Zymo Resach社 EZ DNA Methylation Kit シリーズに関する FAQ
掲載日情報:2017/09/01 現在Webページ番号:80562
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Zymo Resach社 EZ DNA Methylation Kit シリーズに関する FAQ
Q-1. 亜硫酸水素ナトリウム処理を行う試料 DNA は、どのようなバッファーに溶解すれば良いですか?
A-1. 水、TE、TE 改良バッファーに溶解すれば、変換反応時に阻害されません。
Q-2. 変換処理を行った DNA は、どのような温度条件で、どのくらいの期間保存できますか?
A-2. -20℃以下で保存して下さい。変換 DNA の品質は、最大 3 か月間は未変換 DNA と同等です。
Q-3. EZ DNA Methylation-Direct Kit での DNA 変換が不完全でした。なぜでしょうか?
A-3. 固形組織の場合、試料量が多すぎたと思われます。
- FFPE(ホルマリン固定・パラフィン包埋)試料の場合、DNA が大幅なダメージを受けていたか、架橋により DNA 変換が不完全になったと思われます。
- Protease K 処理後の遠心分離時に残渣の除去が不完全な場合、DNA 変換反応が妨げられます。
Q-4. 変換 DNA を PCR で増幅する場合、お勧めの酵素は?
A-4. ZymoTaq DNA Polymeraseなどのホットスタートタイプの酵素をお勧めします。
Q-5. EZ-96 DNA Methylation Kit シリーズにはそれぞれ2 種類の製品がありますが、何が違うのですか?
A-5. キットに含まれるbinding plate の形状が違います。Shallow-Well、Deep-Well いずれも、多くの遠心分離機のローターに対応しています。
EZ-96 DNA Methylation Kit シリーズのBinding plate の仕様
商品コード | #D5003, #D5007, #D5022, #D5027 |
#D5004, #D5008, #D5023, #D5028 |
---|---|---|
Binding plate | Silicon-A binding plate | Zymo-spin I -96 binding plate |
形 状 | Shallow-Well | Deep-Well |
Binding plate の高さ | 19 mm | 35 mm |
Binding plate とCollection plate を組み合わせた時の高さ |
43 mm | 60 mm |
DNA 結合量/最小溶出量 | 5 μg / 30 μl | 5 μg / 15 μl |
Q-6. イルミナ社のテクノロジーに対応していますか?
A-6. イルミナ社の GoldenGate および Infinium アッセイに最適です。
Q-7. 変換処理を行った DNA はどのような解析法に使用できますか?
A-7. 標準的なシークエンシングの他、Ms-SNuPE(Methylation-sensitive Single-Nucleotide Primer Extension)、COBRA(Combined Bisulfite Restriction Analysis)、MSP(Methylation Sensitive PCR)や、質量分析による解析に使用できます。
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