酵母細胞から高品質のRNAを抽出するキット SPINeasy RNA Kit for Yeast
掲載日情報:2024/07/03 現在Webページ番号:70906
シリカメンブレンとスピンカラム技術をベースに、酵母細胞壁を40秒以内に均一化できるビーズ破砕法と組み合わせることで、幅広い酵母種から30分以内で高品質のRNAを抽出できるキットです。
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特長
- FastPrep装置とLysing Matrix YGを組み合わせることにより高収量・高収率を実現します。
- 有害な溶媒を使用せず夾雑高分子を迅速に除去する脱塩技術と、炭水化物を有する酵母細胞壁から酵素不使用で効果的にRNAを抽出できるスフェロプラスト法を組み合わせています。
- 高品質な全RNAを30分以内に抽出できます。
- 得られたRNAは、ノーザンブロッティング、RT-PCR、次世代シークエンシング(NGS)、マイクロアレイ、ハイブリダイゼーションなどに適用できます。
- 原理:シリカメンブレンテクノロジー
- フォーマット:ミニスピンカラム
- 適応試料種:酵母細胞
- 適応試料量:≦2 × 108 cells
- 参考収量:≦220 μg(試料によって異なります)
- 溶出量:50~100 μl
- 操作時間:30分(6 preps)
試料破砕装置FirstPrep
試料の効果的な破砕および最適な収量を得るために、キットに含まれるLysing Matrix YGと別売の☞ 試料破砕装置FastPrepの併用をお勧めします。
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使用例
図1.本製品および他社RNA精製キットにより酵母細胞から抽出したRNAの完全性および純度の比較
酵母S. cerevisiae(図1A)およびP. pastoris(図1B)についてそれぞれ2 × 108 cellsから、本製品および他社RNA精製キット(X、Y、Z)を用いてそれぞれFastPrepとvortex法により全RNAを抽出・精製した。精製したRNAは、RNA Screen Tapeを用いてBioanalyzer 4150(Agilent社)で分析し、RIN値とO.D.比によりRNAの完全性と純度を決定した。
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図2.本製品および他社RNA精製キットにより酵母細胞から抽出したRNAのRT-qPCRによる比較
下流アプリケーションへの適用の検証のため、各キットで精製したRNAを試料としてiTaq Universal SYBR Green Supermix(BioRad社、#1725121)を用いたRT-PCR(+/RT)で酵母由来RNAを検出した。
S. cerevisiae(図 2A)およびP. pastoris(図 2B)から各キットで精製したRNAを希釈し、5 logレンジのテンプレート濃度の試料を調製した。iTaqのプロトコルに従いアクチン標的プライマーを用いて、Universal SYBRR Green One-Step Kit RT-qPCR reagents(BioRad社、#1725150)とQuantStudio3(Thermo Fisher Scientific社)で解析した。
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酵母細胞からのRNAの予想収量
酵母細胞数 | 予想収量(RNA) |
---|---|
1 × 106 | 50~80 μg |
1 × 107 | 90~110 μg |
1 × 108 | 130~180 μg |
2 × 108 | 170~220 μg |
各社の酵母細胞からのRNA精製キットのスペックの比較
メーカー | 酵母種 | 推奨細胞数 | 溶解方法 | DNA除去方法 | 操作時間(分) | |
---|---|---|---|---|---|---|
S. cerevisiae | P. Pastoris | |||||
本製品 | 220 μg | 185 μg | 2 × 108 cells | ビーズ破砕法 (Fastprep/Vortex) |
カラムによるゲノムDNA除去 | 15~30 |
X社キット | 81.7 μg | 67.2 μg | 1 × 107 cells | 小型ビーズミル/Lyticase/Zymolyase | On-column DNase処理/ 精製後にDNase処理 |
47~55 |
Y社キット | 110 μg | 85.2 μg | 4 × 108 cells | Lyticase | 精製後にDNase処理 | 60~70 |
Z社キット | 98.4 μg | 83.2 μg | 5 × 107 cells | Zymolyase/ガラスビーズ (ビーズミル) |
ゲノムDNA除去カラム & on-column DNase処理 |
30~45 |
※ 他社RNA精製キットについては、記載細胞数の酵母から抽出したRNAを用い、各社プロトコルに記載の夾雑DNAの推奨除去方法を行った。
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キット内容
※ ☞ Lysing Matrixの各種単品についてはこちらをご覧下さい。
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価格
[在庫・価格 :2024年12月12日 00時01分現在]
詳細 | 商品名 |
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SPINeasy RNA Kit for Yeast, 50preps |
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[在庫・価格 :2024年12月12日 00時01分現在]
SPINeasy RNA Kit for Yeast, 50preps
文献数: 0
- 商品コード:6565-050
- メーカー:GEN
- 包装:1kit
- 価格:¥42,000
- 在庫:無(未発注)
- 納期:1週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等:
説明文 | 国内に在庫がなく,海外から取り寄せの場合は納期が異なります。 酵母試料中から30分以内に高純度のRNAを高収率で抽出できるキット。試料破砕装置FastPrep装置により酵母を効率的に溶解した後,精製用カラムでRNAを精製する。SKU:116565050 |
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法規制等 | |||
保存条件 | 法規備考 | ||
掲載カタログ |
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製品記事 | DNA / RNA の抽出・精製および細胞ライセート調製システム FastPrep システム特集 |
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