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マルチプレックスリアルタイムPCRにより6種類の肺がん関連融合遺伝子を検出するキット Lung Cancer ALK/ROS1/RET Testing Panel

掲載日情報:2020/06/12 現在Webページ番号:63387

6種類の肺がん関連融合遺伝子(35種類のバリアント)を逆転写マルチプレックスリアルタイムPCR(RT-qPCR)により検出するキットです。融合遺伝子とコントロール遺伝子転写物を同時に増幅し、蛍光プローブYin-Yang Probeにより検出します。

フライヤー

Yin-Yang Probeについて

Yin-Yangプローブは、核酸検出やその他関連のアプリケーションのための新規の蛍光プローブです(Patent No. US 7799522)。最初、プローブは、蛍光色素分子とクエンチャーが接近しているため非蛍光性ですが、標的が存在するとネガティブストランド(クエンチャー)が標的に置換され、蛍光を発します。

マルチプレックスリアルタイムPCRによるEML4-ALK融合遺伝子の検出キット EML4-ALK Fusion Gene Detection Kitの模式図

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特長

  • 融合遺伝子とコントロール遺伝子転写物を4種類の反応で同時に反応させます。
  • キットには、cDNA合成用試薬やqPCR用プライマー、プローブが含まれています。
  • FAM, HEX, Cy5の検出に対応した一般的なリアルタイムqPCR装置で解析できます。
  • 2~3時間で結果が得られます。
検出する融合遺伝子KIF5B-RET、KIF5B-ALK、CD74-ROS1、TFG-ALK、SLC34A2-ROS1、EML4-ALK
測定試料FFPE、凍結または新鮮肺がん組織から抽出したRNA
必要試料量0.1μg~1μgのtotal RNA
反応時間2時間
内部コントロールGUSB(ハウスキーピング遺伝子)
測定に必要な装置Bio-Rad CFX96, iCycler, ABI7500, Roche Lightcycler 480,
Stratagene Mx3000P/Mx3005P, その他一般的なRT-qPCR 装置(FAM, HEX, Cy5に対応)
Probe Mix蛍光検出する融合遺伝子
AFAMKIF5B-RET
Cy5Internal Control
BFAMCD74-ROS1
HEXTFG-ALK
Cy5Internal Control
CFAMSLC34A2-ROS1
HEXKIF5B-ALK
Cy5Internal Control
DHEXEML4-ALK
Cy5Internal Control

EML4-ALK fusion variants: V1, V2, V3a/b/c, V4, V5a/b, V6a/b, V7, V8a/b/c/d, V9, V10

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概要

In the process of real-time PCR, the positive strands bind to the PCR products during the annealing step, and release fluorescence signals. Signals are collected at the annealing step. An example of the primer/probe design is shown below

アオリ文 タイトル

Schematic of the primers and probes designed in the Q-fusion screening kit. Graph on the top shows an example of GUSB (internal control). Graph on the bottom shows the detection of EML4-ALK.

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使用例

マルチプレックスリアルタイムPCRにより6種類の肺がん関連融合遺伝子を検出するキットの使用例

Example of the amplification curve for EML4-ALK positive sample. The internal control is shown in purple and the fusion type signal is in blue.

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内容

  • RT buffer
  • Reverse transcriptase
  • Primer / Probe mix A~D
  • QD fast supermix
  • Positive control plasmid
  • water

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価格

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(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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