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血中循環腫瘍DNAのNGS解析時の標準物質 Seraseq ctDNA Mutation Mix / Reference Material

掲載日情報:2020/08/24 現在Webページ番号:68209

血中循環腫瘍DNA(ctDNA)のNGS(次世代シークエンシング)解読により、がん関連遺伝子の変異を解析する際に用いる標準物質です。精製DNA試料との比較に用いるMutation Mixと、血漿試料との比較に用いるReference Materialがあります。
本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。


ctDNA Complete Mutation MixのDNAサイズ分布

ctDNA Complete Mutation Mix AF5%(#0710-0528)とヒト由来循環セルフリーDNA(ccfDNA)それぞれのDNA断片のサイズ分布


特長

  • NGS解析の様々なステップでの標準物質として使用できます:核酸の抽出(Reference Materialのみ)、ライブラリー調製、シークエンシング、バイオインフォマティクス解析による変異体の検出
  • NGSアッセイ系の構築・バリデーション・コントロールや、標準化に有用です。
  • 実際のNGS解析で用いられる複数ドナー由来の高度に多重化された試料を模しています。
  • 野生型(WT)と変異型の製品があり、変異型は様々な対立遺伝子頻度(allele frequency:AF)の製品があります。
  • 幅広いがんの解析用のctDNA v2と、肺がん・大腸がん・乳がん・メラノーマ解析用のctDNA Completeの2つのシリーズがあります。

本製品にはDNA抽出試薬やNGSライブラリー調製試薬は含まれていません。


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SeraseqゲノムDNA標的製品(がんおよび遺伝性疾患研究用製品)の製造について

  • 目的の変異を有する変異体DNAを合成・処理し、デジタルPCRで厳密に定量する。
  • GM24385細胞株から抽出したゲノムDNAをバックグラウンドとして、これに合成した変異体DNAを適切な対立遺伝子頻度となるように添加する。
  • 製品の最終形状(DNA溶液/独自のマトリックスへの封入など)に応じて、加工を行う。
Seraseqの製造方法

下図は、Reference Material(精製DNAを独自のマトリックスに封入した人工血漿様製品)の場合。

Reference Materialの製造方法


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仕様

シリーズ名 ctDNA v2 ctDNA Complete
含まれるがん関連遺伝子・変異体の数 28 gene
40 variants
16 gene
25 variants
含まれる変異の種類
()は含まれる変異体の数
SNVs(25), INDELs(13), SVs(2) SNVs(12), INDELs(7), CNVs(3), SVs(3)
一致遺伝子の数 8 8
不一致遺伝子の数 20 8
対立遺伝子頻度(AF)の範囲 0.125~2% 0.1~5%
対象とするがんの由来 固形組織、ヘム 固形組織
対象とするがんの種類 幅広いがん 肺がん・大腸がん・乳がん・メラノーマ

■ ctDNA v2に含まれるがん関連遺伝子(赤文字は一般的ながん関連遺伝子)

AKT1APCATMBRAFCTNNB1EGFRERBB2
FGFR3FLT3FOXL2GNA11GNAQGNASIDH1
JAK2KITKRASMPLNCOA4-RETNPM1NRAS / CSDE1
PDGFRAPIK3CAPTENRETSMAD4TP53TPR-ALK

■ ctDNA v2に含まれず、ctDNA completeのみに含まれるがん遺伝子

ALKBRCA1BRCA2CD74-ROS1
EML4-ALKMETMYCNRAS

がん関連遺伝子・変異体の完全なリストについては、価格表に掲載されている製品データシートをご確認下さい。


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製品一覧

商品コードをクリックすると価格表をご覧になれます。

シリーズ名 ctDNA v2 ctDNA Complete
フォーマット Mutation Mix Reference Material Mutation Mix Reference Material
製品形状 GM24385細胞からゲノムDNA抽出をし、変異体DNAを添加したものをバッファーに溶解 変異体DNAを添加したゲノムDNAを安定化後、独自のマトリックス(Matribase)に封入したもの(人工血漿様) GM24385細胞からゲノムDNA抽出をし、変異体DNAを添加したものをバッファーに溶解 変異体DNAを添加したゲノムDNAを安定化後、独自のマトリックス(Matribase)に封入したもの(人工血漿様)
濃 度 10 ng/μl 25 ng/ml 10 ng/μl 25 ng/ml
容 量 25μl 5 ml 25μl 5 ml
AF 5% 0710-0528 0710-0669
AF 2.5% 0710-0529 0710-0670
AF 2% 0710-0139 0710-0203
AF 1% 0710-0140 0710-0204 0710-0530 0710-0671
AF 0.5% 0710-0141 0710-0205 0710-0531 0710-0672
AF 0.25% 0710-0142
AF 0.125% 0710-0143 0710-0207
AF 0.1% 0710-0532 0710-0673
WT 0710-0144 0710-0208 0710-0533 0710-0674

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Seraseqシリーズ製品一覧

製品の概要をクリックすると該当製品をご覧になれます。
RM:Reference Material

製品の概要 検出できる変異 製品形状① 製品形状②



ctDNA(血中循環腫瘍DNA)の解析 CNV、INDEL、SNV、SV DNA Mix RM(血漿様)
固形腫瘍の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
FFPE試料からの解析 CNV、INDEL、SNV、SV FFPE RM
DNAからの骨髄性がんの解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix
RNAからの骨髄性がんの解析 融合遺伝子 RNA Mix
CNV(コピー数多型)の解析 CNV RM(血漿様)
RNAからの融合遺伝子の解析 融合遺伝子 RNA Mix FFPE RM
TMB(腫瘍遺伝子変異量)の解析 TMB DNA Mix FFPE RM
遺伝性がん関連遺伝子の解析 INDEL、SNV、SV DNA Mix


肥大型心筋症の関連遺伝子の解析 INDEL、SNV DNA Mix
染色体異常の解析 染色体異常 RM(血漿様)
NGS特集へのリンク

Seraseqシリーズ紹介の動画も上記の「NGS特集」にアップされています。


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価格

■ ctDNA v2, Mutation Mix

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ctDNA Mutation Mix v2 AF2%, Seraseq
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血中循環腫瘍DNA(ctDNA)のNGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に用いる標準物質。幅広いがんを対象とする。DNA Mix溶液。
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ctDNA Mutation Mix v2 AF1%, Seraseq
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ctDNA Mutation Mix v2 AF0.5%, Seraseq
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ctDNA Mutation Mix v2 AF0.25%, Seraseq
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ctDNA Mutation Mix v2 AF0.125%, Seraseq
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ctDNA Mutation Mix v2 WT, Seraseq
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ctDNA Mutation Mix v2 AF2%, Seraseq

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ctDNA Mutation Mix v2 AF1%, Seraseq

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ctDNA Mutation Mix v2 AF0.5%, Seraseq

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ctDNA Mutation Mix v2 AF0.25%, Seraseq

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ctDNA Mutation Mix v2 AF0.125%, Seraseq

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ctDNA Mutation Mix v2 WT, Seraseq

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■ ctDNA v2, Reference Material

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ctDNA Reference Material v2 AF2%, Seraseq
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ctDNA Reference Material v2 AF0.5%, Seraseq
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ctDNA Reference Material v2 AF0.125%, Seraseq
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ctDNA Reference Material v2 WT, Seraseq
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ctDNA Reference Material v2 AF2%, Seraseq

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ctDNA Reference Material v2 AF1%, Seraseq

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ctDNA Reference Material v2 AF0.5%, Seraseq

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ctDNA Reference Material v2 AF0.125%, Seraseq

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ctDNA Reference Material v2 WT, Seraseq

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■ ctDNA Complete, Mutation Mix

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ctDNA Complete Mutation Mix AF5%, Seraseq
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血中循環腫瘍DNA(ctDNA)のNGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に用いる標準物質。肺がん・大腸がん・乳がん・メラノーマを対象とする。DNA Mix溶液。
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ctDNA Complete Mutation Mix AF2.5%, Seraseq
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ctDNA Complete Mutation Mix AF1%, Seraseq
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ctDNA Complete Mutation Mix AF0.5%, Seraseq
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ctDNA Complete Mutation Mix AF0.1%, Seraseq
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ctDNA Complete Mutation Mix WT, Seraseq
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ctDNA Complete Mutation Mix AF5%, Seraseq

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ctDNA Complete Mutation Mix AF2.5%, Seraseq

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ctDNA Complete Mutation Mix AF1%, Seraseq

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ctDNA Complete Mutation Mix AF0.5%, Seraseq

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ctDNA Complete Mutation Mix AF0.1%, Seraseq

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ctDNA Complete Mutation Mix WT, Seraseq

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■ ctDNA Complete, Reference Material

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ctDNA Complete Reference Material AF1%, Seraseq
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ctDNA Complete Reference Material AF0.5%, Seraseq
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ctDNA Complete Reference Material AF0.1%, Seraseq
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ctDNA Complete Reference Material WT, Seraseq
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説明文
血中循環腫瘍DNA(ctDNA)のNGS解読により,がん関連遺伝子の変異を解析する際に用いる標準物質。肺がん・大腸がん・乳がん・メラノーマを対象とする。DNAを独自のマトリックスに封入した人工血漿様。
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ctDNA Complete Reference Material AF5%, Seraseq

文献数: 0

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ctDNA Complete Reference Material AF2.5%, Seraseq

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ctDNA Complete Reference Material AF1%, Seraseq

文献数: 0

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ctDNA Complete Reference Material AF0.5%, Seraseq

文献数: 0

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ctDNA Complete Reference Material AF0.1%, Seraseq

文献数: 0

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ctDNA Complete Reference Material WT, Seraseq

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