イルミナシークエンサー用ポジティブコントロールライブラリー TailorMix Dual Indexed PhiX Control Library
掲載日情報：2020/01/22 現在Webページ番号：65458
全イルミナシークエンサーに使用可能な＊1イルミナ社PhiX V3コントロール用ライブラリーに代わるライブラリーです。本製品の使用により、マルチプレックスシークエンシングにおけるPhiXのコンタミネーションの除去、より鮮明な生データの取得およびPhiXの測定値解析による品質管理（QC）が可能になります。
＊1 ExAmp cluster generation(HiSeq X/HiSeq 3000/4000)でご使用の場合は、TailorMix Dual Indexed PhiX Control Libraries Nondenatured (TM-581)をご利用下さい。
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- 次世代シークエンス（NGS）における問題点と解決法について
- 製品の種類
- 適用
- 特長
- サンプルシートのセットアップ
- 操作方法概略
- 関連した特集記事
- メーカーインタビュー：シークエンステクノロジーの最先端
- 価格
次世代シークエンス（NGS）における問題点と解決法について
通常、次世代シークエンス（NGS, Next Generation Sequence）を行う際、ランのクオリティーをモニターするためにコントロールライブラリー（Illumina 社標準品：PhiX V3 Control Library）のSpike-in を行います。一度に複数の試料をシークエンスするマルチプレックスシークエンスにおいて、目的試料のものとして得られたデータにPhiX 由来の配列がコンタミネーションすることが問題になります。
本製品を使用することでこのコンタミネーションを低減し、よりクリアなデータが得られるようになります。
ユーザーレビュー
C. F．様（San Francisco, CA）
Eric Sherman 様（University of Pennsylvania）
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製品の種類
商品コードをクリックすると、キットの価格をご覧いただけます。
| 品名 | TailorMix Dual Indexed PhiX Control Library | ||
|---|---|---|---|
| Nondenatured | Denatured | ||
| 商品コード | TM-581 | TM-503 | |
| 濃度 | 10 nM | 20 pM | |
| 溶媒 | TE buffer (pH8.0) | HT1 buffer | |
| フォーマット | Double stranded | Single stranded | |
| 試料の種類 | 非変性イルミナアダプターライブラリー | 一本鎖イルミナアダプター結合ライブラリー | |
| Dual indexed barcodes | ○ | ○ | |
| Insert Size | 380 bp | ||
| 対応機種 | MiSeq | ○ | ○ |
| MiniSeq | ○ | ○ | |
| NextSeq | ○ | ○ | |
| HiSeq 2000/2500 | ○ | ○ | |
| HiSeq X | ○ | × | |
| HiSeq 3000/4000 | ○ | × | |
| Nova Seq | ○ | × | |
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適用
- Single PCR amplicon sequencing
- Viral genome sequencing
- Low diversity libraries
- Highly multiplexed pools
- Single sample runs
- Unindexed libraries
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特長
- 全イルミナシステムにおいて、PhiX V3コントロール用ライブラリー（Illumina）の代わりに使用できます＊2。
- 塩基多様性が低い試料に添加することにより個々のランのクオリティーが向上します。
- イルミナの全ソフトウェアによるマルチプレックス解析に適応し、個別解析も可能な2種類のバーコード配列が含まれています。
＊2 ExAmp cluster generation(HiSeq X/HiSeq 3000/4000)でご使用の場合は、Nondenatured(#TM-581)をご利用下さい。
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サンプルシートのセットアップ
本製品は、全てのイルミナソフトウエアによってマルチプレックス解析が可能な下記の2種類のバーコード配列を含んだコントロール用ライブラリーです。
通常のシークエンスにおいては解析データに変更を加える必要はありませんが、インデックスバーコードとして下記のシーケンスを解析データファイルに追加することで、Indexed PhiX libraryをさらに個別に解析することも可能です。また必要に応じて、インデックスの読み取りに適合するように配列の長さの調整もできます。
| i7 Index 1 barcode | i5 Index 2 barcode | ||
| システム種別 | 全イルミナシステム |
|
|
| 8 bp | TCGAATGA | GACATGCG | CGCATGTC |
| 6 bp | TCGAAT | GACATG | CGCATG |
※ シングルリードシークエンシングにおいては、i7 Index 1のみを使用します。
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操作方法概略
1：TailorMix Dual Indexed PhiX Control Libraryおよびシークエンシングする試料を以下の方法で変性および希釈する。
| TailorMix Dual Indexed PhiX Control Library | ||
|---|---|---|
| Nondenatured（#TM-581） | Denatured（#TM-503） | |
| Option 1 | Option 2 | |
| イルミナ社の調製方法に従って、TailorMix Dual Indexed PhiX Control Libraryとシークエンシングする試料を変性および希釈し、適当な比率で混合する。 | 未変性のままのTailorMix Dual Indexed PhiX Control Libraryを適当な比率で未変性試料に添加し、イルミナ社の調製方法に従って、シークエンシングする試料を変性および希釈する。 | イルミナ社の調製方法に従って、シークエンシングするライブラリーを変性および希釈する。 |
2：変性Indexed PhiX Control Library＊3を以下の添加量で試料に混合する。
- TruSeqおよびNexteraライブラリー：1％
- miRNAおよびsmall RNAライブラリー：5～10％
- 塩基多様性が低いPCR産物ライブラリー：15～25％
- HiSeq専用コントロールレーン：ご使用の機器の操作方法マニュアルに従って下さい。
3：イルミナ社の各使用機器の操作方法に従ってシーケンシングまたはクラスタリング装置に試料をロードする。
＊3 ポジティブコントロールとして、または塩基多様性の向上のために使用。
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関連した特集記事
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メーカーインタビュー：シークエンステクノロジーの最先端
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価格
[在庫・価格 ：2024年04月27日 11時35分現在]
| 詳細 | 商品名 |
|
文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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TailorMix Dual Indexed PhiX Control Library (Non-Denatured) |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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TailorMix Ready to Use Dual Indexed PhiX Control Library (Denatured) |
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0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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[在庫・価格 ：2024年04月27日 11時35分現在]
TailorMix Dual Indexed PhiX Control Library (Non-Denatured)
文献数： 0
- 商品コード：TM-581
- メーカー：SQM
- 包装：6x10μl
- 価格：¥555,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2～3週間 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
アダプターライゲーション済みのPhixコントロールライブラリー。Illumina社の各シークエンサーに対応している。各種次世代シークエンスのコントロールとして利用できる。対応機種：MiSeq, MiniSeq, NextSeq, HiSeq 2000/2500/3000/4000, HiSeq X, Nova Seq。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | -20℃ | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
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| 製品記事 |
次世代シークエンス（NGS）関連製品特集 |
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| 関連記事 | |||
TailorMix Ready to Use Dual Indexed PhiX Control Library (Denatured)
文献数： 0
- 商品コード：TM-503
- メーカー：SQM
- 包装：6x200μl
- 価格：¥555,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2～3週間 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
アダプターライゲーション済みのPhixコントロールライブラリー。Illumina社の各シークエンサーに対応している。各種次世代シークエンスのコントロールとして利用できる。対応機種：MiSeq, MiniSeq, NextSeq, HiSeq 2000/2500。 |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | -20℃ | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
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| 製品記事 |
次世代シークエンス（NGS）関連製品特集 |
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