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メーカー：	Horizon社Dharmacon製品 OriGene Technologies TransOMIC Technologies
	Horizon社Dharmacon製品(メーカー略称：DHA)のRNAiコレクション，cDNAコレクション，Yeastコレクションなど，遺伝子機能研究に有用な遺伝子リソースを検索することができます。クローンコレクション検索の使い方はこちら OriGene Technologies社(メーカー略称：ORI)のTrueClone / TrueORF / TrueORF Gold cDNAクローンなど，遺伝子機能研究に有用な遺伝子リソースを検索することができます。クローンコレクション検索の使い方はこちら TransOMIC Technologies社(メーカー略称：TOT)のRNAiコレクション，cDNAコレクション，Yeastコレクションなど，遺伝子機能研究に有用な遺伝子リソースを検索することができます。クローンコレクション検索の使い方はこちら
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HOME> 試薬> 遺伝子工学> 遺伝子発現抑制> shRNA／siRNA> Trilencer-27 siRNA Kit

デザイン済み27-mer siRNAで遺伝子ノックダウンを確実に！ Trilencer-27 siRNA Kit

掲載日情報：2022/08/16 現在Webページ番号：4880

オリジーンテクノロジーズ /
OriGene Technologies, Inc.
[メーカー略称：ORI]

Trilencer-27 siRNAキットは、天然のDicerでプロセッシングされる27-merの二本鎖RNA（Dicer-Substrate）を含み、従来の21-mer siRNAに比べて2つの重要なアドバンテージ^＊1があります。

短い21-merのRNAiフォームよりも10倍高い効力と特異性を示します。
哺乳類の細胞でインターフェロン誘導を最小限に抑えることができます。

＊1 本基盤技術に関してはAmarzguiouiらの論文をご参照下さい。
Amarzguioui. M., et al., Nat. Protoc., 1(2), 508～517 (2006). ［PMID:17406276］

		Trilencer-27 siRNAキットの二本鎖RNAは、細胞内のDicerでプロセッシングを受け、21-merの二本鎖RNAとなります。
		これ以降は通常のsiRNAと同様にRISCによって認識され、標的mRNAが分解されます。

Trilencer-27 siRNAキットによる遺伝子ノックダウンの概念図

特長
使用例
関連した特集記事
キット内容
ご注文方法
使用文献について
Trilencer-27 siRNA KitのFAQ
Trilencer-27 コントロール siRNA

特長

27-merの二本鎖siRNAは、高いサイレンシング能力を持つ一方、インターフェロン応答を最小に抑えることができます。
デザイン済みのsiRNAは、ヒト、マウス、ラットと種を超えたゲノムを広くカバーしています。
遺伝子ノックダウン率70％以上を保証^＊2します。

＊2 保証内容：
OriGene社は、以下の3条件を満たし、キットに含まれる3コンストラクト中、2コンストラクトのノックダウン効率が定量的RT-PCRで定量し70％未満の場合、キットの納品日から90日以内にご連絡いただければ、新しく設計した二本鎖RNAと無償交換いたします。

トランスフェクション効率：TYE-563蛍光トランスフェクションコントロール二本鎖RNA（#SR30002）が90%以上の細胞に導入されたこと。
ノックダウン効率：HPRTポジティブコントロール（#SR30003）が90%のノックダウン効率を示していたこと。
使用濃度：10 nMで使用したこと。

なお、その際には、上記のトランスフェクション効率と、スクランブルsiRNAコントロールと比較した遺伝子発現ノックダウンの測定結果を示すデータをご提供下さい（定量的RT-PCRのデータが必要です）。

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使用例

Dicer基質siRNA（27-mer siRNA）および21-mer siRNAによる遺伝子ノックダウン効率の比較

CTCF標的siRNAの導入による下流配列の発現抑制

>A）SH-SY5Y 細胞（ヒト神経芽細胞腫由来）への導入例
SV40プロモーター（コントロール）と比べ、α6プロモーターの発現が抑制されている。

B）HEC-1B細胞（ヒト子宮内膜癌由来）への導入例
C-MYC（コントロール）と比べ、Protocadherin（Pcdhα6 / 12）の発現が抑制されている。
siCTCF：CTCF標的siRNA
siScr：スクランブル配列siRNA（ネガティブコントロール）
α-CTCF：抗CTCF抗体
α-H3：抗Histone H3抗体（コントロール）

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キット内容

1ターゲット遺伝子あたり3種類の二本鎖27-mer siRNA（各 2 nmol）
ネガティブコントロール（2 nmol）
siRNA duplex re-suspension buffer

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ご注文方法

OriGene社ホームページのSearchボックスにご希望の遺伝子のGene Name, Gene Symbol, GenBank Accessin No.などを入力して下さい。
検索結果の商品コードをお知らせ下さい。

検索例

ステロール代謝酵素で非アルコール性脂肪性肝疾患（NAFLD）への関与が注目を集めている17β-Hydroxysteroiddehydrogenase type 13（遺伝子名：HSD17B13）のノックダウンをヒト細胞で狙う場合、枠内に遺伝子名「HSD17B13」と入力して検索します。
検索結果として#SR317630（ヒト）、#SR505771（ラット）、#SR408896（マウス）が表示されたので、ヒトの#SR317630を選択します。

ご注文の際はここで表示される番号の#SR317630（商品コード）をお知らせ下さい。

大容量のsiRNAをお求めの場合

まずはキットをご購入いただき、標的遺伝子に最適であるかをご確認下さい。ご確認後、大容量のsiRNAの合成を承ります。価格・納期についてはお問い合わせ下さい。

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使用文献について

OriGene社siRNAの使用文献については、以下の2種類の方法でご確認いただくことができます。
※ 厳選されたOriGene社製品の、代表的な使用文献のみを掲載しています。

① 使用文献一覧

OriGene社siRNAの使用文献一覧はこちらからご確認いただくことができます。

② 各製品の使用文献

OriGene社ホームページのSearchボックスで目的siRNAの検索を行い、検索結果を表示させると、文献掲載実績がある製品の場合、使用文献数が表示されます（下図参照）。
さらに製品名をクリックし、製品詳細のページへ移行すると、文献情報をご確認いただけます。

使用文献の例

使用した製品：p53 Human siRNA（#SR322075）

Li, Z., et al., Cancer Biol. Ther., 23 (1), 225 (2022). [PMID: 35275031]
Wang, L.L., et al., PLoS One, 13 (3), e0193560 (2018). [PMID: 29518119]
De Souza, R.A.G., et al., J. Huntingtons Dis., 7 (3), 223 (2018). [PMID: 30103339]
Fan, C., et al., Cell. Physiol. Biochem., 41 (3), 1229 (2017). [PMID: 28268222]

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Trilencer-27 siRNA KitのFAQ

Q1 従来の21-mer siRNAとTrilencer-27 siRNAの違いを教えて下さい。

A-1. (クリックで開閉します)

従来の21-merの二本鎖RNAiは、細胞内の長いRNAが基質となりDicerにより切断されて生じる天然型のsiRNAをモデルとしています。一方、Trilencer-27 siRNAは、27-merのsiRNAを基質として、同様にDicerによるプロセッシングを経て、21-merのsiRNAを生じます。この手法では、同じ部位を標的とした従来の21mer siRNAよりも10倍高い効力を得ることができるとされています（Amarzguiouiらの論文、PMID: 17406276によります）。

Q2 Trilencer-27 siRNAのデザインのどこが優れているのですか？

A2 (クリックで開閉します)

このデザイン手法は、標的遺伝子にのみ配列が適合するように配列をBLASTで確認し、二次構造のチェックを行い、RISC複合体に組み込まれるよう二本鎖の安定性を確認するなど、各種スクリーニングを実施しデザインされていることがメリットです。

Q3 製品の使用法を教えて下さい。

A3 (クリックで開閉します)

キットに含まれる3種類の二本鎖siRNAは、トランスフェクションや遺伝子ノックダウンの研究にそのまま使用できます。トランスフェクション後、細胞ライセートを調製し、標的タンパク質に対する抗体を用いてウエスタンブロット解析を行い、二本鎖siRNAの機能性を確認したり、トランスフェクションした細胞からRNAを回収し、定量的RT-PCRを用いて遺伝子発現の抑制を確認することができます。また、検証したsiRNAターゲットをOriGene社のshRNAウイルスベクターに組み込む、”exact-shRNAサービス” を利用することができます。OriGene社のshRNAウイルスベクターには、レトロウイルス、レンチウイルス、AAVベクターなどの種類があり、トランスフェクションやウイルス感染に使用できます。

Q4 Trilencer-27キットにはどのようなコントロール（対照）がありますか？

A4 (クリックで開閉します)

本キットに含まれているコントロールは、Universal Scrambled Negative Control Duplex（#SR30004）です。その他、下記のコントロールも購入できます。

TYE 563標識トランスフェクションコントロール二本鎖RNA（#SR30002）
HPRT1ポジティブコントロール二本鎖（#SR30003）

Q5 “Scrambled non-effective siRNA duplex”（#SR30004）は、どんな目的で使うのですか？

A5 (クリックで開閉します)

siRNAの発現によって誘発されるインターフェロン応答といった潜在的な非特異的効果を除外するために、ネガティブコントロールとして使用します。この二本鎖RNAは、遺伝子特異的ノックダウン実験でのネガティブコントロールとして機能し、潜在的なインターフェロン応答の影響の除外に役立ちます。

Q6 Trilencer-27 siRNA KitにはRT-PCR用の試薬が付属しますか？

A6 (クリックで開閉します)

siRNAキットの内容は下記の通りです。

二本鎖（Dicer-Substrate）RNAiが3種類（各2 nmol）
ネガティブコントロール用二本鎖RNAが1種類（2 nmol）
RNase-freeのバッファー Duplex re-suspension buffer

定量的PCRのための、qSTARプライマーペアとSYBR Greenマスターミックスは別途購入可能です。詳細については、OriGene社ウェブサイトをご覧下さい。

Q7 Trilencer-27 siRNAでノックダウン実験を行う場合の推奨濃度を教えて下さい。

A7 (クリックで開閉します)

標的遺伝子のノックダウンレベルは、トランスフェクション効率に大きく左右されます。トランスフェクション効率を評価するために、各実験では必ずHPRT1ポジティブコントロール二本鎖（#SR30003）などを使用する必要があります。さらに、様々な量（例えば 0.1～50 nM）のTrilencer-27 siRNAを使用して、どのsiRNA量で最大のノックダウンが観察されたかを見ます。通常、最適な濃度は1～50 nMの間にあり、10 nMが最も一般的です。

Q8 Trilencer-27 siRNAに対するOriGene社の保証は何ですか？

A8 (クリックで開閉します)

OriGene社は、以下の(1)～(3)の3条件を満たし、キットに含まれる3コンストラクト中、2コンストラクトのノックダウン効率が定量的RT-PCRで定量し70％未満の場合、キットの納品日から90日以内にご連絡いただければ、新しく設計した二本鎖RNAと無償交換いたします。