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マルチプレックスリアルタイムPCRによるEML4-ALK融合遺伝子の検出キット EML4-ALK Fusion Gene Detection Kit

掲載日情報:2020/06/12 現在Webページ番号:62964

肺がん組織由来のtotal RNAを用い、15種類のEML4-ALK融合遺伝子バリアントを逆転写リアルタイムPCR(RT-qPCR)により検出するキットです。融合遺伝子とコントロール遺伝子転写物を同時に増幅し、蛍光プローブYin-Yang Probeにより検出します。

フライヤー

EML4-ALKについて

ALK(Anaplastic Lymphoma Kinase)のキナーゼドメインとEML4(Echinoderm Microtubule Associated Protein Like 4)の融合の原因である2p21と2p23の逆位は、非小細胞肺がん(NSCLC)の5~7%で観察されます。この逆位した遺伝子は、がんの増殖を促進し、EGFレセプター(EGFR1)活性阻害による治療効果を抑制する可能性が示唆されています。EML4-ALK融合遺伝子を持つ患者において、未分化リンパ腫キナーゼ、またはCrizotinibのようなALK阻害物質が観察されたという結果も示されました。
ALK融合遺伝子に対する診断検査では、NSCLCに対するパネル診断が行われていますが、煩雑かつ時間がかかるなどの欠点が挙げられます。

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Yin-Yang Probeについて

Yin-Yangプローブは、核酸検出やその他関連のアプリケーションのための新規の蛍光プローブです(Patent No. US 7799522)。最初、プローブは、蛍光色素分子とクエンチャーが接近しているため非蛍光性ですが、標的が存在するとネガティブストランド(クエンチャー)が標的に置換され、蛍光を発します。

EML4-ALK融合遺伝子のマルチプレックス解析キット EML4-ALK Fusion Gene Detection Kitの模式図

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マルチプレックス検出キットの特長

  • 同時に15種類の融合バリアントを検出できます。
  • キットには、cDNA合成用試薬やqPCR用プライマー、プローブが含まれています。
  • FAMとHEXの検出に対応した一般的なリアルタイムqPCR装置で解析できます。
  • 2~3時間で結果が得られます。
測定試料FFPE、凍結または新鮮肺がん組織から抽出したRNA
必要試料量0.1μg~1μg, total RNA
反応時間2時間
内部コントロールGUSB(ハウスキーピング遺伝子)
測定に必要な装置Bio-Rad CFX96, iCycler, ABI7500, Roche Lightcycler 480,
Stratagene Mx3000P/Mx3005P, その他一般的なRT-qPCR 装置(FAM, HEXに対応)

検出可能なEML4-ALK融合バリアント

各バリアントは区別して検出できません。

Fusion VariantsEML4 Spliced ExonALK Spliced Exon
EML4-ALK V11320
EML4-ALK V22020
EML4-ALK V3a/b/c620
EML4-ALK V41420
EML4-ALK V5a/b220
EML4-ALK V6a/b1320
EML4-ALK V71420
EML4-ALK V8a/b/d1720
EML4-ALK V101820

検出結果

蛍光結果
FAM+HEXEML4-ALK Positive
FAM OnlyEML4-ALK Negative Figure

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マルチプレックス検出キットの概要

In the process of qPCR, the positive strands of Yin-Yang Probe bind to the PCR products during the annealing step, and release fluorescence signals. Signals are collected in the annealing step.
cDNA is synthesized by adding purified RNA to the ready to use cDNA reaction mix. The resulting cDNA is mixed with the specific PCR primers and probes mix for detection of fusion variants. qPCR is performed in a real-time PCR instrument with optical filters forthe detection of FAM and HEX.

マルチプレックスリアルタイムPCRによる15種類のEML4-ALK融合遺伝子の検出キット EML4-ALK Fusion Gene Detection Kitの概要

Schematic of the primers and probes designed in the EML4-ALK detection kit. Graph on the top shows an example of the GUSB (internal control). Graph on the bottom shows the primer/probe design to detect EML4-ALK variants. Primers are depicted in horizontal blue arrows.

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マルチプレックス解析キットの使用例

マルチプレックスリアルタイムPCRによるEML4-ALK融合遺伝子の検出キット EML4-ALK Fusion Gene Detection Kitの使用例

Example of the amplification curve of EML4-ALK positive sample. The internal control is shown in green and the positive control is shown is blue.

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マルチプレックス検出キットの内容

  • RT buffer
  • Reverse transcriptase
  • Primer/Probe mix
  • QD fast supermix
  • Positive control plasmid
  • Water

FAM(励起495 nm/蛍光520 nm)やHEX(励起535 nm/蛍光556 nm)を検出できるqPCR装置が別途必要です。

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マルチプレックス検出キットの価格

[在庫・価格 :2024年04月26日 00時00分現在]

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EML4-ALK Fusion Gene Detection Kit (10tests)

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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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