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新型コロナウイルス(COVID-19)RNA依存性RNAポリメラーゼ活性測定キット SARS-CoV-2 RNA Polymerase(RdRp)Assay Kit

掲載日情報:2021/05/17 現在Webページ番号:67218

COVID-19を引き起こす新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)のRNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)活性を測定するキットです。マイクロプレート(96ウェル、384ウェル)と蛍光色素で測定するキット、電気泳動ゲルで測定するキットがあり、ハイスループットスクリーニングや阻害現象の可視化に最適です。


新型コロナウイルスのRNA依存性RNAポリメラーゼとは

COVID-19のパンデミックは、プラス鎖一本鎖RNAウイルスである、SARS-CoV-2の感染によって引き起こされます。SARS-CoV-2ゲノムの複製と遺伝子の転写にはRNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)が必要なため、RdRp阻害物質はこのウイルスに対する重要な創薬ターゲットです。



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特長

  • RNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)により合成されたRNA分子を蛍光色素により定量し、RdRp活性を測定します。
  • RdRp活性を標的とした阻害物質のハイスループットスクリーニングなどに有用です。
  • マイクロプレート方式の場合:酵素生成物の定量に蛍光色素を利用します(測定波長:励起485 nm/蛍光535 nm)。
  • ゲルベースアッセイの場合:ポリアクリルアミドゲル電気泳動を行った後に、合成されたRNAをSYBR Green Ⅱで可視化します。

SYBR Green Ⅱはキットに含まれていません。別途ご用意下さい。

    
品名 RdRp アッセイ数商品コード
384 wells 96 wells Gel base
SARS-CoV-2 RNA Polymerase Assay Kit-100 100 50 S2RPA100K
SARS-CoV-2 RNA Polymerase Assay Kit plus-20 20 10 S2RPA020KE
SARS-CoV-2 RNA Polymerase Assay Kit plus-100 100 50 S2RPA100KE
Gel-based SARS-CoV-2 RdRp Assay Kit 20 GS2RPA020KE


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使用例

マイクロプレートアッセイの例

マイクロプレートアッセイの例

左図:本アッセイ系がNTP(基質)依存性であることを確認した。
図中央:抗ウイルス性物質であるレムデシビルの活性型RDV-TP(三リン酸型)による阻害が見られた。
右図:RdRpは2価金属依存性と報告されており、EDTA添加で阻害が見られた。



マイクロプレートアッセイとゲルベースアッセイとの比較

マイクロプレートアッセイとゲルベースアッセイとの比較

左図:縦軸に蛍光強度を取り、横軸はそれぞれ完全なアッセイ系、RdRp非添加、NTP非添加、阻害物質(活性型レムデシビル)添加、EDTA添加の場合を示した。阻害物質やEDTA添加では阻害が見られた。
右図:ゲルベースアッセイの場合も同様の実験系を組み、反応生成物をポリアクリルアミドゲル電気泳動後にSYBR Green Ⅱで染色した。マイクロプレートアッセイと同様に、完全系以外での阻害が目視にて観察できた。



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操作方法概略

  1. 水、バッファー、テンプレート、RNAポリメラーゼ、NTPsを混合して反応液を調製する。
  2. 34℃で2時間インキュベートする。
  3. 反応液にFluorescence dyeを加え、蛍光強度を測定する(マイクロプレートアッセイ)。
  4. TAE bufferでポリアクリルアミドゲル電気泳動後、SYBR Green Ⅱで染色し観察する(ゲルベースアッセイ)。


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キット内容

  • Buffer
  • RNA template
  • NTPs(ATP, UTP, GTP, CTP)
  • Fluorescence dye(マイクロプレートアッセイ法のみ)
  • SARS-CoV-2 RdRp(#S2RPA020KE, #S2RPA100KEのみ)
  • Gel loading buffer(#GS2RPA020KEのみ)

マイクロプレートアッセイ法:マイクロプレート(96ウェルあるいは384ウェル)およびこれらに対応した蛍光プレートリーダーが必要です。
ゲルベースアッセイ法:電気泳動システムおよびSYBR Green Ⅱが必要です。別途ご用意下さい。



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参考文献

米国NIH国立先進トランスレーショナル科学センター(NCATS)の Yang らは、ProFoldin社のウイルスRNAポリメラーゼアッセイキットを用いて、エメチンの抗ウイルス作用を検討しました。
Yang S. et al., Cell Discov., 4, 31 (2018).【PMID: 29872540



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価格

[在庫・価格 :2024年04月20日 19時35分現在]

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SARS-CoV-2 RNA Polymerase Assay Kit-100 (100assays)
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reagent@funakoshi.co.jp

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