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FFPE組織試料から高品質な精製DNAとRNAを抽出するキット Quick-DNA・RNA FFPE Kitシリーズ

掲載日情報:2016/12/05 現在Webページ番号:65405

スピンカラム(Zymo-SpinⅡC)を用いることにより、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料または切片から高品質なDNAとRNAを簡便かつ高収率で抽出・精製できるキットです。DNA、RNAのそれぞれを抽出するキットと、全核酸(DNAとRNA)を抽出するキットがあります。得られたDNAまたはRNAはPCRや次世代ライブラリーの調製、酵素的操作などに適用できます。

■Quick-DNA/RNA Kit(#R1009)の使用例

#R1009測定

Quick-DNA/RNA Kit(#R1009)と他社競合品Aを用いて、DNA(左)およびRNA(右)を分離し、それぞれPCRまたはRT-PCR増幅曲線を作成した結果。RT-PCRの結果(右)では、Quick-DNA/RNA Kitを用いて抽出・精製したRNAが全般的に他社競合品Aより品質が高く、平均⊿Ctは3.6であった。

Quick-DNA・RNA FFPE Kitシリーズの種類

品名をクリックすると、それぞれの商品の詳細がご覧いただけます。商品コードをクリックすると、直接価格表がご覧いただけます。

核酸の種類 ←DNA→  
  ←RNA→
品名 Quick-DNA FFPE Kit Quick-DNA/RNA FFPE Kit Quick-RNA FFPE Kit
商品コード D3067 R1009 R1008
適応試料 ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)新鮮/凍結組織
組織試料
のサイズ
全組織 最大25 mg
組織切片 最大4組織切片(切片の厚さ:≦20μg)
核酸抽出物 全DNA 全核酸(DNA&RNA) 全RNA (incl. 17-200 nt)
スピンカラムの種類 Zymo-Spin IIC
最大カラム結合量 25μg 最大50μg(co-purification時) 50μg
DNA、RNAの純度 A260/A280>1.8 A260/A280>1.8、A260/A230>1.8
製品概要 抽出・精製するDNAのサイズは、>50 bp 、>500 bpの2種類に対応。 全核酸の抽出・精製と、DNAとRNAとを分別して抽出・精製する2通りの方法に対応。 キットにはDNase Iが添付されており、DNAフリーの精製RNAが得られる。

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Quick-DNA FFPE Kit(#D3067

ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料または切片から、RNAの混入のない高品質なDNAを簡便かつ高収率で抽出・精製できます。

■Quick-DNA FFPE Kitの特長

  • FFPE組織または切片から、PCR、次世代ライブラリーの調製および酵素操作などに最適な高品質のDNAを効率的に精製できます。
  • 抽出、精製するDNAのサイズは、イソプロパノールの添加の有無によって全DNA>50 bpと>500 bpとの場合の2種類に対応できます。

キット内容の詳細については、こちらをご覧下さい。

■Quick-DNA FFPE Kitの操作方法概要

Deparaffinization Solutionにより、わずか5分間で脱パラフィンが行えます。次いでProtease Kを加えて加温し組織中のタンパク質を消化し、RNase Aを加えてRNAを分解します。Genomic Lysis Bufferを加えることで>500 bpのゲノムDNAを抽出できます。さらにイソプロパノール*を添加することで、>50 bpのゲノムDNAを抽出できます。抽出液をFast-Spinカラムに吸着し、洗浄、溶出することにより、高品質な精製DNAが得られます。

* イソプロパノールはキットに含まれていません。>50 bpのゲノムDNAを抽出する場合は、別途ご用意下さい。この場合、ssDNAが試料に含まれる場合には同時に抽出されます。

Quick-DNA FFPE Kitの操作方法概要

■Quick-DNA FFPE Kitと旧製品との比較

Quick-DNA FFPE Kit(#D3067)は、ZR FFPE DNA MiniPrep(#D3065、#D3066)の後継品となります。Quick-DNA FFPE Kitでは新たにDeparaffinization Solutionがキットに含まれており、脱パラフィン溶液を別に準備する必要がなくなり利便性が向上しています。

品名 Quick-DNA FFPE Kit New ZR FFPE DNA MiniPrep(中止
商品コード D3067 D3065, D3066
適応試料 ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)新鮮/凍結組織
組織試料
のサイズ
全組織 最大25 mg
組織切片 最大4組織切片(切片の厚さ:≦20μg)
抽出できるDNAのサイズ DNA>50 bpおよびDNA>500 bp
スピンカラムの種類 Zymo-Spin IIC
最大カラム結合量 25μg
脱パラフィン処理 キットに含まれるDeparaffinization Solutionによりわずか5分で脱パラフィンが可能。 脱パラフィン溶液は、キシレン・エタノール溶液が別途必要。

■Quick-DNA FFPE Kitの使用例

Quick-DNA FFPE Kitの使用例 Quick-DNA FFPE KitのDNAバンド

左:Quick-DNA FFPE Kitと他社競合品Aで抽出・精製したDNAの等量を、それぞれリアルタイムPCR解析した結果。
右:1%アガロース/TAE/EtB中で等量のサイズの異なるDNAを分析した結果。>500 bp(左)と>50 bp(右)サイズのDNAが、結合条件によって選択的に抽出・精製できることが示された。

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Quick-RNA FFPE Kit(#R1008

ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料から、large RNAおよびsmall RNAを含む DNAフリーの高品質な全RNAを簡便かつ高収率で抽出・精製できます。

■Quick-RNA FFPE Kitの特長

  • ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料から、small RNA(17~200 nt)およびmicro RNAを含む全RNAの抽出・精製が行えます。
  • キットにはDNase Ⅰが含まれており、カラム内でDNAの分解、除去が行えます。
  • 得られた精製RNAは、RT-PCRやハイブリダイゼーション、シークエンシングなどに用いることができます。

キット内容の詳細については、こちらをご覧下さい。

■Quick-RNA FFPE Kitの操作方法概要

Deparaffinization Solutionにより、わずか5分間で脱パラフィンが行えます。次いでProtease Kを加えて加温し組織中のタンパク質を消化し、RNA lysis bufferを加えた溶出液を、Zymo-Spin columnⅡCに加えてRNAを吸着させます。共雑するDNAを除去する場合は、DNase ⅠとDNA digestion bufferをカラムに直接加えます。RNA prep buffer、次いでRNA wash bufferを添加し、流出液を廃棄後、最後にDNase / RNase free waterをカラムに加えて精製全RNAを溶出します。

Quick-RNA FFPE Kitの操作方法概要

■Quick-RNA FFPE Kitと類似製品(Pinpoint Slide RNA Isolation System II (#R1007))との違い

FFPE組織および切片からRNAを抽出・精製するQuick-RNA FFPE Kitのほかに、組織切片をスライド上にマウントした標本からRNAを抽出・精製するPinpoint Slide RNA Isolation System Ⅱ (#R1007)があります。試料によって最適なキットをお選び下さい。主な違いは下表をご参照下さい。

品名 Quick-RNA FFPE Kit Pinpoint Slide RNA Isolation System Ⅱ
商品コード R1008 R1007
適応試料 FFPE組織ブロックおよび切片 ガラススライド上のFFPE組織切片
組織試料
のサイズ
全組織 最大25 mgのFFPE組織ブロック
組織切片 最大 4組織切片(切片の厚さ:≦20 μg) 組織切片(切片の厚さ:≦10 μg)
抽出できるRNA 全RNA(small RNA 17~200 ntを含む)
スピンカラムの種類 Zymo-Spin IIC Zymo-Spin IC
最大カラム結合量 50μg 5μg
脱パラフィン処理 キットに含まれるDeparaffinization Solutionによりわずか5分で脱パラフィンが可能。 脱パラフィン溶液は、キシレン・エタノール溶液が別途必要。

■Quick-RNA FFPE Kitの使用例

Quick-RNA FFPE Kitの使用例 Quick-RNA FFPE KitのDNAバンド

左:Quick-RNA FFPE Kitと他社競合品Aを用いてRNAを抽出・分離し、RT-PCR増幅曲線を作成して比較した(n=4)。Quick-RNA FFPE Kitで抽出・分離したRNAは、品質が高くいずれも他社競合品Aより優れた結果が得られた。
右:Quick-RNA FFPE Kitと他社競合品Aで抽出・分離したRNAをAgilent 2200 TapeStationを用いて解析した結果、他社競合品Aで抽出・分離したRNA に比べてQuick-RNA FFPE Kitで抽出・分離したRNAの品質の高さが実証された。

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Quick-DNA/RNA FFPE Kit(#R1009

ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料から、全核酸(DNAおよびRNA)または高品質なDNA とlarge RNAおよびsmall RNAを含む DNAフリーの高品質な全RNAをそれぞれ簡便かつ高収率で抽出・精製できます。

■Quick-DNA/RNA FFPE Kitの特長

  • FFPE組織または切片から、PCR、次世代ライブラリーの調製および酵素操作などに最適な高品質のDNAを効率的に精製できます。
  • ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料から、small RNA(17~200 nt)およびmicro RNAを含む全RNAの抽出・精製が行えます。
  • キットにはDNase Ⅰが含まれています。

キット内容の詳細については、こちらをご覧下さい。

■Quick-DNA/RNA FFPE Kitの操作方法概要

Quick-DNA/RNA FFPE Kitは、全核酸(DNAとRNA)を抽出・精製するCo-Purification法とDNAとRNAを分別して抽出・精製するParallel Purification法の2通りの方法に対応でき、実験目的に応じてご選択いただけます。Deparaffinization Solutionにより、わずか5分間で脱パラフィンが行えます。次いでProtease Kを加えて加温し組織中のタンパク質を消化します。加温により脱架橋後、 Zymo-Spinカラムを用いて精製することにより、高品質のDNAおよびRT-PCR、ハイブリダイゼーションおよびシークエンシングなどに用いることができるDNAフリーの全RNA(17~200 ntのsmall RNAを含む)が得られます。

Quick-DNA/RNA FFPE Kitの操作方法概要

Quick DNA/RNA FFPE Kitの使用例については、こちらをご覧下さい。

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Quick-DNA・RNA FFPE Kitシリーズのキット内容

商品コードをクリックすると、直接価格表がご覧いただけます。キットコンポーネント名をクリックすると、キットコンポーネントの別売りの単品の価格表がご覧いただけます。

核酸の種類 ←DNA→  
  ←RNA→
品名 Quick-DNA FFPE Kit Quick-DNA/RNA FFPE Kit Quick-RNA FFPE Kit
商品コード D3067 R1009 R1008
Deparaffinization solution
Proteinase K & storage buffer
Digestion buffer
Zymo-Spin ⅡC columns
Genomic lysis buffer
DNA-RNA lysis buffer
RNA lysis buffer
Genomic wash buffer 1/2
DNA/RNA prep buffer
RNA prep buffer
DNA elution buffer
DNase/RNase-free water
RNase A
DNase Ⅰ Set

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Quick-DNA・RNA FFPE Kitシリーズの価格

[在庫・価格 :2024年04月25日 00時00分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
Quick-DNA FFPE Kit (50 prep.)
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
ホルマリン固定パラフィン包埋組織(FFPE)試料または組織切片から,RNAの混入のない高品質なDNAを簡便かつ高収率で抽出・精製できる。抽出・精製するDNAのサイズは,>50 bp ,>500 bpの2種類に対応。
法規制等
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2018年1月合併号 p.7

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Quick-DNA/RNA FFPE Kit (50 Preps)
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
ホルマリン固定パラフィン包埋組織(FFPE)試料から,全核酸(DNAおよびRNA)または高品質なDNA とlarge RNAおよびsmall RNAを含む DNAフリーの高品質な全RNAをそれぞれ簡便かつ高収率で抽出・精製できる。全核酸の抽出・精製と,DNAとRNAとを分別して抽出・精製する2通りの方法に対応。
法規制等 取扱注意
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2018年1月合併号 p.7

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Quick-RNA FFPE MiniPrep
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
ホルマリン固定パラフィン包埋組織(FFPE)試料から,large RNAおよびsmall RNAを含む DNAフリーの高品質な全RNAを簡便かつ高収率で抽出・精製できる。
法規制等 取扱注意
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2018年1月合併号 p.7

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[在庫・価格 :2024年04月25日 00時00分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。

Quick-DNA FFPE Kit (50 prep.)

文献数: 0

説明文 ホルマリン固定パラフィン包埋組織(FFPE)試料または組織切片から,RNAの混入のない高品質なDNAを簡便かつ高収率で抽出・精製できる。抽出・精製するDNAのサイズは,>50 bp ,>500 bpの2種類に対応。
法規制等
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2018年1月合併号 p.7

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Quick-DNA/RNA FFPE Kit (50 Preps)

文献数: 0

説明文 ホルマリン固定パラフィン包埋組織(FFPE)試料から,全核酸(DNAおよびRNA)または高品質なDNA とlarge RNAおよびsmall RNAを含む DNAフリーの高品質な全RNAをそれぞれ簡便かつ高収率で抽出・精製できる。全核酸の抽出・精製と,DNAとRNAとを分別して抽出・精製する2通りの方法に対応。
法規制等 取扱注意
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2018年1月合併号 p.7

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文献数: 0

説明文 ホルマリン固定パラフィン包埋組織(FFPE)試料から,large RNAおよびsmall RNAを含む DNAフリーの高品質な全RNAを簡便かつ高収率で抽出・精製できる。
法規制等 取扱注意
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2018年1月合併号 p.7

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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