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土壌試料から迅速かつ効果的に全RNAを抽出,精製するキット FastRNA Pro Soil Kitシリーズ

掲載日情報:2017/08/30 現在Webページ番号:778

土壌試料から,キットに含まれる試料破砕用マトリクス入りチューブLysing Matrix E)と卓上型高速破砕装置FastPrep Instrumentを使用して全RNA(total RNA)を迅速かつ効率的に抽出・精製するキットです。土壌試料中の全 RNA を直接精製する Soil-Direct Kit と,土壌試料をホモジナイズして上清から微生物などを分離した後,全 RNA を精製する Soil-Indirect Kit があります。本キットで調製した全RNAは,RT-PCRやノーザンブロッティングなどのアプリケーションに適用できます。

FastRNA Pro Soil Kit電気泳動

A. 4 種類の異なる土壌試料各0.5 g から,FastRNA Pro Soil-Direct Kit(#6070-050)を用いて精製した全 RNAをアガロースゲルで電気泳動した。

B. 4 種類の異なる土壌試料から,FastRNA Pro Soil-Direct Kit(#6070-050)を用いて全 RNAを精製し,真菌類の遺伝子をRT - PCR により増幅した。得られたRT-PCR反応物をアガロースゲルで電気泳動した。

C. 4 種類の異なる土壌試料から,FastRNA Pro Soil-Indirect Kit(#6075-050)を用いて精製した全 RNA をアガロースゲルで電気泳動した(Lane 2, 4, 5は土壌試料各5g,Lane 3は土壌試料10g)。

D. 4 種類の異なる土壌試料からFastRNA Pro Soil-Indirect Kit(#6075-050)を用いて全 RNAを精製し,真菌類の遺伝子を RT - PCR により増幅した。得られたRT-PCR反応物をアガロースゲルで電気泳動した。

FastRNA Pro Soil Kitシリーズの種類

商品コードをクリックすると,価格表をご覧いただけます。

品名 FastRNA Pro Soil-Direct Kit FastRNA Pro Soil-Indirect Kit
製品外観 #6070-050 #6075-050
商品コード 6070-050 6075-050
製品概要 土壌などの試料から直接全RNAを抽出,精製するキット 低速遠心分離で土壌懸濁液から上清の微生物や他の生物試料を分離し,次いで全RNAを抽出,精製するキット
50 preps
適用試料 土壌,糞便,環境水,排水,汚泥
試料処理可能量 ≦500 mg/prep土壌試料 1 g 土壌試料
適用試料 2 ml
試料処理可能量 RNApro soil lysis solution
RNApro solution
Phenol:Chloroform (1:1)
Soil filtration cheesecloth
Inhibitor removal solution
RNAMATRIX slurry
RNAMATRIX binding solution
RNAMATRIX wash solution concentrate
DEPC-treated H2O
Lysing matrix E
Quick-Clean spin filters
Catch tube

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土壌から全RNAの抽出,精製について

土壌から全RNAの抽出,精製について (クリックで開閉します)

FastRNA Pro Soil Kitシリーズは,卓上型高速破砕装置FastPrep-24 Instrumentを用いて土壌中に存在する微生物やその他の試料から全細胞RNAを迅速かつ効率的に分離します。キットに含まれる破砕用チューブ内でlysing matrix particlesを多方向に同時に衝突させることで試料を効果的にホモジナイズします。

土壌中の生物多様性は,その物理的および化学的組成および環境要因によって直接影響を受けます。in vitro 培養法を用いた場合,土壌中の生物多様性は約90%まで過小評価される場合があります1,2。このため,土壌から全RNAを精製して,これから微生物由来の特定遺伝子の検出を行い,次いで個々の株の単離同定,土壌の生物多様性の推定,土壌微生物の代謝活性の推定,発現遺伝子のクローニングが行われます3,4,5,6

土壌から核酸抽出を行う方法には,直接法と間接法があります。直接法は,土壌試料から直接微生物および他の生物由来から核酸を抽出します7。一方,間接法はバッファーを用いて微生物および他の生物を土壌から分離し,次いで微生物を溶解し,核酸を精製します8,9。また,間接法は,微生物多様性の正確な測定が必要ない場合は,土壌を増殖培地中でインキュベートして,増殖された生物からのRNA抽出も行います。RNAの単離前に生育培地を用いて土壌をインキュベートし,生きている生物を増幅できます。それぞれの実験目的に合わせて,FastRNA Pro Soil-Direct Kit(#6070-050)とFastRNA Pro Soil-Indirect Kit(#6075-050)より最適なキットをご選択下さい。 FastPrep-24
FastPrep-24 Instrument

■参考文献

  1. Faegri, A., et al., Soil Biol. Biochem., 9, 105~112 (1977).
  2. Roszak, D. B., et al., Microbiol., Rev., 51, 365~379 (1987).
  3. Selenska, S., et al., Microb. Releases, 1, 41~46 (1991).
  4. Bej, A. K., et al., FEMS Microbiol. Ecol., 86, 169~175 (1991).
  5. Ka, J.O., et al., Microb. Ecol., 42, 267~273 (2001).
  6. Hurt R.A., et al., Appl. Environ. Microbiol., 67, 4495~503 (2001).
  7. Ogram, A., et al., J. Microb. Methods, 7, 57~66 (1987).
  8. Torsvik, V. L., Soil Biol. Biochem., 12, 15~21(1980).
  9. Holben, W. E., et al., Appl. Environ. Microbiol., 54, 703~711(1988).

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特長

  • 溶菌または溶解が困難なグラム陽性菌,植物などからも簡単に全RNAを精製できます。
  • 操作は 2 時間以内に終了します。
  • キットに含まれるLysing matrix E(1.4 mm ceramic sphere, 0.1 mm silica sphere, 4 mm glass beads)を使用し,FastPrep Instrumentで試料を40秒で破砕できます。
  • 土壌中の腐植物質を,RT-PCRを阻害しないレベルまで除去できます*
  • 精製した全 RNAは,RT-PCRやノーザンブロッティングなどに使用できます。

* 通常はRNAMATRIXを用いた第一段階の精製操作で RT-PCR の阻害物質を除去できますが,目的断片が増幅しないなど残余の阻害物質の除去が更に必要な場合は,キットに含まれるQuick-clean spin filterで第二段階の精製操作を行って下さい。
本製品の使用に当たっては,FastPrep Instrumentが必要となります。

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価格

[在庫・価格 :2021年02月27日 00時13分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
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納期 文献数
FastRNA Pro Soil-Direct Kit (50 preps)
2~3週間 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
法規制等 医薬用外劇物
保存条件 室温,暗所保存 法規備考
掲載カタログ ニュース2018年2月1日号 p.5

製品記事 DNA / RNA の抽出・精製および細胞ライセート調製システム FastPrep システム特集
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FastRNA Pro Soil-Direct Kit (50 preps)

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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