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水試料から高純度のゲノムDNAを高収率で抽出するキット SPINeasy DNA Kit for Water

掲載日情報:2022/05/20 現在Webページ番号:70707

水試料中から30分以内に高純度のゲノムDNA(gDNA)を高収率で抽出できるキットです。水試料をキットに含まれるFilter membraneでろ過した後、キットに含まれる独自の溶解バッファーと破砕用マトリックス(Lysing Matrix E)、FastPrep装置(別売品)を使用してFilter membraneを処理し、含まれる様々なタイプの細胞を効果的に溶解後、gDNAに対する高い結合能力と選択性を有する精製用カラムでゲノムDNAを分離します。
様々な試料からFastPrep装置を用いてゲノムDNAを抽出する☞ FastDNA SPIN Kit / FastDNA Kitシリーズの詳細についてはこちらを、☞ Lysing Matrixの単独製品についてはこちらをご覧下さい。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。

SPINeasy DNA Kit for Waterの外観

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SPINeasy DNA Kit for Waterの外観

FastPrep-24-5G

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特長

  • キットに含まれる独自の溶解バッファー破砕用ビーズと、FastPrep装置で、水試料を処理したFilter Membraneに含まれる様々な細胞を効果的に溶解できます。
  • わずか30分以内でゲノムDNAを高収率で抽出できます。
  • キットに含まれるカラムはゲノムDNAへの高い結合能力と選択性をを有しており、他社製品を使用して得られたゲノムDNAと比較して汚染物質のレベルが低く、高純度なゲノムDNAが得られます。
  • 得られたゲノムDNAは、PCR、制限酵素処理、シークエンシングなどのアプリケーションに使用できます。

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水試料のフィルターろ過のステップの操作方法概略

SPINeasy DNA Kit for Waterの外観

  1. 準備:吸引ろ過装置にFilter membraneをセットする。
  2. ろ過:装置が許容できる最大量の水試料をろ過する。
  3. Filter membraneの取り出し:ピンセットを使用してろ紙を取り出す。
  4. ろ紙を丸める:Filter membraneを筒状に丸める(この際、微生物相をトラップした側を内側にする)。
  5. チューブへの挿入:Filter membraneをLysing matrix Eチューブに入れた後、本製品を用いてゲノムDNA抽出を行う。

吸引ろ過装置が別途必要です。

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使用例

様々なタイプの水試料から本製品で抽出したゲノムDNAの品質

様々なタイプの水試料において、本製品は高純度かつ高収量でゲノムDNAを抽出できることが示された。

試料の種類 処理量
(ml sample)
収量
(ng/μl sample)
A260 / 280 A260 / 230
河川水 100 46.22 1.88 1.90
池水 165 19.85 1.86 2.32
海水 1,000 28.39 1.92 2.00
下水 15 120.32 1.83 1.65

本製品で抽出したゲノムDNAの電気泳動像

SPINeasy DNA Kit for Waterで抽出したゲノムDNAの電気泳動像
  • M:1kb plus DNA ladder
  • M1:河川水(2μl)
  • M2:池水(2μl)
  • M3:海水(2μl)
  • M4:下水(0.5μl)
  • (-):ネガティブコントロール

いずれの水試料からも損傷がないゲノムDNAが得られた。


抽出したゲノムDNAを用いた16S rRNA遺伝子のPCRによる増幅

SPINeasy DNA Kit for Waterで抽出したゲノムDNAの16S rRNA遺伝子のPCRによる増幅
  • M:1kb plus DNA ladder
  • M1:河川水
  • M2:池水
  • M3:海水
  • M4:下水

得られたゲノムDNAにはPCR阻害物質が含まれていないため、問題なくPCRが行えた。


抽出したゲノムDNAを用いたITS領域のPCRによる増幅

SPINeasy DNA Kit for Waterで抽出したゲノムDNAからのITS-PCRによる増幅
  • M:1kb plus DNA ladder
  • M1:河川水
  • M2:池水
  • M3:海水
  • M4:下水
  • (-):ネガティブコントロール

得られたゲノムDNAにはPCR阻害物質が含まれていないため、問題なくPCRが行えた。

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他社製品との比較例

本製品および他社製品にて、様々なタイプの水試料からゲノムDNAを抽出し、純度(A260 / 280およびA260 / 230)、収率(ng/μl)および電気泳動におけるバンドを比較した。本製品は、幅広い水試料から一貫して高純度かつ高収量でゲノムDNAが抽出できることが示された。


各種水試料から本製品および他社製品で抽出したゲノムDNAの純度(A260 / 280)の比較

各種水試料から本製品および他社製品で抽出したゲノムDNAの純度(A260 / 280)の比較

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各種水試料から本製品および他社製品で抽出したゲノムDNAの純度(A260 / 280)の比較

DNAの純度について、A260 / 280は1.8に近いものが高純度(図中の赤線


各種水試料から本製品および他社製品で抽出したゲノムDNAの純度(A260 / 230)の比較

各種水試料から本製品および他社製品で抽出したゲノムDNAの純度(A260 / 230)の比較

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各種水試料から本製品および他社製品で抽出したゲノムDNAの純度(A260 / 230)の比較

A260 / 230は>1.00が高純度(図中の赤線)。


各種水試料から本製品および他社製品で抽出したゲノムDNAの収量の比較

各種水試料から本製品および他社製品で抽出したゲノムDNAの収量の比較

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各種水試料から本製品および他社製品で抽出したゲノムDNAの収量の比較


電気泳動による比較

SPINeasy DNA Kit for Waterの電気泳動による比較

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  • M:1kb plus DNA ladder
  • 本製品:(M1:河川水、M2:池水、M3:海水、M4:下水)
  • 他社製品A:(A1:河川水、A2:池水、A3:海水、A4:下水)
  • 他社製品B:(B1:河川水、B2:池水、B3:海水、B4:下水)

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キット内容

  • Lysing matrix E
  • Lysis buffer W1 / W2
  • RNase A solution
  • Inhibitor removal W
  • Binding buffer W
  • Wash buffer W1/W2
  • DES buffer (DNA elution solution)
  • Filter membrane
  • Column W1
  • 1.5 / 2.0 ml collection tube

必要な装置、試薬類については製品マニュアルをご確認下さい。


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価格

[在庫・価格 :2024年04月26日 19時15分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
SPINeasy DNA Kit for Water, 50preps
1週間程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
国内に在庫がなく,海外から取り寄せの場合は納期が異なります。 水試料中から30分以内に高純度のゲノムDNAを高収率で抽出できるキット。水試料をFilter membraneでろ過した後,試料破砕装置FastPrep装置により試料中の細胞を効率的に溶解し,精製用カラムでゲノムDNAを精製する。SKU:116536050
法規制等
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2023年2月1日号 p.16

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SPINeasy DNA Kit for Water, 50preps

文献数: 0

説明文 国内に在庫がなく,海外から取り寄せの場合は納期が異なります。 水試料中から30分以内に高純度のゲノムDNAを高収率で抽出できるキット。水試料をFilter membraneでろ過した後,試料破砕装置FastPrep装置により試料中の細胞を効率的に溶解し,精製用カラムでゲノムDNAを精製する。SKU:116536050
法規制等
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掲載カタログ ニュース2023年2月1日号 p.16

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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