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miRNA発現解析（Agilent）受託サービス
マイクロアレイを用いた解析受託サービス miRNA発現解析（Agilent）受託サービス
掲載日情報：2022/01/20 現在Webページ番号：64836
Agilent Technologies社のマイクロアレイを用いてMatureなmiRNAの発現解析を行います。
追加しました。
特長
- Agilent Technologies社のmiRNAマイクロアレイはプローブのヘアピンキャップ構造によりpre/pri-miRNAなどの擬陽性のハイブリダイズを抑えmatureなmiRNAを特異的かつ高感度に検出が可能です。
- 組織細胞由来のTotalRNAはもちろんのこと血清や血漿の培養上清中のmiRNAやexosome由来のmiRNAについても解析が可能です。
- 各miRNAにつき1～4種類のプローブデザインされており、10～20プローブ繰り返しスポットされているデータ信頼度の高いアレイ設計になっております。
- アレイは1枚のスライドに最大8試料を処理できる仕様です。
- 対応生物種はヒト・マウス・ラットとなっております。
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エクソソーム由来miRNA解析
●血清・血漿や細胞培養上清中のエクソソーム由来のmiRNA解析が可能です。キットを用いてエクソソームを単離し、マイクロアレイや次世代シークエンサーを用いてデータを取得します。体液中のエクソソーム由来のバイオマーカー探索に限らず、培養上清を用いた細胞の品質チェックや、in vitroでの検証実験などにもご利用いただいています。
●実施例としてマイクロアレイやPCRを使ったアプリケーションノートをご用意しています。
- アプリケーションノート1（miRNAマイクロアレイ） 血清Exosome由来のmicroRNA発現解析
- アプリケーションノート2（miRNAマイクロアレイ） 血漿Exosome由来のmicroRNA発現解析
- アプリケーションノート3（リアルタイムPCR） 血漿Exosome由来のmicroRNA発現解析
●Agilent Technologies社で発行しているアプリケーションノートは下記からご参照いただけます。DNAチップ研究所は作成協力をしています。
- https://www.chem-agilent.com/pdf/low_5994-1777JAJP_AN_exosomal_miRNA.pdf
- https://www.chem-agilent.com/pdf/5991-7468JAJP.pdf
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サービス概要
- 試料のクオリティチェック（QC）を行います。
- total RNAからターゲットであるmiRNAの3’末端に直接ラベル化（蛍光標識）を行います。
- スキャナーにより蛍光の検出を行い蛍光強度を数値化してmiRNA発現解析を行います。
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データ解析
- Feature Extractionで得られたマイクロアレイのデータを解析ソフトウェアGeneSpring GXで解析いたします。
- 発現変動のみられるmiRNAをFold Change比較やT検定、クラスター解析などにより抽出します。
- さらに、miRNAが標的とする遺伝子をTargetScanにより予測します。
■ターゲットスキャン
miRNAの標的遺伝子の予測プログラムです。
GeneSpring GXのターゲットスキャンツールで、既知のmiRNA-mRNA結合モデルを元に、他のmiRNAがターゲットとする遺伝子の予測を行います。
また、miRNA解析と遺伝子発現解析を同時にご依頼いただいている場合、 ターゲットスキャンによりmiRNAデータと遺伝子発現データを連結して、納品いたします。
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納品物
●試料QC結果（品質検査結果）
- total RNA images / cRNA images（ゲル電気泳動波形画像）
- Sample Data（試料濃度情報）
●Feature Extraction（アレイ実験生データ）
- Raw Data（数値データ）
- Image（アレイ画像）
- QC report（アレイ実験終了品質検査結果）
●解析結果
- 正規化、変動遺伝子抽出、GO解析、Pathway解析
●解説書（アレイ実験・解析の説明書）
※ クラウド経由もしくはUSBメモリ、DVDなどの記憶媒体で納品します。
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納期
試料QC通過後、2か月程度（データ解析を含む場合は2.5か月程度）
※ 相乗りサービスはございません。
※ スライド1枚を占有して行います。
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試料送付について
| RNA量 | 濃度 | OD260/280 | 性状 | |
|---|---|---|---|---|
| total RNA（真核・原核） | 500 ng以上 | 50 ng/μl以上 | 1.5以上 | 28s/18s：1.8以上 推奨RIN値：7以上 |
| total RNA（微量試料） | 500 pg以上 | － | ||
| total RNA（FFPE由来） | 100 ng以上 | 10 ng/μl以上 | － | |
| エクソソーム分画 血漿または培養上清由来* |
20 ng以上 | － | － |
* miRNA発現解析のみ
※ 試料量が上記に満たない場合はお気軽にご相談下さい。
※ 組織、細胞等は、DNA/RNA抽出をご確認いただくか別途お問い合わせ下さい。
※ 送付方法は「サンプル送付方法」をご確認下さい。
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ご注文方法／価格
詳細は当社受託・特注品担当（下記参照）までお問い合わせ下さい。
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（株）DNAチップ研究所のマイクロアレイを用いた解析受託サービス
| 解析受託サービス | 解析内容 |
|---|---|
| 遺伝子発現解析 | Agilent Technologies社のマイクロアレイシステムを用いて、網羅的に遺伝子発現解析を行います。 |
| miRNA発現解析 | Agilent Technologies社のマイクロアレイシステムを用いて、MatureなmiRNAの発現解析を行います。 |
| アレイCGH解析 | Agilent Technologies社のマイクロアレイシステムを用いて、ゲノムの構造多型のひとつであるCNV（コピー数多型）を検出します。 |
| 統計解析（データ解析） | マイクロアレイの膨大な発現データからニーズに合わせた解析手法をご提案します。 |
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製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
表示価格に、消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので、あらかじめご了承下さい。