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[掲載日情報:2017/09/01 現在]

Zymo Resach社 EZ DNA Methylation Kit シリーズに関する FAQ

Zymo Resach社 EZ DNA Methylation Kit シリーズに関する FAQ

Q 亜硫酸水素ナトリウム処理を行う試料 DNA は,どのようなバッファーに溶解すれば良いですか?

A

水,TE,TE 改良バッファーに溶解すれば,変換反応時に阻害されません。

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Q 変換処理を行った DNA は,どのような温度条件で,どのくらいの期間保存できますか?

A

-20℃以下で保存して下さい。変換 DNA の品質は,最大 3 か月間は未変換 DNA と同等です。

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Q EZ DNA Methylation-Direct Kit での DNA 変換が不完全でした。なぜでしょうか?

A

固形組織の場合,試料量が多すぎたと思われます。

  • FFPE(ホルマリン固定・パラフィン包埋)試料の場合,DNA が大幅なダメージを受けていたか,架橋により DNA 変換が不完全になったと思われます。
  • Protease K 処理後の遠心分離時に残渣の除去が不完全な場合,DNA 変換反応が妨げられます。

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Q 変換 DNA を PCR で増幅する場合,お勧めの酵素は?

A

link('ZymoTaq DNA Polymerase','#')); ?> などのホットスタートタイプの酵素をお勧めします。

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Q EZ-96 DNA Methylation Kit シリーズにはそれぞれ2 種類の製品がありますが,何が違うのですか?

A

キットに含まれるbinding plate の形状が違います。Shallow-Well,Deep-Well いずれも,多くの遠心分離機のローターに対応しています。

EZ-96 DNA Methylation Kit シリーズのBinding plate の仕様

商品コード #D5003, #D5007,
#D5022, #D5027
#D5004, #D5008,
#D5023, #D5028
Binding plate Silicon-A binding plate Zymo-spin I -96
binding plate
形 状 Shallow-Well Deep-Well
Binding plate の高さ 19 mm 35 mm
Binding plate とCollection
plate を組み合わせた時の高さ
43 mm 60 mm
DNA 結合量/最小溶出量 5 μg / 30 μl 5 μg / 15 μl

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Q イルミナ社のテクノロジーに対応していますか?

A

イルミナ社の GoldenGate および Infinium アッセイに最適です。

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Q 変換処理を行った DNA はどのような解析法に使用できますか?

A

標準的なシークエンシングの他,Ms-SNuPE(Methylation-sensitive Single-Nucleotide Primer Extension),COBRA(Combined Bisulfite Restriction Analysis),MSP(Methylation Sensitive PCR)や,質量分析による解析に使用できます。

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