亜硫酸水素塩(bisulfite)処理したゲノムから独自に設計したプライマーを用いてPCRテンプレートを取得し,複数のE. coliに形質転換した上でシークエンシングを行います。ゲノム対象領域のメチル化率を定性的に反映したコロニー数分の配列結果を得ることができます。
1. プライマーデザインと合成(配列の検証と複数プライマーセットの設計,合成)
2. 亜硫酸水素塩処理
3. PCR検証
4. ベクターへのライゲーション(100 bp程度の領域,PCR産物精製)
5. E. coliへの形質転換からシークエンシングまで(20クローンのクローニング,シークエンシング,報告)
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