレート、cDNA Synthesis System、qPCR用酵素・バッファー*4

*1 ご使用のqPCR装置に対応した製品をお選び下さい。
*2 cDNA Synthesis Systemが別途必要です。
*3 qPCR Master Mixが別途必要です。
*4 cDNA Synthesis SystemおよびqPCR Master Mixを別途ご用意いただく製品もあります。


RTプライマー

独自の特異的ステムループ構造をもつRTプライマーによって成熟型miRNA特異的に逆転写を行います。miRXES社では大規模データベースmiRBaseに登録されたヒトやマウスをはじめとする様々な生物種のmiRNA約35,000種に対応するプライマーをラインナップしています。
逆転写反応にはcDNA Synthesis Systemが別途必要です。

RTプライマー(ヒト用、およびマウス用の一部)

標的miRNAのリスト中の、シート「All human & selected mouse」に掲載されているmiRNA用のRTプライマーの包装・価格は以下のとおりになります。
下記表中の-xxxx部分については、標的miRNAのリストをご確認下さい。

商品名メーカー商品コード包装価格
ID3EAL Individual miRNA RT Primer 1-plex MRX 1103113-xxxx 60 tests ¥18,900

RTプライマー(マウス用の一部、および各種生物用)

標的miRNAのリスト中の、シート「non-human and mouse」に掲載されているmiRNA用のRTプライマーの包装・価格は以下のとおりになります。
下記表中の-xxxx部分については、標的miRNAのリストをご確認下さい。

商品名メーカー商品コード包装価格
ID3EAL Customized Individual miRNA RT Primer 1-plex
- For non-human and mouse miRNA
MRX 1106104-xxxx 500 tests ¥36,000

RTプライマー(特注品)

上記のカタログ品RTプライマーを混合し、一度に複数の標的を逆転写できるマルチプレックスRTプライマー(例えば24種、48種、または96種の混合品)を特注品として作製します。
また、カタログ品RTプライマーが無いmiRNA用のRTプライマーの設計・製造も行います。
RTプライマー(特注品)のご注文・お問い合わせ先:受託・特注品担当
MAIL:jutaku@funakoshi.co.jp


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qPCR用プライマーペア

標的miRNAに特異的なForwardプライマーとReverseプライマーのペアです。
qPCR反応にはqPCR Master Mixが別途必要です。

qPCR用プライマーペア(ヒト用、およびマウス用の一部)

標的miRNAのリスト中の、シート「All human & selected mouse」に掲載されているmiRNA用のqPCR用プライマーペアの包装・価格は以下のとおりになります。
下記表中の-xxxx部分については、標的miRNAのリストをご確認下さい。

商品名メーカー商品コード包装価格
ID3EAL Individual miRNA qPCR Assay MRX 1104101-xxxx 100 tests ¥23,400

qPCR用プライマーペア(マウス用の一部、および各種生物用)

標的miRNAのリスト中の、シート「non-human and mouse」に掲載されているmiRNA用のqPCR用プライマーペアの包装・価格は以下のとおりになります。
下記表中の-xxxx部分については、標的miRNAのリストをご確認下さい。

商品名メーカー商品コード包装価格
ID3EAL Customized Individual miRNA qPCR Assay
- For non-human and mouse miRNA
MRX 1106173-xxxx 500 tests ¥48,600

qPCR用プライマーペア(特注品)

RTプライマーと同様に、カタログ品qPCR用プライマーペアが無いmiRNA用のqPCR用プライマーペアの設計・製造を行います。
qPCR用プライマーペア(特注品)のご注文・お問い合わせ先:受託・特注品担当
MAIL:jutaku@funakoshi.co.jp


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パネル製品

特定の疾患などに関連するmiRNAを網羅的に検出するための製品です。製品は、対象のmiRNAに対応した逆転写用マルチプレックスRTプライマー、Spike-in Control RNA、qPCR用プライマーペアをコート済みの96 wellまたは384 wellプレート(PanoramiRパネルは384 wellプレートのみ)のセットになっています。
これらのパネルを用いてお客様の試料に含まれるmiRNAのプロファイリング解析を行う受託サービスについてはこちらをご覧下さい。

パネル製品のキット内容

  • マルチプレックスRTプライマー
  • Spike-in control RNA
  • qPCR用プライマーペアをコート済みのプレート
  • cDNA Synthesis System*4
  • qPCR用酵素・バッファー*4

*4 cDNA Synthesis SystemおよびqPCR Master Mixを別途ご用意いただく製品もあります。


PanoramiRパネル(cDNA Synthesis System・qPCR Master Mixを含む)

複数疾患に関連する標的miRNA 376種類を厳選したパネルです。標的miRNAは、miRBase 22, HMDD v3.2, The Cancer Genome Atlasから厳選し、独自研究データおよび学術論文による検討を重ねて選択しています。標的miRNAリストはこちらをご覧下さい。
本製品に含まれるqPCR用プライマーペアをコート済みの384 wellプレートは、現時点ではApplied Biosystems装置(Thermo Fisher Scientific社)対応の製品のみとなっています。他社装置への対応については、お問合せ下さい。

[在庫・価格 :2024年04月27日 00時00分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
ID3EAL PanoramiR miRNA Knowledge Panel
ご照会下さい ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2023年7月15日号 p.27

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[在庫・価格 :2024年04月27日 00時00分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。

ID3EAL PanoramiR miRNA Knowledge Panel

文献数: 0

説明文
法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2023年7月15日号 p.27

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Cancerパネル

がんに関連する標的miRNA 352種類を厳選し、A~Dのパネルにまとめた製品です。標的miRNAリストはこちらをご覧下さい。
ご使用のqPCR装置に対応した製品をお選び下さい。
表中の商品コードをクリックすると、価格表をご覧になれます。

ID3EAL Cancer miRNA Knowledge Panel, Panel A-D, 384 Targets(cDNA Synthesis System・qPCR Master Mixを含む)
プレート
の種類
包装 対応したqPCR装置
Bio-Rad ABI Fast Block ABI Standard Block
Normal ROX Hi-ROX Normal ROX Hi-ROX Normal ROX Hi-ROX
96 well
plate
12 tests FGS0085R FGS0093R FGS0086R FGS0094R FGS0087R FGS0095R
24 tests FGS0088R FGS0096R FGS0089R FGS0097R FGS0090R FGS0098R
384 well
plate
12 tests FGS0091R FGS0099R
24 tests FGS0092R FGS0100R

ID3EAL Cancer miRNA Knowledge Panel, Panel A-D, 384 Targets(cDNA Synthesis System・qPCR Master Mixを含まない)
プレート
の種類
包装 対応したqPCR装置
Bio-Rad ABI Fast Block ABI Standard Block
96 well
plate
12 tests 1105263-HSA04110ABI 1105263-HSA04110AFA 1105263-HSA04110AST
24 tests 1105264-HSA04110ABI 1105264-HSA04110AFA 1105264-HSA04110AST
384 well
plate
12 tests 1105363-HSA04110ABI 1105363-HSA04110AFA
24 tests 1105364-HSA04110ABI 1105364-HSA04110AFA

Biofluidパネル

20,000を超えるヒト血清、血漿、尿試料を用いた独自研究から、標的miRNA 176種類を厳選し、A~Bのパネルにまとめた製品です。標的miRNAリストはこちらをご覧下さい。
ご使用のqPCR装置に対応した製品をお選び下さい。
表中の商品コードをクリックすると、価格表をご覧になれます。

ID3EAL Biofluid miRNA Knowledge Panel, Panel A-B, 192 Targets(cDNA Synthesis System・qPCR Master Mixを含む)
プレート
の種類
包装 対応したqPCR装置
Bio-Rad ABI Fast Block ABI Standard Block
Normal ROX Hi-ROX Normal ROX Hi-ROX Normal ROX Hi-ROX
96 well
plate
12 tests FGS0069R FGS0077R FGS0070R FGS0078R FGS0071R FGS0079R
24 tests FGS0072R FGS0080R FGS0073R FGS0081R FGS0074R FGS0082R
384 well
plate
12 tests FGS0075R FGS0083R
24 tests FGS0076R FGS0084R

ID3EAL Biofluid miRNA Knowledge Panel, Panel A-B, 192 Targets(cDNA Synthesis System・qPCR Master Mixを含まない)
プレート
の種類
包装 対応したqPCR装置
Bio-Rad ABI Fast Block ABI Standard Block
96 well
plate
12 tests 1105253-HSA02100ABI 1105253-HSA02100AFA 1105253-HSA02100AST
24 tests 1105254-HSA02100ABI 1105254-HSA02100AFA 1105254-HSA02100AST
384 well
plate
12 tests 1105353-HSA02100ABI 1105353-HSA02100AFA
24 tests 1105354-HSA02100ABI 1105354-HSA02100AFA

パネル(特注品)

ご希望に応じて、特注品パネルの製造を行います。
パネル(特注品)のご注文・お問い合わせ先:受託・特注品担当
MAIL:jutaku@funakoshi.co.jp



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cDNA Synthesis System

miRNAからcDNAを合成するのに必要な逆転写酵素、バッファーのセットです。

[在庫・価格 :2024年04月27日 00時00分現在]

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  • 商品コード
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  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
ID3EAL cDNA Synthesis System
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法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2022年11月15日号 p.34

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[在庫・価格 :2024年04月27日 00時00分現在]

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ID3EAL cDNA Synthesis System

文献数: 0

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掲載カタログ ニュース2022年11月15日号 p.34

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qPCR Master Mix

逆転写反応を行った後のqPCRによる検出・定量に用いるマスターミックスです。標準タイプとHi-ROXタイプの2種類がありますので、お手持ちのqPCR装置に適したものをお選び下さい。

標準タイプ

[在庫・価格 :2024年04月27日 00時00分現在]

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ID3EAL miRNA qPCR Master Mix
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ID3EAL miRNA qPCR Master Mix
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[在庫・価格 :2024年04月27日 00時00分現在]

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ID3EAL miRNA qPCR Master Mix

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ID3EAL miRNA qPCR Master Mix

文献数: 0

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Hi-ROXタイプ

[在庫・価格 :2024年04月27日 00時00分現在]

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  • 商品コード
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ID3EAL miRNA qPCR Master Mix - Hi-ROX
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ID3EAL miRNA qPCR Master Mix - Hi-ROX
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ID3EAL miRNA qPCR Master Mix - Hi-ROX

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ID3EAL miRNA qPCR Master Mix - Hi-ROX

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Spike-in Control RNA

ポジティブコントロールとして試料に添加し、各試料間での検出結果のばらつきを比較することで、実験操作が適切に行われたかどうかの確認や、実験データの標準化および正確な解析を行うことが可能になります。


キット内容

  • ID3EAL spike-in control for Isolation
  • ID3EAL spike-in control for reverse transcription
  • ID3EAL Multiplex RT spike-in primers
  • ID3EAL individual miRNA qPCR assay (for Isolation Spike-in 1/2)
  • ID3EAL individual miRNA qPCR assay (for RT Spike-in)

[在庫・価格 :2024年04月27日 00時00分現在]

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納期 文献数
ID3EAL Multiplex RT RNA Spike-in Kit
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法規制等
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ID3EAL Multiplex RT RNA Spike-in Kit

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参考文献

  1. Chang, W.H., et al., "Extracellular Vesicles and Their Mimetics: A Comparative Study of Their Pharmacological Activities and Immunogenicity Profiles."
    Pharmaceutics, 15 (4), 1290 (2023). [PMID:37111775]

  2. Hong, L.Z., et al., "Systematic evaluation of multiple qPCR platforms, NanoString and miRNA-Seq for microRNA biomarker discovery in human biofluids."
    Sci. Rep., 11 (1), 4435 (2021). [PMID:33627690]

  3. Nweke, E.E. and Brand, M., "Downregulation of the let-7 family of microRNAs may promote insulin receptor/insulin-like growth factor signalling pathways in pancreatic ductal adenocarcinoma."
    Oncol. Lett., 20 (3), 2613~2020 (2020). [PMID:32782579]

  4. van der Sijde, F., et al., "Serum miR-338-3p and miR-199b-5p are associated with the absolute neutrophil count in patients with resectable pancreatic cancer."
    Clin. Chim. Acta., 505, 183~189 (2020). [PMID:32145274]

  5. Choi, H., et al., "Plasma Protein and MicroRNA Biomarkers of Insulin Resistance: A Network-Based Integrative -Omics Analysis."
    Front. Physiol., 10, 379 (2019). [PMID:31024340]

  6. Woo, C.C., et al., "The Interaction between 30b-5p miRNA and MBNL1 mRNA is Involved in Vascular Smooth Muscle Cell Differentiation in Patients with Coronary Atherosclerosis."
    Int. J. Mol. Sci., 21 (1), 11 (2019).[PMID:31861407]

  7. Tan, K., et al., "Longitudinal monitoring reveals dynamic changes in circulating tumor cells (CTCs) and CTC-associated miRNAs in response to chemotherapy in metastatic colorectal cancer patients."
    Cancer Lett., 423, 1~8 (2018). [PMID:29518480]

  8. Loh, W.P., et al., "Overexpression of microRNAs enhances recombinant protein production in Chinese hamsterovary cells."
    Biotechnol. J., 9 (9), 1140~1151 (2014). [PMID:24819042]

  9. Ho, Y.K., et al., "Direct Quantification of mRNA and miRNA from Cell Lysates Using Reverse Transcription Real Time PCR: A Multidimensional Analysis of the Performance of Reagents and Workflows."
    PLoS One, 8 (9), e72463 (2013).[PMID:24039771]

  10. Wan, G., et al., "High-performance quantification of mature microRNAs by real-time RT-PCR using deoxyuridine-incorporated oligonucleotides and hemi-nested primers."
    RNA, 16 (7), 1436~1445 (2010). [PMID:20547774]

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。