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様々なご要望に対応できます 次世代DNA シークエンス(NGS)解析受託サービス

掲載日情報:2016/05/01 現在Webページ番号:4150

次世代シークエンス装置* を用いた DNA シークエンスの解析サービスです。お客様と入念な打ち合わせを行い、研究内容に沿った解析手法を納得価格でご提案いたします。お預かりした試料の塩基配列を決定した後、そのデータにお客様のご研究に沿ったバイオインフォマティクス情報を付加してお渡しいたします。
イルミナ社製 Genome Analyzer II x (GA II x) を使用します。

特長

  • 経験豊富な技術者がご提供頂いた試料の前処理と解析結果のバイオインフォマティクス処理を行います。
  • お客様のご要望に対する柔軟性が高いため、従来のシークエンスメニューでは対応しきれなかった解析も可能です。また、シークエンスデータに対する様々な解析も承ります。

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解析アプリケーションラインナップ

■ ゲノムシークエンシング

メニュー 概要 期待される解析結果や解析例
ゲノムリシークエンシング
必要試料量:5 μg 精製ゲノム DNA
すでにゲノムの塩基配列が決定されている生物種のゲノム配列(リファレンス)と、個々の生物のゲノム配列を比較し、置換、逆位、欠失/挿入などのわずかな配列の違いを解析。
  • 個体間の疾患感受性や代謝を司る遺伝子差異の発見。
  • 遺伝病の原因因子の同定。
  • 微生物がもつ様々な特徴をゲノム配列と対応させて明確化。
de novo シークエンシング
必要試料量:5 μg 精製ゲノム DNA
リファレンスとなる配列が無い生物のゲノムシークエンスを決定。
  • ポストゲノム解析において、無限の可能性を秘める。
全ゲノム解析
必要試料量:5 μg 精製ゲノム DNA
特定の生物種のゲノム全体を対象にした連鎖的な解析。
  • 環境との相互作用や疾患の原因遺伝子の特定。
Targeted ゲノムシークエンシング
必要試料量:5 μg 精製DNA
(PCR 増幅DNA)
ヒトのように比較的大きいサイズのゲノムの特定領域に絞って増幅後、シークエンシングを行う。多数に渡る試料におけるSNPsを解析。
  • 多数に渡る試料におけるSNPs を解析。
  • 疾患感受性や原因となる遺伝子の特定。


全ゲノム・リシークエンシング

Targeted ゲノムシークエンシング


■ 発現解析とタンパク質核酸相互作用解析
メニュー 概要 期待される解析結果や解析例
5' 末端タグプロファイリング
必要試料量:30 μg の精製全 RNA
オリゴキャッピング法と遺伝子タグのシークエンシング法に基づき、mRNA の出現を網羅的、かつ定量的に調べる。網羅的な転写開始点の収集が可能。
  • 新規転写開始点の同定。
  • プロモーターや発現調節機構の解析。
3' 領域(Nla III)タグプロファイリング
必要試料量:2 μg の精製全 RNA
mRNA の 3' 末端寄りから得た断片を網羅的に解析
  • 得られた配列をもとにした、転写産物の同定や遺伝子の発現量の定量。
mRNA シークエンシング
必要試料量:10 μg の精製全RNA
プローブやプライマーの設計を必要としないため、網羅的な遺伝子発現解析においてバイアスの無い大量の情報取得が可能。
  • 完全長の mRNA 解析による、新規転写産物や新しい アイソフォームの発見。
small RNA 同定および定量化
必要試料量:10 μg の精製全 RNA
細胞内で発現している small RNA を網羅的に解析。検出できるダイナミックレンジが広いので、細胞全体での small RNA の発現量の調査も可能。
  • 様々な生物種における small RNA の包括的な同定や特徴づけ
  • 配列情報や二次構造情報が未知である small RNA の探索
  • 低発現の small RNA 探索
ChIP シークエンシング
必要試料量:50 ng のDNA 免疫沈降物
クロマチン免疫沈降(ChIP)と次世代DNA シークエンスを組み合わせた解析。
  • 転写調節因子やクロマチン結合タンパク質と相互作用する DNA を調べ、遺伝子発現制御の仕組みを解析。

RNA の場合は上記の量が含まれるライセートの状態でご送付いただくこともできます。精度の高い解析が可能です。
ライセートの作製には inbitrogen (ライフテクノロジーズ 社) TRIzol 試薬のご使用をお勧めします。
DNA・RNA の純度は、260 nm と 280 nm の吸光度の比が 1.8 となることが必要です。

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ご注文方法

秘密保持契約が必要な場合はご注文前にお知らせ下さい。
詳細は当社受託・特注品業務担当(下記参照)までお問い合わせ下さい。

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