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ゲル切り出しの必要なし!1 ngのRNAからライブラリー調製できます Zymo-Seq miRNA Library Kit

掲載日情報:2024/03/28 現在Webページ番号:71245

各種生体液からから抽出したcell-free RNA(cfRNA)やtotal RNAからmiRNAライブラリーを調製するキットです。従来の方法では調製時にバイアスがかかり検出精度を著しく低下させていましたが、本製品では単一のアダプターと環状化ライゲーション法を用いることで、ライブラリー調製時のバイアスを最小限に抑えることができます。


バナー

miRNAとは

miRNAはsmall RNAの一種(~21ヌクレオチド)で、さまざまな組織や体液(血液、尿、唾液、脳脊髄液)中に存在します。miRNAの発現の変化は疾患(がん、循環器疾患、神経変性疾患)と関連しています。遺伝子制御の重要な役割を果たし、タンパク質と細胞プロセスに影響を与えるので、miRNAはバイオマーカー探索で重要なターゲットになっています。

miRNA

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特長

  • small RNAの濃縮は不要です。
  • 1~200 ngのRNAからライブラリー調製が可能です。
  • 約8時間(操作時間2時間)の高速プロトコルです。
  • アダプターダイマーの除去は磁気ビーズで行うため、簡便かつゲルの切り出しによる収率低下を防ぎます。
  • Unique Dual Indexes(UDI)を用いるため、マルチプレックスライブラリーの調製ができます。
  • 調製したmiRNAライブラリーは、すべてのイルミナ社シークエンサーと互換性があります。
  • キット構成品の各バイアルのキャップの色は、操作ステップ別に色分けされており、分かりやすくなっています。

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Zymo-Seq Kitシリーズおよび対応したsmall RNA精製キットの選択ガイド

キット名をクリックすると、製品情報をご覧いただけます。

Zymo-Seq選択ガイド
Quick-RNA Miniprep Kit Quick-cfRNA Serum & Plasma Kit RiboFree Total RNA Kit SwitchFree 3’mRNA Library Kit

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操作方法概略

ワークフロー

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使用例

本製品を用いて調製したライブラリーのBioanalyzerを用いた品質評価

本製品を用いて調製したライブラリーのBioanalyzerを用いた品質評価
本製品を用いて調製したライブラリーのBioanalyzerを用いた品質評価

本製品を用いてライブラリーを調製し、Bioanalyzerで品質評価を行った。A1:分子量マーカー、B1:miRNAライブラリー


少量のRNA試料からの多数のmiRNA検出

少量のRNA試料からの多数のmiRNA検出
少量のRNA試料からの多数のmiRNA検出

Human Brain Total RNA(Thermo Fisher Scientific社)を試料として、本製品および各社キットを用いてライブラリーを調製した(3重試験)。75 bpシングルエンドで塩基配列決定を行い、100万リードにダウンサンプリングした後、miRbase v 22にアライメントした。グラフの数字は2つ以上のアラインメントリードを持つユニークなmiRNAの数を示す。


異なる試料量のRNAからの高い再現性

異なる試料量のRNAからの高い再現性
異なる試料量のRNAからの高い再現性

図中に示した量のHuman Brain Total RNA(Thermo Fisher Scientific社)を試料として、本製品を用いてライブラリーを調製した(3重試験)。いずれの試料量でもピアソン相関係数(R値)について高い相関が得られた。


少量のRNA試料でもmiRNA発現量を正確に検出

少量のRNA試料でもmiRNA発現量を正確に検出
少量のRNA試料でもmiRNA発現量を正確に検出

1 ngおよび100 ngのHuman Brain Total RNA(Thermo Fisher Scientific社)を試料として、本製品およびB社キットを用いてライブラリーを調製した(3重試験の結果を正規化)。 試料量により発現量解析結果に違いが生じたmiRNA(Padj <0.05)の決定には、RのisomiRs(Deseq2)パッケージを用いた。本キットで調製したライブラリーは、試料量による影響が最小限であることが示された。


各種生体液試料から抽出したRNAでのsmall RNAプロファイリング

各種生体液試料から抽出したRNAでのsmall RNAプロファイリング
各種生体液試料から抽出したRNAでのsmall RNAプロファイリング

各種体液試料からZymo Research社RNA抽出キットで精製したRNA、およびHuman Brain Total RNA(Thermo Fisher Scientific社、図中のTotal RNA)を用いて本製品でライブラリーを調製した後、small RNAプロファイリングを行った。


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NGS特集へのリンク

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キット内容

  • miRNA control(+)
  • miRNA adapter
  • Ligation enhancer
  • RNase inhibitor
  • miRNA ligation buffer
  • miRNA ligase
  • Blocking agent
  • Blocking enzyme
  • Circularization enzyme
  • Circularization buffer
  • RT primer mix
  • RT buffer
  • RT enzyme
  • ZymoTaq preMix*3
  • miRNA UDI primer set(1~12)*1
  • miRNA UDI primer plate(1~96)*2
  • Dimer removal agent
  • Dimer removal beads
  • Select-a-Size MagBead concentrate
  • Select-a-Size MagBead buffer
  • DNA wash buffer*3
  • DNase/RNase-free water*3
*1:#R3006のみ
*2:#R3007のみ
*3 単品購入可能製品です。コンポーネント名をクリックすると、価格表をご覧いただけます。
磁気ビーズスタンドが別途必要です。PCR Strip MagStand(#3DP-1002)のご使用をお勧めします。

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価格

[在庫・価格 :2024年04月23日 20時55分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。

[在庫・価格 :2024年04月23日 20時55分現在]

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Zymo-Seq miRNA Library Kit (12 preps)

文献数: 0

説明文
法規制等
保存条件 4℃,-20℃,-80℃ 法規備考
掲載カタログ

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Zymo-Seq miRNA Library Kit (96 preps)

文献数: 0

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保存条件 法規備考
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関連製品

[在庫・価格 :2024年04月23日 20時55分現在]

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詳細 商品名
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  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
DNA Elution Buffer
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
DNA Elution Buffer, 50 ml
2週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
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別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 室温 法規備考
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DNA Elution Buffer

文献数: 0

DNA Elution Buffer, 50 ml

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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