様々なタイプの土壌試料から高収率かつ高純度のゲノムDNAを抽出するキット SPINeasy DNA Kit for Soil
掲載日情報：2020/12/11 現在Webページ番号：68233
様々なタイプの土壌試料から、腐植物質などを含まない高純度のゲノムDNAを30分以内に高効率で抽出できるキットです。
キットに含まれる破砕用ビーズLysing Matrix Eと試料破砕装置FastPrep装置の組み合わせによりバクテリア、真菌類、ウイルス、原生生物を含む幅広い生物を効率的に溶解した後、精製用カラムでゲノムDNAを精製します。
※ 様々な試料からFastPrep装置を用いてゲノムDNAを抽出するFastDNA SPIN Kit / FastDNA Kitシリーズの詳細についてはこちらを、Lysing Matrixの単独製品についてはこちらをご覧下さい。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
SPINeasy DNA Kit for Soilの外観
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特長
- 試料中の細胞を効果的に破砕し、DNAを放出させることができるため、マイクロバイオーム研究においての偏りのない結果が得られます。
- キットに含まれるバッファーは、放出されたDNAを保護し、不要なRNA、腐植物質やその他のPCR阻害物質を除去するため、損傷がなく高純度なゲノムDNAが得られます。
- キットに含まれるカラムは、ゲノムDNAに対する高い結合能力と選択性を有し、また大容量の液体をアプライできるため、アプライ操作の回数を減らすことができます。
- 得られたゲノムDNAは、PCR、制限酵素処理、シークエンシングなどのアプリケーションに使用できます。
- 試料量：100～500 mg土壌試料
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使用例
様々なタイプの土壌試料から本キットで抽出したゲノムDNAの品質
様々なタイプの土壌試料において、本キットは高純度かつ高収量でゲノムDNAを抽出できることが示された。
| 試料の種類 | 収量（ng/mg sample） | A260 / 280 | A260 / 230 |
|---|---|---|---|
| 有機質土壌 | 47.78±0.21 | 1.79±0.01 | 1.10±0.02 |
| 水田の土 | 16.03±0.06 | 1.94±0.01 | 1.70±0.04 |
| 花壇の土 | 14.88±0.65 | 1.84±0.01 | 1.20±0.04 |
| 塩成土壌 | 7.55±0.65 | 1.89±0.01 | 1.40±0.00 |
| 砂漠の土 | 1.64±0.19 | 1.85±0.06 | 1.02±0.00 |
本キットで抽出したゲノムDNAの電気泳動像
lane M: 1 kb DNA ladder、lane 1: 有機質土壌、lane 2: 水田の土、
lane 3: 花壇の土、lane 4: 塩成土壌、lane 5: 砂漠の土
いずれの土壌試料からも損傷がないゲノムDNAが得られた。
抽出したゲノムDNAからの16S rRNA遺伝子のPCRによる増幅
lane M: 1 kb DNA ladder、lane 1: 有機質土壌、lane 2: 水田の土、lane 3: 花壇の土、
lane 4: 塩成土壌、lane 5: 砂漠の土、lane 6: ネガティブコントロール
得られたゲノムDNAにはPCR阻害物質が含まれていないため、PCRが行えた。
他社製品との比較
本キットおよび各社キットにて、様々な土壌試料からゲノムDNAを抽出した（上：収量、中央：A260 / 280、下：A260 / 230）。
DNAの純度について、A260 / 280は1.8に近いものが高純度（図中の赤線）、A260 / 230は＞1.00が高純度。
本キットは、幅広い土壌試料から一貫して高純度かつ高収量でゲノムDNAが抽出できることが示された。
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キット内容
- Lysing matrix E
- Lysis buffer S1 / S2
- RNase A solution
- Inhibitor removal S
- Binding buffer S
- Wash buffer S
- DES buffer (DNA elution solution)
- Column S1
- 1.5 / 2.0 ml collection tube
※ 必要な装置、試薬類については製品マニュアルをご確認下さい。
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価格
[在庫・価格 ：2024年04月20日 13時35分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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納期 | 文献数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SPINeasy DNA Kit for Soil, 50 preps 変更先製品 |
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本製品は製品内容等が変更されました
変更先製品 |
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[在庫・価格 ：2024年04月20日 13時35分現在]
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