マイクロアレイを用いた解析受託サービス 遺伝子発現解析（Agilent）受託サービス
掲載日情報：2022/01/20 現在Webページ番号：64835
Agilent Technologies社のマイクロアレイを用いた遺伝子発現解析です。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
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特長
- Agilent Technologies社マイクロアレイは基板上に遺伝子配列特異性の高い60 merのプローブを搭載し、検出感度が高く幅広いダイナミックレンジ（5桁）で検出可能であるため、低発現量の遺伝子の検出が可能かつ、検出可能な遺伝子数が多くなります。
- アレイは1枚のスライドに最大8試料を処理できる仕様です。
- ヒト・マウス・ラットをはじめ、シロイヌナズナ、線虫、イヌなど様々な生物種に対応しています。
※ 各マイクロアレイについてはAgilent Technologies社Webをご覧下さい。
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サービス概要
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データ解析
■正規化
マイクロアレイ実験で得られた生データを、試料間の各遺伝子同士での比較が可能な発現値に変換します。
■データQC
データの傾向をつかむために階層的クラスタリングと主成分分析（PCA）を行います（2解析以上の場合）。
■有効プローブ抽出
実験データのうち、解析ソフトで有効判定されたものを採用し、ノイズ等と判定されたものを削除します。また、全ての解析において実験データが得られている遺伝子を採用するなど、基準を設けて発現値が欠損している遺伝子を除去します。
■発現変動遺伝子抽出
ご指定の比較に沿って、倍数変動や統計的に有意な発現変動遺伝子を抽出します。
■GO解析
変動遺伝子に対して特徴的なGO Termを抽出します。
■Pathway解析
変動遺伝子をPathway上にマッピングし、Pathway画像を作成します。統計的に有意なPathwayを絞り込むことができます。
※ 詳しい解析内容は統計解析のページをご参照下さい。
■データ解析の結果の例
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納品物
●試料QC結果（品質検査結果）
- total RNA images / cRNA images（ゲル電気泳動波形画像）
- Sample Data（試料濃度情報）
●アレイ実験生データ
- Raw Data（数値データ）
- QC report（アレイ実験終了品質検査結果）
●解析結果
- 正規化、変動遺伝子抽出、GO解析、Pathway解析
※データ解析はオプションです。
●解説書（アレイ実験・解析の説明書）
※クラウド経由もしくはUSBメモリ、DVDなどの記憶媒体で納品します。
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納期
●通常サービス（スライド1枚占有）
試料QC通過後、2か月程度（データ解析を含む場合は2.5か月程度）
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試料送付について
| RNA量 | 濃度 | OD260/280 | 性状 | |
|---|---|---|---|---|
| total RNA（真核・原核） | 500 ng以上 | 50 ng/μl以上 | 1.5以上 | 28s/18s：1.8以上 推奨RIN値：7以上 |
※ 試料量が上記に満たない場合はお気軽にご相談下さい。
※ 組織、細胞などは、DNA/RNA抽出をご確認いただくか別途お問い合わせ下さい。
※ 送付方法は「サンプル送付方法」をご確認下さい。
※ 試料量が上記に満たない場合、ならびに8試料単位ではなく（8試料以下）の場合は、RNA-Seqサービスをご検討下さい。
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ご注文方法／価格
詳細は当社受託・特注品担当（下記参照）までお問い合わせ下さい。
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（株）DNAチップ研究所のマイクロアレイを用いた解析受託サービス
| 解析受託サービス | 解析内容 |
|---|---|
| 遺伝子発現解析 | Agilent Technologies社のマイクロアレイシステムを用いて、網羅的に遺伝子発現解析を行います。 |
| miRNA発現解析 | Agilent Technologies社のマイクロアレイシステムを用いて、MatureなmiRNAの発現解析を行います。 |
| アレイCGH解析 | Agilent Technologies社のマイクロアレイシステムを用いて、ゲノムの構造多型のひとつであるCNV（コピー数多型）を検出します。 |
| 統計解析（データ解析） | マイクロアレイの膨大な発現データからニーズに合わせた解析手法をご提案します。 |
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製品情報は掲載時点のものですが、価格表内の価格については随時最新のものに更新されます。お問い合わせいただくタイミングにより製品情報・価格などは変更されている場合があります。
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