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FFPE組織からのDNA抽出キット、効率的なPCR増幅が可能 WaxFree™ Paraffin Sample DNA Extraction Kit

掲載日情報:2020/06/12 現在Webページ番号:492

ホルマリン固定パラフィン包埋 (FFPE) 組織から、カラムやビーズ結合法ではなく特殊なレジンと酵素ミックスにより、PCR阻害の原因となるクロスリンクを効果的に除去します。DNA収量のロスが少なく高収量のDNAが得られ、効率的なPCR増幅が可能になります。
WaxFree Paraffin Sample RNA Extraction Kitについてはこちらをご覧ください。

FFPE組織からのDNA抽出

ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織では、ホルムアルデヒドの固定により核酸およびタンパク質などの組織成分間のランダムなクロスリンクを引き起こし、一般的にDNAは断片化されDNAの収量が低下します。また、このクロスリンク作用により、PCR増幅が阻害されます。通常、シリカ膜カラムやマグネットビーズへの結合と溶出によりDNAが精製されますが、この結合と溶出は、DNA収量のロスにつながり、DNA抽出の再現性と収量を低下させます。

FFPE組織からのDNA抽出

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特長

  • 高収量のDNAが得られ、効率的なPCR増幅が可能です。
  • 従来法では手間と時間のかかった FFPE 組織からのゲノム DNA 抽出を1 チューブ内での反応により約2時間で行うことができます。
  • FFPE組織1切片で50~100回のPCRが可能です。
  • 脱パラフィンにQ-Solutionを用い、キシレン不要で安全です。
  • 特殊なレジンと酵素ミックスにより、ホルマリンなどの PCR 阻害物質が除去されるため、抽出物を直接 PCR に用いることができます*1
  • 10 年近く保存したパラフィン包埋組織からもゲノム DNA を抽出できます。
  • 新鮮組織、凍結組織、穿刺吸引試料、皮膚や筋肉などの組織*2、パラフィン包埋組織ブロックなどにも適用できます。

*1本製品により抽出したゲノム DNA には、組織由来のタンパク質が含まれるため、純度は A260 / 280 = 0.6~1.5 となります。
*2皮膚や筋肉からのゲノム DNA 抽出には酵素ミックスとのインキュベーションを一晩行って下さい。
大きい切片または脳や肝臓などの細胞密度が高い試料の場合、調整したゲノムDNA抽出物を希釈してPCRに用いて下さい。

FFPE組織からの既存のDNA抽出10法を比較

FFPE組織からの既存のDNA抽出10法を比較した結果。WaxFree法が最も高収量の増幅可能なDNAを回収できることがわかる。

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使用例

WaxFree法および他法によるFFPE組織からのDNA抽出の結果

WaxFree法および他法によるFFPE組織からのDNA抽出の結果。EGFR遺伝子の標的配列を増幅し、電気泳動で解析した(米国TrimGen社より提供)。

FFPE組織からのDNA抽出しPCRによりGP-100 遺伝子の534 bpを増幅

10年間保存したFFPE組織から本キットを用いてゲノムDNA を抽出し、PCRによりGP-100 遺伝子の534 bpを増幅した(Howard 大学、Dr.Ckenより提供)。

肺組織の結果です。抽出量は組織により異なります。

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操作方法概略

Paraffin Sample DNA Extraction Kitの操作方法概略

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キット内容

  • Q-solution
  • Wash buffer
  • Enzyme mix
  • WaxFree resin purification filter

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使用文献

  1. Okello JB., et al., Anal Biochem, 400, 110~117 (2010)
  2. Turashvili G., et al., Exp Mol Pathol, 92, 33~43 (2012)

[在庫・価格 :2024年04月20日 19時15分現在]

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Paraffin Sample DNA Extraction Kit, WaxFree (50 preps)
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ホルマリン固定パラフィン包埋 (FFPE) 組織から,カラムやビーズ結合法ではなく特殊なレジンと酵素ミックスにより,PCR阻害の原因となるクロスリンクを効果的に除去するキット。DNA収量のロスが少なく高収量のDNAが得られ,効率的なPCR増幅が可能。
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ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織切片から RNA を抽出するキットです。カラムやビーズ結合法ではなく特殊なレジンと酵素ミックスを用い、抽出過程のRNAロスが少なく高収量のRNAが得られ、RT-PCRまたはリアルタイムPCRに直接使用できます。

詳細はこちらをご覧ください。

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Paraffin Sample RNA Extraction Kit, WaxFree (50preps)
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Paraffin Sample RNA Extraction Kit, WaxFree (50preps)

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  • 商品コード:WR-50
  • メーカー:TRM
  • 包装:1kit
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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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