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植物の遺伝子解析などを承ります 遺伝子解析・分子生物学実験サービス

掲載日情報:2020/06/12 現在Webページ番号:63536

(株)インプランタイノベーションズでは、植物の栽培から遺伝子解析まで植物の研究開発に関わる幅広いサービスを提供しています。メニューにないサービスでもお気軽にご相談下さい。

遺伝子解析・分子生物学実験サービス一覧

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ベクター構築

ベクター構築イメージ

クローニング方法、最終ベクター、選抜マーカーなど、ご要望に合わせてクローニングやベクター構築を行います。(株)インプランタイノベーションズ植物用Gatewayベクターのコンストラクト作製サービスもございます。

■ ベクター構築サービスの内容

  • PCRによる遺伝子クローニング→最終ベクターへの組込み→シークエンス
  • カスタムメイドのベクター構築
  • セレクションマーカーの乗せ換え

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植物形質転換用ベクター

タイトルをクリックすると詳細をご覧いただけます。

  • pBIシリーズ
  • pBGシリーズ
  • pFASTVector
  • pSuperAgroシリーズ


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次世代シークエンシング

全ゲノムde novo シークエンス解析、全ゲノムリシークエンス解析をはじめとして、目的に応じた次世代シークエンシングメニューをご用意しています。
植物試料からのゲノムDNA抽出及び品質チェックも承っております。下記のサービスフローをご参照ください。

■ 全ゲノムde novo シークエンス解析

これまでにリファレンスシークエンスのない、未知のゲノム解析を行います。
シークエンスプラットフォームとシークエンスリード長、ペア-エンド及びメイト-エンドライブラリーオプションとの組み合わせにより、様々な生物の全ゲノム解析を可能にします。植物ではシロイヌナズナ、野菜類などで経験があります。微生物ゲノムの解析も承っています。


●使用可能なプラットフォーム

  • Illumina HiSeq2000 / HiSeq2500 / MiSeq
  • 454 GS-FLX / Plus

●Data Analysis

  • De novo Assembly
  • Gene Prediction
  • Variant Calling (SNP, In/Dels)
  • Gene Annotation
  • Customized Analysis

■ 全ゲノムリシークエンス解析

既にリファレンスシークエンスのあるものについて全ゲノムリシークエンス解析を行います。
変異体の解析、2つの品種間の比較、遺伝子マッピングなどに、幅広くご利用いただけます。SNP解析などのデータ解析も承っております。

●使用可能なプラットフォーム

  • Illumina HiSeq2000 / HiSeq2500 / MiSeq
  • 454 GS-FLX / Plus

●Data Analysis

  • Alignment and summary of data production
  • Variant Calling (SNP, In/Del) and Annotation
  • Structural Variation (CNV and SV) and Annotation
  • Comparative Analysis
  • Customized Analysis

■ 次世代シーケンシングのサービスフロー

青色がお客様の作業になります。

サービスフロー

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ゲノム解析

サザン解析、Tail-PCR、トランスクリプトーム解析などを承ります。サザン解析では、ゲノムDNAとプローブをハイブリダイゼーションさせて検出するサザンハイブリダイゼーション法により、目的cDNA/遺伝子がゲノム上に存在するか否かを判定でき、形質転換体のコピー数確認にご利用いただけます。

Tail-PCR、トランスクリプトーム解析なども承ります。詳細はお問い合わせ下さい。

■ ゲノム解析サービスの内容(サザン解析)

  • ご希望の形質転換体及びコントロール植物サンプルをお送りいただき、CTAB法にてDNA抽出
  • 抗原抗体反応(DIGシステム(Roche)の発色法)によるプローブの作製
  • ハイブリダイゼーションとシグナル検出
  • 通常グレード、または論文グレードをご選択
  • 納品物:報告書、メンブレン(ご希望の場合)

試料はドライアイス詰の冷凍便でお送り下さい(平日着)。プローブとなる鋳型、プローブ作製用のプライマーも同梱下さい。


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DNA・RNA抽出

ご希望の植物サンプルをお送りいただき、DNA、total RNA、mRNAなどを抽出し、ご返却する受託サービスです。

■ DNA・RNA抽出サービスの内容

  • ご指定の抽出方法でDNA、total RNA、mRNAを抽出します。
  • ご指定が無い場合は(株)インプランタイノベーションズで抽出方法を選択いたします。

ご希望の組織・細胞サンプルをドライアイスの冷凍便でお送り下さい。(平日着)
植物試料によっては抽出が難しい場合がございますのでご相談下さい。

■ DNA・RNA抽出サービスの受託実績

DNA抽出
  • シロイヌナズナ
  • イネ科
  • トマト
  • カーネーション
  • サトウキビ
RNA抽出
  • シロイヌナズナ
  • イネ科
  • トマト
  • トウモロコシ
  • カンゾウ

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完全長cDNA作製

理化学研究所の植物開発技術・インフラを用いて、高品質な完全長cDNAをご提供します。標準化、サブトラクションなどのオプションも承ります。

■完全長cDNA作成サービスの特長

  • 完全長率が高く、重複率は低いライブラリーです。
  • 幅広い選択肢より、目的に応じて最適なライブラリーをお選び頂けます。
    • 標準ライブラリー
    • 遺伝子探索のためのノーマライズ化・サブトラクション化ライブラリー
    • 興味ある転写産物を濃縮するためのサブトラクション化ライブラリー
    • タグ分けされた最大4区分を1つのライブラリーとするプール化ライブラリー

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FOX Hunting

FOX Hunting System概略

理化学研究所により開発された、「完全長cDNAを用いた総合的遺伝子機能解析の植物システム(FOX Hunting System)」を用いて、ゲノム情報が未知であるものを含め、あらゆる植物の有用遺伝子探索を行います。
FOX Hunting Systemとは、Full-length cDNA Over-expressor gene Hunting Systemの略称です。シロイヌナズナに目的植物の完全長cDNAを導入、強発現させることにより、変化を生じた形質転換シロイヌナズナを目的とする条件で選別し、最後にその個体から遺伝子を取り出すという、ゲノムワイドな有用遺伝子探索技術です。

詳細は、「FOX Hunting System 受託サービス 」をご覧下さい。



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