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微生物試料からのバイアス無しでの核酸精製
ZymoBIOMICS DNA Mini Kit(#D4300),HMP Protocol(Human Microbiome Project fecal DNA extraction protocol)および他社DNA抽出キット2種類を用いて,ZymoBIOMICS Microbial Community StandardからDNAを抽出,精製した。v3-4領域を標的とするプライマーを用いて,各DNA試料から16S rRNAを増幅し,Illumina-MiSeq(2×250 bp)により解析した。組成のプロファイルは,ZymoBIOMICS Microbial Community Standardに含まれる8種類の異なる細菌種の既知16S rRNA遺伝子に対する単位複製配列解析後の配列数に基づいて決定した。4種類のDNA抽出,精製法で唯一ZymoBIOMICS DNA Mini Kitだけが理論値(Theoretical)に近いバイアスのないプロファイルを示した。