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カスタムRNA合成サービス

掲載日情報:2020/12/03 現在Webページ番号:69454

独自技術である2'-ACE合成ケミストリを用いた、Horizon Discovery社 DharmaconのカスタムRNA合成サービスです。高品質な長鎖RNAオリゴヌクレオチドを高収量で合成し、用途に応じて、適切な精製方法を選択できます。豊富な化学修飾および蛍光標識オプションがあります。新たに、GalNAc修飾やEVP-mU修飾を含むカスタムRNAの合成にも対応可能となりました。

本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
Dharmacon製品(メーカー略称:DHA)につきまして、2023年4月1日より製品ご注文時にHandling Fee(手数料)を本体価格とは別にご請求させていただきます。詳細は「Handling Feeについてのご案内」をご確認下さい。

特長

  • 特許取得の2'-ACE合成ケミストリにより、高品質・高収量のRNA合成を実現します。
  • さまざまなアプリケーションに使用できる、豊富な化学修飾および蛍光標識オプションがあります。
  • 目的に応じて精製方法を選択できます。
  • 長鎖かつ高収量の一本鎖RNA合成が可能です。
    一本鎖RNA:2~120 mer
    より長鎖をご希望の場合はご相談下さい。RNA-DNAキメラも合成可能です。
  • in vivoおよび前臨床開発用のより大きなスケールも可能です。
  • 長鎖RNAオリゴヌクレオチドは、下記のような研究用途に使用できます。
    microRNAインヒビター、アプタマー、リボザイム、tRNA、FISH/ISHプローブ、FRETプローブ、RNA/DNAハイブリッド、カスタム二本鎖RNA、ダイサー基質、アンチセンスオリゴ、酵素基質

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特許取得の2'-ACE合成ケミストリ

Horizon Discovery社の合成オリゴヌクレオチド製造は、特許取得済みの5'-シリル-2'-アセトキシエチルオルトエステル(2'-ACE)ケミストリに基づいており、高速かつ効率的なカップリングにより、全長オリゴをより確実に生成します。2'-ACEを用いたRNA合成ケミストリは、新しい保護基スキームに基づいています。シリルエーテルにより5'-ヒドロキシル基を保護し、酸により不安定化するオルトエステルが2'-ヒドロキシルを保護します。この合成技術は、他の方法(例:2'-tert-ブチルジメチルシリルエーテル、TBDMS)よりも純度が高く、未修飾一本鎖RNA(35 nt未満)では通常80~85%です。


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選択可能な塩基と化学修飾のラインナップ

Modification Short Code
Standard RNA Bases A, C, G, U A,C,G,U
2'-O-Methyl RNA Bases 2'-OMe RNA Bases (A, C, G, U) mA,mC,mG,mU
Standard DNA Bases 2'-Deoxy Bases (A, C, G, T) dA,dC,dG,dT
Base Modifications 1-Methyl-guanosine m1G
2,6-DiaminopurineDAP
2-Methyl-adenosinem2A
2-Aminopurine2AP
4-Thio-uridine4-S-U
5-Bromo-UridineU[5Br]
5-Fluoro-cytidineC[5F]
5-Fluoro-uridineU[5F]
5-Iodo-uridineU[5I]
5-Methyl-cytidine5-M-C
5-Methyl-Deoxycytidine5-M-dC
5-Methyl-uridinerT
InosineI
N3-Methyl-uridine3-M-U
N6,N6-Dimethyl-adenosineDMA
N6-Methyl-adenosinem6A
Pseudouridine~U
Purine ribonucleosidePu
Pyrrolo-cytidinepC
RibavirinRBV
Backbone ModificationsPhosphorothioate*
Phosphorylation5'-Phosphate5'-P
2'-Modifications2'-Amino-butyryl-pyrene-uridine2'-P-U
2'-Amino-cytidine2'-N-C
2'-Amino-uridine2'-N-U
2'-Deoxy-uridinedU
2'-Fluoro-adenosine2'-F-A
2'-Fluoro-cytidine2'-F-C
2'-Fluoro-guanosine2'-F-G
2'-Fluoro-uridine2'-F-U
2'-OMe-inosinemI
Amino Modifiers3'-Amino modifier C12N12-3'
3'-Amino modifier C6N6-3'
5'-Amino modifier C12N12
5'-Amino modifier C3N3
5'-Amino modifier C5N5
5'-Amino modifier C6N6
5-Aminohexylacrylamino-uridine5-LC-N-U
Thiol Modifiers3'-Disulfide thiol-modifierS-S-3'
5'-Disulfide thiol-modifierS-S
Spacer ModifiersC18 Spacer18S
C3 SpacerC3
C9 Spacer9S
dSpacerdab
rSpacerrab
Chain Terminators3' Inverted abasicb
3' Inverted deoxy-thymidineidT-3'
3'-Terminal 3'-Deoxy-Guanosine3'dG
3'-Terminal dideoxy-cytidineddC
5' Inverted deoxy-thymidineidT
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-adenosine5'dA
Chain Terminators5' Terminal 5'-deoxy-ribo-cytidine5'dC
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-guanosine5'dG
5' Terminal 5'-deoxy-ribo-uridine5'dU
Labeling3'-Biotin3'-Bi
3'-Cholesterol3'-Chl
3' TEG-CholesterolTEG-Chl-3'
3'-Cy3Cy3-3'
3'-Cy5Cy5-3' or N6-Cy5
3'-Cy5.5Cy5^5-3'
3' Black Hole Quencher 1BHQ-1-3'
3' Black Hole Quencher 2BHQ-2-3'
3'-Fluorescein3'-Fl
3'-Biotin LC3'-LCBi
3'-Biotin LC LC3'-2LCBi
3'-PuromycinPmn
3'-TAMRA3'-TAM
3'-N-Acetylgalactosamine (GalNAc) ClusterGalNAc-TEG
5'-BiotinBi
5'-CholesterolChl
5' Cholesterol-TEGChl-TEG
5'-Cy3Cy3
5'-Cy5Cy5
5'-Cy5.5Cy5^5
5' Black Hole Quencher 1BHQ-1
5' Black Hole Quencher 2BHQ-2
5'-DabcylDabcyl
5'-FluoresceinFl
5'-Pyrene5'-Pyr
5'-TAMRATAM
5'-TETTET
5'-(E)-vinylphosphonate (EVP, E-VP, VP) 2'-O-methyl Uridine (mU)EVP-mU
5'-N-Acetylgalactosamine (GalNAc) ClusterGalNAc
Degenerate BasesdNdN
dSdS
dWdW
mNmN
rNrN
rSrS
rWrW

3'-N-Acetylgalactosamine Cluster(GalNAc-TEG)および5'-N-Acetylgalactosamine Cluster(GalNAc)

GalNAc(N-アセチルガラクトサミン)は小型の糖鎖リガンドであり、肝細胞への送達を目的として、しばしばオリゴヌクレオチドに化学的に結合されます。GalNAcは一般に、三分岐(トリアンテナリー、3アーム)構造のGalNAcクラスターとして、オリゴヌクレオチドの3’末端または5’末端に結合されますが、その具体的な構造は場合によって異なります。GalNAcは、siRNA、miRNA、DNAアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)、その他のRNA分子に広く使用されています。GalNAcはアシアロ糖タンパク質受容体(ASGPR)のリガンドとして機能し、肝細胞への高い特異性を有する取り込みを可能にします。また、GalNAcは、2’-フルオロ修飾や2’-O-メチル修飾塩基、ホスホロチオエート結合、さらに場合によっては5’-(E)-ビニルホスホネート修飾など、他の化学修飾と組み合わせて用いられることが多くあります。


EVP-mU

5′-(E)-ビニルホスホネートは、代謝的に安定な5’リン酸ミミックであり、Ago2による認識を保持したまま、siRNAおよびその他のRNAiオリゴヌクレオチドのin vivoにおける安定性、効力(ポテンシー)、および作用持続性を向上させます。この修飾は、2′-フルオロ修飾や2′-O-メチル修飾塩基、ホスホロチオエート結合などの他の化学修飾と併用されることが多く、さらにGalNAcやコレステロールを結合したsiRNAやRNA分子と組み合わせて使用されることも一般的です。



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ご注文方法

Dharmacon カスタムRNAは、Horizon Discovery社Webサイトで合成スケール、化学修飾、精製の有無などを選択し、お見積もりをご確認いただけます。選択肢でご不明の場合はお問い合わせ下さい。カスタムsiRNAの場合はこちらからお見積もりをご確認下さい。

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