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Human Protein Atlasウェブサイト 検索例
掲載日情報：2012/09/19 現在Webページ番号：6719
検索ワード入力欄 右の「Fields」ボタンにより、様々な検索を行うことができます。
「Fields」ボタンをクリックすると、3つの入力欄が現れます。
1番左から、AND検索とNOT検索を選択できます。
真中からは、「特定の染色体タンパク質」「特定の細胞内箇所に局在しているタンパク質」「指定の適用を確認しているタンパク質」「特定の組織に発現しているタンパク質」といった条件を指定できます。
このような「Field」の設定により、組織・細胞を特定したり発現レベルを限定したり、お知りになりたい情報を絞り込むことができます。
「Add」ボタンをクリックすると、入力した条件で検索することができます。
なお、検索結果一覧の画面において「Fields」ボタンをクリックするとさらに検索条件を追加することができます。
以下に例を示します。
追加しました。
1. 臓器による検索
1-1. 女性生殖器系において中程度以上、組織の25%以上に発現が見られる一方で、男性生殖器系には一切の発現が見られないタンパク質の検索
- 「Fields」ボタンをクリック
- Field欄で「Organ expression (IH)」を選択
- Organ欄で「Breast and female reproductive system (Female tissues)」を選択
- Fraction tissues欄で「>」, 「50%」を選択
- Expression field欄で「Moderate」と「Strong」をクリックして選択
- 「Add」ボタンをクリックした後、「Fields」ボタンをクリック
- 一番左の選択欄は「AND」のままにする
- Field欄で「Organ expression (IH)」を選択
- Organ欄で「Male reproductive system (Male tissues) 」を選択
- Fraction tissues欄で「＝」, 「100%」を選択
- Expression field欄で「Negative」を選択
- 「Add」ボタンをクリックした後、「Search」ボタンをクリックして検索
- 検索結果はこちら
1-2. CNSで発現しているが造血細胞では発現していないタンパク質の検索
- 「Fields」ボタンをクリック
- Field欄で「Organ expression (IH)」を選択
- Organ欄で「Central nervous system (Brain)」を選択
- Fraction tissues欄で「>」, 「50%」を選択
- Expression field欄で「Strong」を選択
- 「Add」ボタンをクリックした後、「Fields」ボタンをクリック
- 一番左の選択欄は「AND」のままにする
- Field欄で「Organ expression (IH)」を選択
- Organ欄で「Blood and immune system (Hematopoietic)」を選択
- Fraction tissues欄で「＝」, 「100%」を選択
- Expression field欄で「Negative」を選択
- 「Add」ボタンをクリックした後、「Search」ボタンをクリックして検索
- 検索結果はこちら
追加しました。
2. 細胞による検索
2-1. 糸球体では発現しているが、細管では発現していないタンパク質
- 「Fields」ボタンをクリック
- Field欄で「Tissue expression (IH) 」を選択
- Tissue欄で「Kidney」を選択
- Cell type欄で「Cells in tubules」を選択
- Expression欄で「Negative」を選択
- 「Add」ボタンをクリックした後、「Fields」ボタンをクリック
- 一番左の選択欄は「AND」のままにする
- Field欄で「Tissue expression (IH) 」を選択
- Tissue欄で「Kidney」を選択
- Cell type欄で「Cells in glomeruli」を選択
- Expression欄で「Strong」を選択
- 「Add」ボタンをクリックした後、「Search」ボタンをクリックして検索
- 検索結果はこちら
追加しました。
3. 癌による検索
乳癌特異的に発現しているタンパク質
- 「Fields」ボタンをクリック
- Field欄で「Cancer expression (IH)」を選択
- Tissue欄で「Breast cancer」を選択
- Fraction tissues欄で「>」, 「50%」を選択
- Expression field欄で「Strong」を選択
- 「Add」ボタンをクリックした後、「Fields」ボタンをクリック
- 一番左の選択欄は「AND」のままにする
- Field欄で「Cancer expression (IH)」を選択
- Tissue欄で「Breast cancer」を選択
- Fraction tissues欄で「>」, 「20%」を選択
- Expression field欄で「Negative」を選択
- 「Add」ボタンをクリックした後、「Search」ボタンをクリックして検索
- 検索結果はこちら
追加しました。
4. 細胞内局在、タンパク質クラスによる検索
ミトコンドリアに局在する酸化還元酵素のタンパク質
- 「Fields」ボタンをクリック
- Field欄で「Subcellular location (IF)」を選択
- Location欄で「Mitochondria」を選択
- 「Add」ボタンをクリックした後、「Fields」ボタンをクリック
- 一番左の選択欄は「AND」のままにする
- Field欄で「Protein class」を選択
- Class欄で「Enzymes」を選択
- Subclass欄で「Oxidoreductases」を選択
- 「Add」ボタンをクリックした後、「Search」ボタンをクリックして検索
- 検索結果はこちら
追加しました。
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