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Infinium Methylation 450Kなどでの5-mC/5-hmCアレイ解析用試料調製キット 5hmC/5mC TAB-Array Kit

掲載日情報:2015/02/20 現在Webページ番号:63400

ゲノムDNA中の5-ヒドロキシメチル化シトシン(5-hmC)をグルコシル化した後,Tet1により5-メチル化シトシン(5-mC)のみをカルボキシル化するキットです。本キットで処理したDNAを亜硫酸水素塩処理することで,5-mCのみをウラシルに変換することができます。調製したDNA試料は,Illumina社のInfinium Methylation 450K arrayなどのアレイ解析に使用できます。

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MEMO

Tet-Assisted Bisulfite(TAB)法とは


従来のBisulfite法では,ゲノムDNAをバイサルファイト処理し,非メチル化シトシンをウラシルに変換した後にメチル化DNAを検出します。しかし,この方法ではmCとhmCを区別することができませんでした。

TAB法は,バイサルファイト処理を行う前にhmCのグルコシル化処理を行い,Tet1によるカルボキシル化から保護します。そのため,Tet1によりmCのみがカルボキシルシトシン(caC)に変換されます。この反応の後にバイサルファイト処理を行うと,非メチル化シトシンとcaCはウラシルに変換されますが,グルコシル化hmC(Glu-hmC)は影響を受けません。この試料を用いることで,ゲノムDNA中の,hmCの位置を知ることができます。

TAB-Arrayとは


TAB-Arrayは,TAB法で処理した試料とIllumina社 Infinium Methylation 450Kなどのアレイを組み合わせ,5-mC/5-hmCを解析する方法です。バイサルファイト法とTAB法で処理した2種類の試料を用意してアレイ解析を行い,それらの結果を比較することで,非メチル化シトシン,メチル化シトシン,ヒドロキシメチル化シトシンを区別します。シーケンス解析に比べ低価格かつデータ解析をより簡単に行うことができます。
原理及び画像出典元:Kristopher L. Nazor, et. al., Genomics, 104(5):358-67(2014).

5hmC/5mC TAB-Array Kitの操作方法


5-mC/5-hmCアレイ解析用試料調製キットの特長

  • 本キットで処理をした試料DNAを亜硫酸水素塩処理することでmCがウラシルに変換されるため,従来解析が困難だったhmCのゲノムDNA中の位置を知ることが可能です。
  • 調製したDNA試料は,Illumina社のInfinium Methylation 450K arrayなどのアレイ解析に使用できます。
  • シーケンス解析に比べ低価格かつデータ解析をより簡単に行うことができます。
  • キットには10反応分の試薬が含まれています。

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5-mC/5-hmCアレイ解析用試料調製キットの参考文献

  • Kristopher L. Nazor, et. al., Genomics, 104(5):358-67(2014).
  • Chopra, P., et. al., BMC Genomics, 15:131(2014).

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5-mC/5-hmCアレイ解析用試料調製キットのキット内容

  • 10×βGT protection buffer
  • 10 mM UDP-Glucose
  • T4-βGT
  • Tet1 oxidation reagent 1 / 2
  • Tet1 protein
  • Proteinase K

キットにグルコシル化処理後のDNA精製用試薬および亜硫酸水素塩処理用試薬は含まれていません。別途ご用意下さい。
ロットにより酵素の活性値が異なる場合がありますので,実験の際には製品添付のプロトコルをご確認下さい。

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5-mC/5-hmCアレイ解析用試料調製キットの価格

[在庫・価格 :2019年10月16日 10時51分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
5hmC/5mC TAB-Array Kit (compatible to Infinium 450K Array)
2週間程度  0
説明文
法規制等 カルタヘナ該当品
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ

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[在庫・価格 :2019年10月16日 10時51分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。

5hmC/5mC TAB-Array Kit (compatible to Infinium 450K Array)

文献数:0

  • 商品コード:K002
  • メーカー:WIS
  • 包装:1kit
  • 価格:¥231,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:2週間程度 
  • 法規制等:カルタヘナ該当品

説明文
法規制等 カルタヘナ該当品
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ

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5mC Tet1 Oxidation Kit

Tet1により,ゲノムDNA中の5-mCを5-caCに変換するためのキットです。

[在庫・価格 :2019年10月16日 10時51分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
5mC Tet1 Oxidation Kit
2週間程度  0
説明文
5-メチル化シトシンのカルボキシルシトシンへの変換を行うことができるキット。キット内容:Tet1 oxidation reagent 1/2, Tet1 protein, Proteinase K
法規制等 カルタヘナ該当品
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ

製品記事 エピジェネティクスカタログ<5-hmC>
5hmC TAB-Seq Kit
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5mC Tet1 Oxidation Kit for PacBio RS instrument
2週間程度  0
説明文
PacBio RS instrument(Pacific Biosciences社)でのシークエンシングに最適化した,5-メチル化シトシンのカルボキシルシトシンへの変換を行うことができるキット。キット内容:Tet1 oxidation reagent 1/2, Tet1 protein, Proteinase K
法規制等 カルタヘナ該当品
保存条件 -80℃ 法規備考
掲載カタログ

製品記事 エピジェネティクスカタログ<5-hmC>
5hmC TAB-Seq Kit
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[在庫・価格 :2019年10月16日 10時51分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。

5mC Tet1 Oxidation Kit

文献数:0

  • 商品コード:K003
  • メーカー:WIS
  • 包装:1kit
  • 価格:¥198,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:2週間程度 
  • 法規制等:カルタヘナ該当品

説明文 5-メチル化シトシンのカルボキシルシトシンへの変換を行うことができるキット。キット内容:Tet1 oxidation reagent 1/2, Tet1 protein, Proteinase K
法規制等 カルタヘナ該当品
保存条件 -80℃ 法規備考
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5hmC TAB-Seq Kit
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5mC Tet1 Oxidation Kit for PacBio RS instrument

文献数:0

  • 商品コード:K004
  • メーカー:WIS
  • 包装:1kit
  • 価格:¥198,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:2週間程度 
  • 法規制等:カルタヘナ該当品

説明文 PacBio RS instrument(Pacific Biosciences社)でのシークエンシングに最適化した,5-メチル化シトシンのカルボキシルシトシンへの変換を行うことができるキット。キット内容:Tet1 oxidation reagent 1/2, Tet1 protein, Proteinase K
法規制等 カルタヘナ該当品
保存条件 -80℃ 法規備考
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5hmC TAB-Seq Kit
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5mC / 5hmC DNA Standard

TAB-Arrayキットや,その他DNAメチル化解析時のスタンダードとして最適です。

[在庫・価格 :2019年10月16日 10時51分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
5mC DNA Standard
2週間程度  0
説明文
法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
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5hmC DNA Standard
2週間程度  0
説明文
法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
掲載カタログ

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[在庫・価格 :2019年10月16日 10時51分現在]

※ 納期として表示している期間は弊社発注日からの「目安」となり、納期を保証する物ではございません。実際には長くかかる場合もございます。ご注意ください。

5mC DNA Standard

文献数:0

  • 商品コード:S001
  • メーカー:WIS
  • 包装:1vial
  • 価格:¥8,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:2週間程度 
  • 法規制等:

説明文
法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
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5hmC DNA Standard

文献数:0

  • 商品コード:S002
  • メーカー:WIS
  • 包装:1vial
  • 価格:¥8,000
  • 在庫:無(未発注)
  • 納期:2週間程度 
  • 法規制等:

説明文
法規制等
保存条件 -20℃ 法規備考
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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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