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DNA・RNAの1塩基変異をシングルセル、1分子レベルで検出可能 mutaFISH Probe

掲載日情報：2019/05/13 現在Webページ番号：68119

アブノヴァ /
Abnova Corporation
[メーカー略称：ABN]

mutaFISH（mutation-specific Fluorescence in situ Hybridization）は、padlock probeとin situでのRCA（Rolling Cycle Amplification）法の組み合わせにより、組織・細胞試料中のDNA・RNAの変異検出を行う手法です。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。

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特長

  • DNAおよびRNAの1塩基変異をシングルセル、1分子レベルで検出でき、点変異やSNPの検出に有用です。
  • 組織切片、培養細胞、循環腫瘍細胞などからの検出が行えます。
  • dPCR（デジタルPCR）やNGS（次世代シークエンシング）よりも高感度です。
  • マルチプレックスアッセイや、他の解析法との併用が可能です。
  • DNAやRNAの抽出操作は不要です。

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使用例

培養細胞

培養細胞での検出
CytoQuest CRで捕捉したCWR22Rv1細胞（ヒト由来）をmutaFISHで検出した。
橙色：AR-V7（Cy3標識）、赤色：ARwt（Cy5標識）


CTC

循環腫瘍細胞（CTC）での検出
非小細胞肺がん（NSCLC）患者由来のCTCをmutaFISHで検出した。
橙色：EGFR L858R点変異（Cy3標識）、紫色：EGFR Ex19wt（Texas Red標識）、緑色：抗CSV抗体（FITC標識）でCTCの蛍光免疫染色


凍結組織

新鮮凍結組織切片での検出
ヒト肺腺がんの新鮮凍結組織切片をmutaFISHで検出した。
橙色：EGFR L858R点変異（Cy3標識）、赤色：EGFR L858wt（Cy5標識）、緑色：EGFR Ex19wt（Texas Red標識）


FFPE

ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織切片での検出
ヒト乳がんのFFPE組織切片をmutaFISHで検出した。
赤色：HER2（Cy5標識）


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操作方法概略

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mutaFISH原理の動画



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mutaFISHおよび従来のFISHそれぞれの適用

適　用 mutaFISH FISHによる
DNA解析		 FISHによる
RNA解析
点変異検出 ○ × ×
コピー数異常検出
（増幅／欠損）		 ○ ○ ×
転座検出 ○ ○ ×
遺伝子発現解析 ○ × ○

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参考文献

  • "In situ mutation detection and visualization of intratumor heterogeneity for cancer research and diagnostics."
    Grundberg, I., et al., Oncotarget, 4 (12), 2407-2418 (2013)

  • "In situ detection and genotyping of individual mRNA molecules."
    Larsson, C., et al., Nat. Methods., 7 (5), 395-397 (2010)

  • "Lock and roll: single-molecule genotyping in situ using padlock probes and rolling-circle amplification."
    Nilsson, M., Histochem. Cell. Biol., 126 (2), 159-164 (2006)

  • "In situ genotyping individual DNA molecules by target-primed rolling-circle amplification of padlock probes."
    Larsson, C., et al., Nat. Methods., 1 (3), 227-232 (2004)

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価格

■ DNA検出用mutaFISH Probe

[在庫・価格 ：2024年04月19日 20時55分現在]

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mutaFISH CEP1wt CEP7wt CEP8wt CEP17wt DNA Probes
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別名：MODED，N-myc，NMYC，ODED，bHLHe37
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[在庫・価格 ：2024年04月19日 20時55分現在]

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mutaFISH ACTBwt RNA Probes
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別名：AIS，DHTR，HUMARA，KD，NR3C4，SBMA，SMAX1，TFM
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別名：CK7，K2C7，K7，MGC129731，MGC3625，SCL
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説明文 組織・細胞試料内のRNAの1塩基変異を高感度に検出するプローブ。検出にはmutaFISH RNA Accessory Kitが必要。
別名：IFG，IFI
Genbank No： 3458
法規制等
保存条件 法規備考
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mutaFISH KRAS G12wt G13wt RNA Probes

文献数： 0

説明文 組織・細胞試料内のRNAの1塩基変異を高感度に検出するプローブ。検出にはmutaFISH RNA Accessory Kitが必要。
別名：C-K-RAS，K-RAS2A，K-RAS2B，K-RAS4A，K-RAS4B，KI-RAS，KRAS1，KRAS2，NS3，RASK2
Genbank No： 3845
法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
掲載カタログ

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mutaFISH MAMwt RNA Probes

文献数： 0

説明文 組織・細胞試料内のRNAの1塩基変異を高感度に検出するプローブ。検出にはmutaFISH RNA Accessory Kitが必要。
別名：MGB1，MGC71974，UGB2
Genbank No： 4250
法規制等
保存条件 法規備考
掲載カタログ

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mutaFISH PD-L1wt RNA Probes

文献数： 0

説明文 組織・細胞試料内のRNAの1塩基変異を高感度に検出するプローブ。検出にはmutaFISH RNA Accessory Kitが必要。
別名：B7-H，B7H1，MGC142294，MGC142296，PD-L1，PDCD1L1，PDCD1LG1，PDL1
Genbank No： 29126
法規制等
保存条件 法規備考
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mutaFISH PSAwt RNA Probes

文献数： 0

説明文 組織・細胞試料内のRNAの1塩基変異を高感度に検出するプローブ。検出にはmutaFISH RNA Accessory Kitが必要。
別名：APS，KLK2A1，PSA，hK3
Genbank No： 354
法規制等
保存条件 法規備考
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mutaFISH PSCAwt RNA Probes

文献数： 0

説明文 組織・細胞試料内のRNAの1塩基変異を高感度に検出するプローブ。検出にはmutaFISH RNA Accessory Kitが必要。
別名：PRO232
Genbank No： 8000
法規制等
保存条件 法規備考
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mutaFISH TERTwt RNA Probes

文献数： 0

説明文 組織・細胞試料内のRNAの1塩基変異を高感度に検出するプローブ。検出にはmutaFISH RNA Accessory Kitが必要。
別名：EST2，TCS1，TP2，TRT，hEST2
Genbank No： 7015
法規制等
保存条件 法規備考
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■ Accessory Kit

[在庫・価格 ：2024年04月19日 20時55分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
 納期 文献数
mutaFISH DNA Accessory Kit 1 for Cell
 2～3週間 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
mutaFISH法で組織・細胞試料内のDNAを検出する際に用いる酵素・バッファー類のセット。
法規制等
保存条件 法規備考
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mutaFISH DNA Accessory Kit 2 for Cell
 2～3週間 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
mutaFISH法で組織・細胞試料内のDNAを検出する際に用いる酵素・バッファー類のセット。
法規制等
保存条件 法規備考
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mutaFISH RNA Accessory Kit
 2～3週間 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
mutaFISH法で組織・細胞試料内のRNAを検出する際に用いる酵素・バッファー類のセット。
法規制等 医薬用外劇物
保存条件 4℃,-20℃ 法規備考
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[在庫・価格 ：2024年04月19日 20時55分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。

mutaFISH DNA Accessory Kit 1 for Cell

文献数： 0

説明文 mutaFISH法で組織・細胞試料内のDNAを検出する際に用いる酵素・バッファー類のセット。
法規制等
保存条件 法規備考
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mutaFISH DNA Accessory Kit 2 for Cell

文献数： 0

説明文 mutaFISH法で組織・細胞試料内のDNAを検出する際に用いる酵素・バッファー類のセット。
法規制等
保存条件 法規備考
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mutaFISH RNA Accessory Kit

文献数： 0

説明文 mutaFISH法で組織・細胞試料内のRNAを検出する際に用いる酵素・バッファー類のセット。
法規制等 医薬用外劇物
保存条件 4℃,-20℃ 法規備考
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■ 細胞染色試薬

[在庫・価格 ：2024年04月19日 20時55分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
 納期 文献数
Calcein AM
 10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
法規制等
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DAPI
 10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
法規制等
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Hoechst 33342
 10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 4
説明文
法規制等
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Propidium Iodide
 10日程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
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[在庫・価格 ：2024年04月19日 20時55分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。

Calcein AM

文献数： 0

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DAPI

文献数： 0

説明文
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Hoechst 33342

文献数： 4

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文献数： 0

説明文
法規制等
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（テクニカルサポート 試薬担当）

reagent@funakoshi.co.jp

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