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Oxford Nanopore Technologies社装置用の短鎖RNAライブラリー構築キット CircAID-p-seq Kit

掲載日情報:2019/12/11 現在Webページ番号:68156

20~50 ntの短鎖RNA試料から、独自のCircAID-p-seq テクノロジーにより、PCRを用いずにOxford Nanopore Technologies社装置(ロングリードシークエンサー)用の高品質なライブラリーをわずか1日で構築できるキットです。
ライブラリーの構築にはDirect cDNA Sequencing Kit(Oxford Nanopore Technologies社)が別途必要です。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


CircAID-p-seqテクノロジーについて

CircAID-p-seq(Circular Amplification and IDentification of short RNA sequences bearing a 3’ Phosphate)は、3’末端がリン酸化(または環状リン酸化)された短鎖RNA試料(3'-P / 2',3'-cP RNA)から特異的にcDNA合成を行い、ライブラリーを構築する技術です。
RNA試料へのリンカーのライゲーション、RNAの環状化、RT-ローリングサークル増幅(RT-RCA, Reverse Transcription-Rolling Circle Amplification)の組み合わせにより構成されています。


CircAID-p-seqの概略

Step1:3’末端がリン酸化(または環状リン酸化)されたRNA試料(3'-P / 2',3'-cP RNA)にPK(Polynucleotide Kinase) enzymeを加え、5’末端をリン酸化する。
Step2:3'-P / 2',3'-cP RNAにLinker Rをライゲーションする。
Step3~4:RNA試料を環状化する。
Step5:逆転写により一本鎖cDNAを合成する。
Step6:相補的なDNAの合成により、二本鎖cDNAとする。
Step7:Oxford Nanopore Technologies(ONT)社のDirect cDNA Sequencing Kit(#SQK-DCS109)を用いてライブラリー構築をする。


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適用

  • RNAフットプリンティング
  • リボソームプロファイリング
  • トランスクリプトーム解析

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Memo:Immagina BioTechnology社のリボソーム解析用製品群について


Immagina BioTechnology社のリボソーム解析用製品群について

RiboLace Kit / LACEseq KitおよびAHARIBO Kitの詳細については、それぞれ該当のページをご覧下さい。


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キット内容

  • Buffer PK
  • PK enzyme
  • ATP
  • Buffer A / B
  • Enzyme mix A / B
  • MnCl2
  • GTP
  • Linker R
  • PEG 8000
  • Nuclease
  • Buffer N
  • P1 / P2 oligo
  • Buffer RT
  • RT enzyme
  • dNTPs
  • HI solution
  • Enhanced buffer
  • Buffer Taq
  • Taq

各種試薬や、RNA精製キット(Zymo Research社のRNA Clean & Concentrator-5を推奨)、Direct cDNA Sequencing Kit(Oxford Nanopore Technologies社)などが別途必要です。詳細は製品マニュアルをご確認下さい。


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価格

[在庫・価格 :2024年04月26日 09時55分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
CircAID-p-seq, 6 Reactions
3~4週間 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
20~50 ntの短鎖RNA試料から,独自のCircAID-p-seq テクノロジーにより,PCRを用いずにOxford Nanopore Technologies社装置(ロングリードシークエンサー)用の高品質なライブラリーをわずか1日で構築できるキット。
法規制等
保存条件 -80℃,-20℃,室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年2月15日号 p.20

製品記事 次世代シークエンス(NGS)関連製品特集
関連記事 リボソーム解析の最先端へ(IMMAGINA BioTechnology社)

[在庫・価格 :2024年04月26日 09時55分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。

CircAID-p-seq, 6 Reactions

文献数: 0

説明文 20~50 ntの短鎖RNA試料から,独自のCircAID-p-seq テクノロジーにより,PCRを用いずにOxford Nanopore Technologies社装置(ロングリードシークエンサー)用の高品質なライブラリーをわずか1日で構築できるキット。
法規制等
保存条件 -80℃,-20℃,室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年2月15日号 p.20

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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