リアルタイムPCRでLncRNAを定量解析できるキット | Lnc Profiler qPCR Array Kit | lncRNA関連製品 | 発現解析

: システムバイオサイエンス / System Biosciences, LLC

[掲載日情報：2013/02/13 現在]

リアルタイムPCRでLncRNAを定量解析できるキット Lnc Profiler qPCR Array Kit

リアルタイムPCRでLncRNA（長鎖非翻訳RNA）を定量解析できるキットです。cDNAの調製用試薬およびプライマーセットが含まれており，癌および幹細胞に関連した90種類のLncRNAを解析できます。バイオマーカーとしてのLncRNA同定，およびLncRNA発現パターン解析に有用です。

※本製品は研究用です。臨床用途には使用できません。
※疾病に関与する83種類のLncRNAをリアルタイムPCRで定量解析するためのプライマーセットDisease-related LncRNA Profilerについては，フナコシホームページをご覧下さい。

MEMO

LncRNAとは

LncRNA（long non-coding RNA：長鎖非翻訳RNA）は，200 nt以上の長さを有するRNAで，ゲノム中の様々な領域から発現しています。

LncRNAは，胚の多分化能や分化の調節，体軸方向の形成，発生変化の促進などにおいて，主たる調節因子として機能しています。

また，アルツハイマー病，乾癬，癌などの幅広い疾患において，LncRNAの異常発現が観察されています。

LncRNAの発現パターンの解析は，多くのモデル系でのLncRNAの役割の解明において重要であると考えられています。

1. 情報伝達

XISTやAIRなどのLncRNAは，細胞ストレスや温度などの刺激に応答してその発現量を変化させ，分子シグナルとして機能します。そのため，バイオマーカーとしての利用が期待されています。

2. デコイ

MALAT1などのLncRNAは，標的タンパク質因子と結合します。例として，転写因子とクロマチン修飾因子の間で，「スポンジ」分子として機能します。

3. ガイド分子

HOTTIPなどのLncRNAは，特定のリボ核タンパク質を局在させ，標的のクロマチン部位と複合体を形成する際のガイド分子として機能します。これにより，遺伝子発現のcis（近傍），trans（遠方）の発現様式が変化します。

4. 足場

HOTAIRやANRILなどのLncRNAは，新たな機能を有するタンパク質複合体を組み立てます。

参考文献

Wang, K. C., Chang, H. Y., Mol. Cell., 43 (6), 904～914 (2011).

特　　長

キットにはPolyA polymeraseが含まれており，Poly(A) tailを有さないLncRNAからもcDNA合成が行えます。
キットで用いているプライマーは，各LncRNAに特異的かつ，多種類の細胞から精製したRNAで使用できることを確認しています。
キットにはcDNA合成およびPCRを20回行うのに十分な量の試薬が含まれています。
核小体，核，細胞質それぞれにおけるLncRNA発現を解析するために，対応したコントロールが含まれています（下記参照）。そのため，各画分から精製したRNAを出発試料として解析することも可能です。
検出できるLncRNAの詳細およびデータ解析に便利なソフトウェアは，System Biosciences社ホームページの各製品ページにある『Literature』からダウンロードできます。

※各LncRNAの詳細情報は，LncRNAデータベースをご覧下さい。
※エキソソーム中のLncRNAについて発現解析を行う場合は，ExoQuick Exosome Precipitation Solutionでエキソソームを調製することをお勧めします。詳細は，フナコシホームページをご覧下さい。

細胞内小器官名	キットで用いているコントロール
核小体	SnoRNA RNU43（および18S rRNA）
核	Small Nuclear splicing snRNA U6B
細胞質	GAPDH, Lamin A / C, 18S rRNA

操作方法概略

キットに含まれるプライマーを用いてリアルタイムPCRを行い，それぞれのLncRNAおよびコントロールについて解離曲線を作製した。特異的に増幅していることがわかる。

各種細胞（ヒトES細胞株（H7），ヒトiPS細胞株，HFF細胞株）から精製したRNAを用いて，解析を行った。

検出可能なLncRNA

21A

7SK

7SL

Air

AK023948

Alpha 280

Alpha 250

ANRIL

anti-NOS2A

antiPeg11

BACE1AS

BC200

CAR Intergenic

DHFR upstream

Dio3os

DISC2

DLG2AS

E2F4 antisense

EgoA

EGO B

Emx2os

Evf1 and EVF2

GAS5-family

Gomafu

H19

H19 antisense

H19 upstream

HAR1A

HAR1B

HOTAIR

HOTAIRM1

HOTTIP

Hoxa11as

HOXA3as

HOXA6as

HULC

IGF2AS

IPW

Jpx

Kcnq1ot1

KRASP1

L1PA16

p21

RoR

SFMBT2

VLDLR

LOC285194

LUST

Malat1

mascRNA

MEG3

MEG9

MER11C

ncR-uPAR

NDM29

NEAT1

Nespas

NRON

NTT

p53 mRNA

PCGEM1

PR antisense

PRINS

PSF inhibiting

PTENP1

RNCR3

SAF

SCA8

snaR

SNHG1

SNHG3

SNHG4

SNHG5

SNHG6

Sox2ot

SRA

ST7OT

TEA ncRNAs

Tmevpg1

TncRNA

Tsix

TUG1

UCA1

UM9-5

WT1-AS

Xist

Y RNA-1

Zeb2NAT

Zfas1

Zfhx2as

18S rRNA

RNU43

GAPDH

LAMIN A/C

Human U6

No assay control

※表中，緑色の網かけ部分はコントロール。

キット内容

PolyA polymerase
PolyA polymerase buffer
MnCl₂
ATP
Oligo dT adaptor
Reverse transcriptase buffer＋random primer mix
Reverse transcriptase
Dithiothreitol (DTT)
dNTP mix
Array primers, dried down in primer plate
RNase-free water
2×SYBR^（R） Green master mix （#RA910A-1のみ）

※#RA900A-1には，SYBR^（R） Green master mixが含まれていません。Power SYBR^（R） Master Mix（Life Technologies社）のご使用をお勧めします。

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[在庫： 2013年05月25日 20時50分現在]

メーカー	商品コード	商品名	包装	価格	在庫	リスト
SBIシステムバイオサイエンス System Biosciences, LLC	RA910A-1	LncRNA Profiler Complete qPCR Array Kit (20profiles)	1kit	\155,000	無 (未発注)	追加
SBIシステムバイオサイエンス System Biosciences, LLC	RA900A-1	LncRNA Profiler qPCR Array Kit (20profiles)	1kit	\118,000	1個	追加