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クロマチン免疫沈降(ChIP)から次世代シークエンス(NGS)用の試料の調製まで簡便かつ迅速に行えます EpiNext ChIP-Seq High-Sensitivity Kit

掲載日情報:2020/04/02 現在Webページ番号:51927

クロマチン免疫沈降(ChIP)から次世代シークエンス(NGS)用ライブラリー構築まで行えるキットです。少量の試料で、低バックグラウンドのChIPを行うことができます。作製したライブラリーはIllumina社の次世代シークエンサーに使用できます。

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ChIP-Seqについて

ChIP-Seqは、クロマチン免疫沈降(ChIP)と次世代シークエンス(NGS)を組み合わせた技術で、タンパク質-DNA相互作用の解析に有用なツールです。例えば、ChIP-Seqによるゲノムワイドな転写因子の結合領域の解析は、特に注目を集めています。その一方で、ChIP-Seqは下記のような欠点があります。

  1. 十分な量のDNAライブラリーを得るため、大量の細胞/組織が必要。そのため、腫瘍検体や胚組織などに適していない。
  2. ChIP DNAのバックグラウンドが高い。
  3. 作業が煩雑かつ時間がかかる。

この課題に対しEpigentek社は、少量の試料から迅速かつ簡便に低バックグラウンドのChIP DNAを得られ、次世代シークエンス用ライブラリーの構築まで行えるキットを開発しました。

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特長

  • 様々な生物種の細胞・組織から単離したクロマチンを用いることができます。
  • モノクローナル、ポリクローナル抗体のいずれも適用できます*
  • 細胞/組織のDNAの単離からライブラリーの構築まで、7時間以内で行うことができます。
  • バーコード配列を付加したマルチプレックス解析にも最適です。
  • 適用試料:培養細胞、新鮮/凍結組織など
  • 必要試料量:5×104~1×106細胞(4×105~5×105を推奨)、5~50 mg組織(20~30 mgを推奨)

*使用できる抗体のクラスはIgGのみです。また、ChIPに使用する抗体の適合性を、Pre-Sure ChIP Antibody Validation Kitなどにより、あらかじめ検証することをお勧めします。

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操作方法概略

EpiNext ChIP-Seq High-Sensitivity Kit操作方法概略

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使用例

RNAポリメラーゼⅡによるChIP後のqPCR解析

様々な量のMBD-231細胞に対しRNAポリメラーゼⅡによるChIPを行い、その後GAPDHプロモーターに対してqPCRを行った。

ChIPを行ったDNAを用いて構築したライブラリーのサイズ分布

RNAポリメラーゼⅡについてChIPを行ったDNAを用いて構築したライブラリーのサイズ分布



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キット内容

ChIP反応用

  • Wash buffer
  • Antibody buffer
  • Lysis buffer
  • ChIP buffer
  • DNA release buffer
  • DNA binding solution
  • Blocker solution
  • DNA elution buffer
  • Enrichment enhance
  • Protease inhibitor cocktail
  • Non-Immune IgG
  • Anti-RNA polymeraseⅡ
  • Proteinase K
  • Rnase A
  • GAPDH F & R primer
  • 8-well assay strips
  • 8-well strip caps
  • Adhesive covering film strip
  • F-spin column
  • F-collection tube

ライブラリー構築用

  • 10×end polishing buffer
  • End polishing enzyme mix
  • End polishing enhancer
  • 2× ligation buffer
  • T4 DNA ligase
  • Adaptors
  • MQ binding beads
  • 2× HiFi PCR master mix
  • Primer U & I
  • Elution buffer









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関連製品

品名をクリックすると製品の詳細、商品コードをクリックすると各製品の価格表をご覧いただけます。

品名 商品コード 製品概要
EpiNext NGS Barcode, Index, Set-12 P-1060-144 Epigentek Group社の次世代シークエンス用ライブラリー作製キットを用いてDNA/RNAライブラリーを作製する際に,バーコード配列を組み込むことができる製品。作製したライブラリーは、Illumina社の次世代シークエンサーに使用可能。

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価格

[在庫・価格 :2024年04月24日 17時35分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
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  • 在庫
  • 法規制等
納期 文献数
ChIP-Seq High-Sensitivity Kit, Illumina, EpiNext(12 reactions)
10日程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 1
説明文
別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 4℃,-20℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年5月1日号 p.21

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ChIP-Seq High-Sensitivity Kit, Illumina, EpiNext(24 reactions)
10日程度 ※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 1
説明文
別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 室温,4℃,-20℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年5月1日号 p.21

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[在庫・価格 :2024年04月24日 17時35分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。

ChIP-Seq High-Sensitivity Kit, Illumina, EpiNext(12 reactions)

文献数: 1

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別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 4℃,-20℃ 法規備考
掲載カタログ ニュース2020年5月1日号 p.21

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説明文
別包装品 別包装品あり
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お問い合わせ先

(テクニカルサポート 試薬担当)

reagent@funakoshi.co.jp

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