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酵素を妨げずにDNA/RNAのG4構造を不安定化させる化合物 G4-Unfolder

掲載日情報：2025/06/02 現在Webページ番号：73571

イディール /
Idylle S.A.S.
[メーカー略称：IDY]

シトシン誘導体PhpCをベースとした、DNAおよびRNAにおけるG4構造を不安定化させる低分子化合物です。酵素による結合を妨げないため、生理的な条件下でのG4構造の機能解析に有用です。

※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


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G4構造（G-quadruplex）とは

G4構造は、4つのグアニンが平面状に会合して形成される、DNAおよびRNAの特異な高次構造です。遺伝子の制御や発現においてさまざまな役割を果たすことで知られています。G4構造を標識または安定化させるための試薬は広く用いられてきましたが、不安定化させるための試薬はあまり知られていません。

PhpCとは

G4構造を不安定化させる低分子のシトシン誘導体です。PhpCによる不安定化の機能的影響は、がん細胞のG4構造に関連する遺伝的不安定性の解消、神経前駆体細胞におけるX連鎖性ジストニア・パーキンソニズム（XDP）表現型の回復、およびがん細胞におけるG4構造を含むmiRNA成熟の正常化に関するアプローチとして研究されました。


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特長

  • G4構造に強く結合せず酵素の結合を妨げないため、生体内に近い状態でG4構造を不安定化することができます。
  • TaqポリメラーゼやPif1ヘリカーゼなどの酵素が、G4構造による障害を通過するのを助けます。
  • ヒト細胞において、G4構造の全体的な分布や状態を調節することが確認されています。
  • 分子、酵素、および細胞レベルで効果が検証されています。
画像説明

PhpCの構造式


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使用例

A549細胞内におけるpre-miRNAのG4構造の不安定化

画像説明

A549細胞（肺がん由来細胞株）にG4構造を形成するRNA配列（FAM-RG4-3196）を導入した。
A. 50 μMのPhpCを加え24時間インキュベーションした後、QUMA-1（赤色、G4構造を認識）およびHoechst（青色、DNA全体を認識）で染色した。
B. PhpCとのインキュベーションの有無それぞれにおける、細胞当たりのQUMA-1の蛍光強度の積算値を算出した。
C. PhpCとのインキュベーションの有無それぞれにおける、RG4-3196配列およびQUMA-1の間の共局在係数を算出した。
PhpCとのインキュベーション後、G4構造の量が有意に減少しており、A549細胞においてPhpCがRG4-3196配列のG4構造を不安定化したことが示された。

  • ■ 引用文献：Alexandre, D., et al., Int. J. Biol. Macromol., 318(Pt 4), 145263(2025). [PMID:40527376](License:CC BY 4.0)


    • 大腸がん由来細胞株におけるRNA発現の調節

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    未処理およびPhpC処理したHT-29細胞（大腸がん由来細胞株）を用いて、G4RP-RT-qPCRを行った。PhpCとのインキュベーションにより、UXT-AS1およびNRASの発現が有意に低下した。

  • ■ 引用文献：Sharma, S., et al., BMC Biol., 23(1), 249(2025). [PMID:40781675](License:CC BY 4.0)


    • 細胞における毒性評価

    画像説明

    異なる濃度のPhpCで24時間処理したHeLa細胞を用いて、MTT法により細胞生存率を測定した。

  • ■ 引用文献：Magis, A. D., et al., Nat. Commun., 14(1), 6705(2023). [PMID:37872164](License:CC BY 4.0)

    • 画像説明

    異なる濃度（0～100 μM）のPhpCおよびBRACO-19でHT-29細胞を72時間処理し、スルホローダミンB（SRB）色素を用いて細胞毒性を評価した。

  • ■ 引用文献：
  • Sharma, S., et al., BMC Biol., 23(1), 249(2025). [PMID:40781675](License:CC BY 4.0)


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