真菌類／細菌からのDNA抽出・精製キット Quick-DNA Fungal/Bacterial Kit
掲載日情報：2021/12/16 現在Webページ番号：448
超高密度BashingBeadを用いて、溶菌が困難なA. fumigatus、C. albicans、N. crassa、S. cerevisiae、S. pombeなどの真菌類、グラム陽性／陰性細菌、藻類または原虫から直接DNAを抽出・精製できます。得られたDNAは、そのままPCRに使用できます。
※ 本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。
※ 2017年にZR Fungal/Bacterial DNA Kitは、品名がQuick-DNA Fungal/Bacterial Kitへと変更されました。商品コードおよびキット内容には変更はありません。
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2024/02/29
試薬 モニター
ZYMO RESEARCH（ZYR）
特長
- BashingBead、Lysis buffer、スピンカラムまたは96 wellプレートを用いて、真菌類または細菌のDNAを抽出・精製できます。
- 試料をZR BashingBead lysis/filtration tubeに加え、溶解液を加えた後に試料破砕装置により破砕します。
- 有機溶媒やプロテアーゼは使用しません。
- 適応試料：真菌類、グラム陽性／陰性細菌、藻類、原虫
- DNA純度：A260/A280 ＞1.8
適応機器
以下の製品との適合が確認されています。
- Disruptor Genie（#S6001-2-120、Scientific Industries社）
- FastPrep 24 Instrument Version.4（#6004-500、MP Biomedicals社）
- FastPrep-24 5G Instrument（#6005-500、MP Biomedicals社）
- DX50B Bullet Blender Blue 50 (NEXT ADVANCE社)
- 2010 Geno/Grinder（SPEX SamplePrep社）
各種破砕装置での破砕条件の検証例
以下のバナーをクリックすると、ZymoBIOMICS Microbial Community Standard（#D6300）を使用し、さまざまな機械的破砕装置のバイアスを最少化する破砕条件を検証した例をご覧いただけます。
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製品の種類
商品コードをクリックすると価格表がご覧いただけます。
| 品名 | Quick-DNA Fungal/Bacterial Kit | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| Microprep Kit | Miniprep Kit | Midiprep Kit | 96 Kit | ||
| 商品コード | D6007 | D6005 | D6105 | D6006 | |
| 使用回数 | 50 preps | 50 preps | 25 preps | 2×96 preps | |
| Zymo-Spinカラムイメージ | 
Zymo-Spin Ⅲ-Fカラム |
Zymo-Spin V-E Column with Zymo-Midi Filter |
Slicon A Plate |
||
| フォーマット | スピンカラム | 96 wellプレート | |||
| 試料 | 真菌、細菌（湿重量） | 10～20 mg | 50～100 mg | 250～500 mg | 10～20 mg/well |
| 細菌（細胞数） | 2×108 | 109 | 5×109 | 2×108/well | |
| 酵母（細胞数） | 2×107 | 108 | 5×108 | 2×107/well | |
| 軟組織 | 40 mg | 200 mg | 1 g | 40 mg/well | |
| DNA回収量（／最小溶出液量） | ≦5μg / 10μl | ≦25μg / 35μl | ≦125μg / 150μl | ≦5μg / 25μl | |
| DNAサイズ | 100 bp～40 kb、≧40 kb | ||||
| 操作時間 | 15 min | 20 min | 40 min | ||
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操作方法概略
Quick-DNA Fungal/Bacterial MicroPrep/MiniPrep Kit
- ZR BashingBead lysis tubeを使用して真菌または細菌細胞を破砕する。
- 遠心分離後、ライセートをZymo-Spin Ⅲ-F filterでろ過する。
- フロースルーをZymo-Spin ⅠC columnにアプライして、DNAを担体に結合させ、洗浄、ろ過する。
- 遠心分離し、高純度なDNAが得られる。
Quick-DNA Fungal/Bacterial MidiPrep Kit
- ZR BashingBead lysis/filtration tubeを使用して真菌または細菌細胞を破砕する。
- 遠心分離後、ライセートをろ過する。
- フロースルーをZymo-Spin V-E column w/ Zymo-Midi filterに加え、遠心分離（図の上側）またはバキュームマニホールドを使用して真空吸引ろ過（図の下側）し、DNAを担体に結合させる。
- 洗浄、溶出後する。
- 遠心分離し、高純度なDNAが得られる。
Quick-DNA Fungal/Bacterial 96 Kit
- ZR BashingBead lysis rackで試料を処理する。
- 遠心分離し、処理した試料を96-well deep well blockに入れる。
- 遠心分離し、Silicon-A plateを使用してDNAを担体に結合、洗浄、溶出させる。
- 遠心分離し、高純度なDNAが得られる。
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キット内容
キットの商品コードをクリックすると、キットの価格をご覧いただけます。キット内容の各●印をクリックすると、キット内容物の単品の価格表をご覧いただけます。
| 品名 | Quick-DNA Fungal/Bacterial Kit | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| MicroPrep Kit | MiniPrep Kit | MidiPrep Kit | 96 Kit | ||
| キット外観 | 
|
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| 商品コード | D6007 | D6005 | D6105 | D6006 | |
| キット内容 | ZR BashingBead lysis tube (0.5/0.1 mm) | ● | ● | － | |
| ZR BashingBead lysis/filtration tube | － | ● | － | ||
| ZR BashingBead lysis rack (0.5/0.1 mm) | － | ● | |||
| Bashingbead buffer | ● | ● | － | ● | |
| Genomic lysis buffer | ● | ● | ● | ● | |
| DNA Pre-wash buffer | ● | ● | ● | ● | |
| g-DNA wash buffer | ● | ● | ● | ● | |
| DNA elution buffer | ● | ● | ● | ● | |
| Zymo-Spin Ⅲ-F filter | ● | ● | － | ||
| Zymo-Spin ⅠC column | ● | － | |||
| Zymo-Spin ⅡCR column | － | ● | － | ||
| Zymo-Spin V-E column w/ Zymo-Midi filter | － | ● | － | ||
| Collection tube | ● | ● | ● | － | |
| 96-well block | － | ● | |||
| Silicon-A plate | － | ● | |||
| Collection plate | － | ● | |||
| Elution plate | － | ● | |||
| Cover foil | － | ● | |||
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FAQ
Q-1. ライセートが粘性を有しているようですが、原因は何ですか？ どのように対応すれば良いですか？
A-1. 粘性が高い試料は、溶解が不完全であることを示しています。試料の使用量を減らし、ビーズの破砕条件（持続時間、速度、時間）を最適化して試料を完全に溶解して下さい。ビーズで破砕後、細胞破片をペレット化してから次のステップに進みます。ライセートにGenomic lysis bufferを添加すると、試料の希釈とタンパク質除去が容易になり、試料の粘度が低下してDNA回収に適したものになります。
Q-2. ビーズの破砕条件を最適化するためのコツはありますか？
A-2. 高速ホモジナイザーと低速セルディスラプターの両方を使用してキットを検証しました。ご使用の破砕装置での破砕条件については、ご自身で最適化を行うことを強くお勧めします。ビーズによる破砕が効率的になるように、2 mlチューブアダプターを使用することをお勧めします（発泡材質のアダプターは使用しないで下さい）。高速ホモジナイザーの場合、合計5分間のビーズ破砕をお勧めします（6.5 m/sで1分間の破砕操作後、5分間の休止を5回繰り返す）。低速セルディスラプターの場合、最高速度で30分間の破砕をお勧めします。
Q-3. β-メルカプトエタノール（BME）を追加する必要がありますか？ このステップを置き換えたり省略したりできますか？
A-3. 試料の溶解を促進するためにβ-メルカプトエタノールの添加が推奨されますが、ジチオスレイトール（DTT、最終濃度10 mM）を代わりに使用することができます。なお、ビーズの破砕が最適化され、溶解が効率的である場合はBMEの追加は不要であり、省略することができます。
Q-4. RNase A処理を追加するとしたらプロトコルのどこのステップですか？
A-4. キット容量内の量の試料を処理する場合、追加のRNaseA処理は必要ありません。選択的化学反応により、カラムに二本鎖DNAが結合し、RNAがフロースルーに流出します。
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関連製品
Zymo RESEARCH社の真菌類／細菌からのDNA分離・精製キットの種類
品名をクリックすると製品の詳細、商品コードをクリックすると各製品の価格表をご覧いただけます。
| 品名 | Prep数 | 商品コード | 製品の概要 | |
|---|---|---|---|---|
| Quick-DNA Fungal/Bacterial Kit | MicroPrep | 50 preps | D6007 | 超高密度BashingBeadを用いて、溶菌が困難なA. fumigatus、C. albicans、N. crassa、S. cerevisiae、S. pombeなどの真菌類や、グラム陽性／陰性細菌、藻類または原虫から直接DNAを抽出・精製するキット。 |
| MiniPrep | 50 preps | D6005 | ||
| MidiPrep | 25 preps | D6105 | ||
| 96 Kit | 2×96 preps | D6006 | ||
| YeaStar Genomic DNA Kit | 40 preps | D2002 | A. fumigatus, A. nidulans, A. nivens var. aureus, C. albicans, P. pastoris, S. cerevisiae, S. pombeなど、溶菌が困難な広範な真菌類の細胞壁を酵素的に溶解し、DNAを抽出、精製するキット。 | |
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価格
[在庫・価格 ：2024年04月16日 20時55分現在]
| 詳細 | 商品名 |
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文献数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Fungal/Bacterial Microprep Kit, Quick-DNA (50preps) |
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Fungal/Bacterial Miniprep Kit, Quick-DNA (50preps) |
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Fungal/Bacterial Midiprep Kit, Quick-DNA (25preps) |
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Fungal/Bacterial 96 Kit, Quick-DNA (2×96preps) |
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[在庫・価格 ：2024年04月16日 20時55分現在]
Fungal/Bacterial Microprep Kit, Quick-DNA (50preps)
文献数： 0
- 商品コード：D6007
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥45,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
溶解しにくい菌類，酵母，グラム陽性菌，グラム陰性菌から，ビーズ入りチューブを用いてDNAを抽出・精製するキット。旧製品名：ZR Fungal/Bacterial DNA MicroPrep |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2023年2月1日号 p.13 ニュース2022年6月1日号 p.18
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Fungal/Bacterial Miniprep Kit, Quick-DNA (50preps)
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- 商品コード：D6005
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥45,000
- 在庫：2個
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
溶解しにくい菌類，酵母，グラム陽性菌，グラム陰性菌から，ビーズ入りチューブを用いてDNAを抽出・精製するキット。旧製品名：ZR Fungal/Bacterial DNA MiniPrep |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2023年2月1日号 p.13 ニュース2022年6月1日号 p.18
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- 商品コード：D6105
- メーカー：ZYR
- 包装：1kit
- 価格：¥103,000
- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
溶解しにくい菌類，酵母，グラム陽性菌，グラム陰性菌から，ビーズ入りチューブを用いてDNAを抽出・精製するキット。旧製品名：ZR Fungal/Bacterial DNA MidiPrep |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2022年6月1日号 p.18 ニュース2022年1月合併号 p.6
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- 在庫：無(未発注)
- 納期：2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。
- 法規制等：
| 説明文 |
溶解しにくい菌類，酵母，グラム陽性菌，グラム陰性菌から，ビーズ入りチューブを用いてDNAを抽出・精製するキット。旧製品名：ZR-96 Fungal/Bacterial DNA Kit |
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|---|---|---|---|
| 法規制等 | |||
| 保存条件 | 室温 | 法規備考 | |
| 掲載カタログ |
ニュース2022年6月1日号 p.18 ニュース2021年1月合併号 p.14
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Quick-DNA 96 Kit |
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