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高感度かつ高精度なmiRNAプロファイリング解析を行います ID3EAL miRNAプロファイリング解析受託サービス

掲載日情報:2024/01/17 現在Webページ番号:71548

MiRXES社独自のID3EAL(アイディール)テクノロジーを用いて、お客様の試料に含まれるmiRNAのプロファイリング解析を高感度かつ高精度に行う受託サービスです。
ID3EALテクノロジーを用いたmiRNA定量・解析用試薬製品についてはこちらをご覧下さい。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


サービス一覧

サービス名をクリックすると、該当箇所にページ内ジャンプします。

  • ID3EAL Knowledge Panel Profiling Service
    複数疾患、がん、血清・血漿・尿試料に関する独自研究により厳選したmiRNAパネルを用いて相対定量を行う受託サービス

  • ID3EAL Biomarker Discovery Service
    お客様の研究内容に合わせてMiRXES社にて厳選した700種のmiRNAについて絶対定量を行う受託サービス

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ID3EALテクノロジーについて



ID3EALテクノロジーの原理

RT-qPCR法によるmiRNAの検出は、逆転写によるcDNAの合成とその後のqPCRによる検出の2段階の反応を経て行われます。これらの反応のうち、逆転写には逆転写用のRTプライマー1種類、qPCR検出にはForwardとReverseの2種類のプライマーが必要となります。これら合計3つのプライマーのうち、既存手法では1つまたは2つのユニバーサルプライマー(すべての標的miRNAに共通のプライマー)が使われています。一方でMiRXES社のID3EALテクノロジーでは、ステムループ構造も特異的な設計を施した、成熟型miRNAのみに特異的なRTプライマーを用いており、qPCR用のプライマー2つも標的miRNA特異的に設計することで、既存手法よりも優れた検出特異性と検出感度を実現しています。

ID3EALテクノロジーの原理

ID3EALテクノロジーの原理

各社製品で使用されているプライマーの特異性の比較
MiRXES社のID3EALテクノロジーでは、RTプライマー、
qPCRのForward / Reverseプライマーのすべてで
miRNAに特異的なプライマーが設計されています。

メーカーRT
プライマー
qPCR Forward
プライマー
qPCR Reverse
プライマー
ID3EAL
(MiRXES社)
SpecificSpecificSpecific
A社SpecificSpecificUniversal
B社UniversalSpecificSpecific
C社UniversalSpecificUniversal

ID3EALテクノロジーの特長1:極めて高い検出特異性

ID3EALテクノロジーはmiRNA定量において重要となる、相同性の高いmiRNA間の識別においても極めて高い精度を実現しています。下図のlet-7 miRNAファミリーを用いた特異性の検討例では、各アイソフォームは1塩基程度の差しかない高い相同性を有するにもかかわらず、明確に識別することができました。

let7ファミリーそれぞれの相対的検出率

let7ファミリーそれぞれに対応するqPCR用プライマーペアを用いた場合の相対的検出率
let-7ファミリーの各アイソフォームcDNAをテンプレートとし、let7ファミリーそれぞれに対応するプライマーペアを用いてqPCRを行った。相対的検出率はプライマーペアごとに得られたCt値の差から計算している。

ID3EALテクノロジーの特長2:優れた検出感度と増幅効率

ID3EALテクノロジーでは既存製品と比較して、高い増幅効率を実現し微量なmiRNAを検出することが可能です。また、通常は増幅が難しいとされるAT含有率の高いmiRNAでも他社製品に比べて高効率に検出できます。

他社競合品との増幅効率の比較

他社競合品との増幅効率の比較

miRNA名%ATID3EAL
(MiRXES社)
A社B社C社
hsa-miR-27a-5p45%12.616.518.1N/A
hsa-miR-500a-5p52%12.516.319.815.8
hsa-miR-30e35p55%13.114.817.814.5
hsa-miR-215-5p62%12.816.019.515.6
hsa-miR-32-3p73%13.021.121.2N/A

値はCt値

ID3EALテクノロジーの特長3:高い再現性

ID3EALテクノロジーは高い再現性も実現しています。異なる2つの研究室で、1年以上の期間中に30人のがん患者由来の血清中に含まれる200種の標的miRNAを解析した例では、相関係数0.92~0.96という非常に高い再現性が得られました。

2つの実験における再現性

独立した2つの実験における測定結果の再現性
X軸は手作業でのRNA単離とBio-Rad CFX-384を用いたqPCRによって得られた測定結果を示しています。Y軸は自動でのRNA単離とLifeTech ViiA7によるqPCRでの測定結果を示しています。グラフ上には測定した200種類の標的miRNAすべてがプロットされています。


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ID3EAL Knowledge Panel Profiling Service

複数疾患、がん、血清・血漿・尿試料に関する独自研究により厳選したmiRNAパネルを用いて相対定量を行う受託サービスです。
miRNAパネル製品についてはこちらをご覧下さい。

パネル名 PanoramiR Cancer Biofluid
標的miRNA数 376種類 352種類 176種類
パネル概要 複数疾患に関連する標的miRNAを厳選したパネル。miRBase 22, HMDD v3.2, The Cancer Genome Atlasから厳選し、独自研究データおよび学術論文による検討を重ねて選択。 がんに関連する標的miRNAを厳選したパネル。PubMedなどの文献を元に、がん、がん制御遺伝子、関連シグナル伝達経路に関連深いmiRNAを選択。 20,000を超える健常者と各種疾患患者の血清、血漿、尿試料から得られた独自研究から標的miRNAを厳選。
標的miRNAリスト こちらをクリック こちらをクリック こちらをクリック

Cancerパネルを用いた解析例

Cancerパネル解析例:子宮頸がんのクラスタリング

miRNAプロファイリングによる子宮頸がんのサブタイプ化
miRNA発現データの階層クラスタリングから子宮頸がんをサブタイプに階層分けした。



Cancerパネル解析例:血清でのmiRNA発現
Cancerパネル解析例:血漿でのmiRNA発現

血液がん患者の血清とPPP試料を用いたボルケーノプロット解析
同一の血液がん患者の血清(左)および乏血小板血漿(PPP、右)からRNAを抽出・miRNA発現解析をし、ボルケーノプロットで示したところ、miRNA発現異常が一致する結果が得られた。


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ID3EAL Biomarker Discovery Service

お客様の研究内容に合わせてMiRXES社にて厳選した700種のmiRNAについて絶対定量を行う受託サービスです。

  • miRNA解析に関する研究・開発を包括的にご支援いたします。
  • ワークフローは幾重にもコントロールされています。
Biomarker Discovery Serviceの流れ


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受託サービス共通の特長

  • 優れた専門知識とノウハウを有する経験豊かなエキスパートが対応いたします。
  • 高品質で信頼性と再現性の高いデータが得られます。
  • 107 log希釈以上の試料でも検出可能な幅広いダイナミックレンジを有します。
  • 厳密な品質管理を行います。
  • 微量試料からでも解析可能です。
  • 論文投稿が即可能なレベルのバイオインフォマティクス解析を行います。
  • データは厳密に機密保持いたします。

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受託サービスの流れ(試料受領後)


受託サービスの流れ(試料受領後)


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ご提供いただく試料の例

下記は例です。詳細は当社受託・特注品担当までお問合せ下さい。

  • Total RNA
  • 血清・血漿
  • 細胞培養上清
  • 細胞
  • 全尿
  • エクソソーム
  • FFPE(ホルマリン固定・パラフィン包埋)組織
  • 新鮮・凍結組織
  • 穿刺吸引細胞

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参考文献の例

  • 胃がんを検出するための血清中miRNAバイオマーカーパネルの開発と検証:
    So, J.B.Y., et al., "Development and validation of a serum microRNA biomarker panel for detecting gastric cancer in a high-risk population.", Gut, 70 (5), 829 (2021). [PMID:33028667]

  • 非小細胞肺がん早期発見に向けた血清中miRNA測定パネルの開発:
    Ying, L., et al., "Development of a serum miRNA panel for detection of early stage non-small cell lung cancer.", Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 117 (40), 25036 (2020). [PMID:32943537]

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ご依頼方法・価格

詳細は当社受託・特注品担当までお問合せ下さい。

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