世界初！シングルセルドロップレットPCRを用いたコピー数異常細胞の高感度定量 SinChroによる染色体・遺伝子コピー数解析受託サービス

主要な固形腫瘍や血液腫瘍では、染色体の欠失、または増幅（コピー数異常）が高頻度に起こっていることが知られています。例えば、染色体13番の欠失は多発性骨髄腫（MM: Multiple Myeloma）のおよそ50％、慢性リンパ性白血病（CLL: Chronic Lymphocytic Leukemia）のおよそ80％で起こっています¹。また、大腸がんでは染色体18番の長腕の欠失がおよそ50％の症例で報告されています²。さらに、iPS細胞やES細胞は長期間にわたる培養で、染色体の異常を生じることが知られています。
従来、これらの測定はFISHなどの細胞遺伝学的解析、またはPCRや次世代シークエンスといった分子生物学的解析によって行われてきました。しかし、FISHはスループット性が低いため大規模解析には向きません。また、PCRや次世代シークエンスでは、解析細胞集団から抽出されたDNAを対象に細胞集団のターゲットのコピー数の平均値解析を行うため、コピー数異常細胞の割合が少ない場合は測定値（平均値）が正常と変わらず、異常細胞が存在したか見分けがつかなくなる問題がありました。
（株）TL Genomicsが新たに開発したSinChro法は、これらの課題を解決した画期的な染色体異常検出技術になります。

■ 参考文献
1. 日本内科学会雑誌第100巻第7号・平成23年7月10日
2. Baudis, M., BMC Cancer, 7:226 (2007). [PMID: 18088415]

SinChroは、デジタルPCR機器を用いてシングルセルドロップレットPCRを行う技術です。細胞集団試料中のひとつひとつの細胞を微小な区画（ナノリットルサイズ）に封じ込め、その区画内で細胞からのDNA抽出とDNA増幅を行い、独自の手法を用いてターゲット遺伝子のコピー数を蛍光強度に変換し、区画ごとに解析を行います。これによって、それぞれの細胞のターゲット遺伝子のコピー数を測定します。
FISHなどの従来技術では、コピー数異常細胞の割合は数％以下のレベルでは正確に検出できませんでしたが、本技術では一度に10,000個の細胞を測定し、10個程度しか存在しないコピー数異常細胞でも検出・定量できます（感度0.1％程度）。