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1ステップで非メチル化シトシンをウラシルに変換するバイサルファイト処理キット EZ DNA Methylation-Gold Kit

掲載日情報：2020/06/12 現在Webページ番号：1110

ザイモリサーチ /
ZYMO RESEARCH
[メーカー略称：ZYR]

1 ステップで亜硫酸水素塩処理（バイサルファイト処理）によってDNAの非メチル化シトシンをウラシルに変換した後、迅速かつ簡単にDNAを抽出・精製できるキットです。DNAのメチル化解析に有用です。

※本製品は研究用です。研究用以外には使用できません。

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DNAメチル化について

DNAは、DNAメチルトランスフェラーゼと呼ばれる酵素の働きによって、5’-CG-3’のシトシン基（CpG）がメチル化されます。DNAのメチル化によって、遺伝子の発現や細胞の分化、発生といった様々な細胞内の働きを制御しています。また、DNAのメチル化は様々な疾患のバイオマーカーとしても注目されています。
また、DNA脱メチル化経路において中間体としての役割を担う5-ヒドロキシメチルシトシン（5-hmC）もまた、新しいエピジェネティックな調節を担っていると考えられています。
近年ではmRNA, tRNA, miRNAなど様々なRNA種においてもメチル化が起こり、RNAの安定性やmRNAの翻訳のような様々な過程の制御に影響を与えていることが示唆されています。



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メチル化DNA検出キットラインナップ

製品EZ DNA Methylation1、2EZ DNA Methylation-Gold3、4EZ DNA Methylation-Lightinig Kit3、5EZ DNA Methylation-Direct KitEZ DNA Methylation Startup Kit
製品説明スタンダードタイプ迅速プリメイドの変換試薬を含み便利細胞・組織を直接処理可能初めての方に
形状（溶出液量）スピンカラム（≧10μl）、96ウェル（≧15μl）、MagBead（≧25μl）スピンカラム（≧10μl）
変換効率≧99％≧99％≧99.5％≧99.5％≧99％
処理時間12～16時間3時間1.5時間4時間4時間
アプライ量500pg～2μg DNA500pg～2μg DNA100pg～2μg DNADNA(≧50pg)、細胞(≧10)、血液、パラフィン包埋組織切片(FFPE)

※MagBeadのみオートクレーブ可。
※Startup Kitはメチル化コントロールプライマー付き。


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メチル化DNA検出キットは以下の解析システムで使用が推奨されています

対応するキットは上記「メチル化DNA検出キットラインナップ」一覧表中の商品名末尾の番号をご参照ください。

  1. Illumina Infinium and GoldenGate assay systems
  2. Sequenom MassARRAY EpiTYPER
  3. Epicentre EpiGnome Methyl-Seq kit
  4. Agilent Technologies SureSelect Methyl-Seq Target Enrichment System
  5. Roche NimbleGen SeqCap Epi Enrichment System

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特長

  • DNA を化学的変性ではなく熱により変性させることにより、DNA変性と亜硫酸水素処理（バイサルファイト処理）を 1 ステップで行えます。
  • 独自の技術を用いたカラムを使用することにより、DNA の脱亜硫酸水素化工程と DNA の精製工程が同時に行えます。
  • DNA の損傷、損失が最小限に抑えられています。
  • 高純度の変換DNA が高い回収率で回収できます。
  • 回収した変換DNA は制限酵素処理、シークエンシングやマイクロアレイ等により解析します。
  • 96 ウェルフォーマットの製品もあります（#D5007）。

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操作法概略

EZ DNA Methylation Kit シリーズ各キットの操作法概略
EZ DNA Methylation Kit シリーズ操作法概略図EZ DNA Methylation KitEZ DNA Methylation-Gold KitEZ DNA Methylation-Direct Kit

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キット内容

  • CT conversion reagent
  • M-dilution buffer-Gold
  • M-dissolving buffer-Gold
  • M-binding buffer-Gold
  • M-wash buffer
  • M-desulphonation buffer
  • M-elution buffer
  • Zymo-spin IC column（#D5005, #D5006のみ）
  • Collection tube（#D5005, #D5006のみ）
  • Silicon-A binding plate（#D5007のみ）＊
  • Zymo-spin I-96 filtration plate（#D5008のみ）＊
  • Conversion plate with pierceable cover foil（#D5007, #D5008のみ）
  • Collection plate（#D5007, #D5008のみ）
  • Elution plate（#D5007, #D5008のみ）

＊ #D5007と#D5008でプレートの形状が異なります。詳細は、下記FAQのQ-5をご覧下さい。


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製品掲載誌のご紹介

アオリ文 タイトル

『実験医学別冊　エピジェネティクス実験スタンダード』（羊土社）にて
Zymo Research社 EZ DNA Methylation Kitが掲載されました

『実験医学別冊　エピジェネティクス実験スタンダード
　もう悩まない！ ゲノム機能制御の読み解き方』
※ 上記をクリックすると（株）羊土社のサイトへ移動します。

　　
掲載
ページ		タイトル紹介製品
37領域特異的バイサルファイト
シークエンシング		EZ DNA Methylation Kit (#D5001)
45メチル化特異的PCR法EZ DNA Methylation Kit(#D5002)
77MassARRAYを用いたメチル化解析EZ DNA Methylation Kit
119Infiniumを用いたメチル化解析EZ DNA Methylation Kit
131PBAT法によるメチローム解析EZ DNA Methylation-Gold Kit (#D5005)

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FAQ

FAQ (クリックで開閉します)

Q-1. 亜硫酸水素ナトリウム処理を行う試料 DNA は、どのようなバッファーに溶解すれば良いですか？
A-1. 水、TE、TE 改良バッファーに溶解すれば、変換反応時に阻害されません。

Q-2. 変換処理を行った DNA は、どのような温度条件で、どのくらいの期間保存できますか？
A-2. －20℃以下で保存して下さい。変換 DNA の品質は、最大 3 か月間は未変換 DNA と同等です。

Q-3. EZ DNA Methylation-Direct Kit での DNA 変換が不完全でした。なぜでしょうか？
A-3. 固形組織の場合、試料量が多すぎたと思われます。

  • FFPE（ホルマリン固定・パラフィン包埋）試料の場合、DNA が大幅なダメージを受けていたか、架橋により DNA 変換が不完全になったと思われます。
  • Protease K 処理後の遠心分離時に残渣の除去が不完全な場合、DNA 変換反応が妨げられます。

Q-4. 変換 DNA を PCR で増幅する場合、お勧めの酵素は？
A-4. ZymoTaq DNA Polymeraseなどのホットスタートタイプの酵素をお勧めします。

Q-5. EZ-96 DNA Methylation Kit シリーズにはそれぞれ2 種類の製品がありますが、何が違うのですか？
A-5. キットに含まれるbinding plate の形状が違います。Shallow-Well、Deep-Well いずれも、多くの遠心分離機のローターに対応しています。

EZ-96 DNA Methylation Kit シリーズのBinding plate の仕様

商品コード#D5003, #D5007,
#D5022, #D5027		#D5004, #D5008,
#D5023, #D5028
Binding plateSilicon-A binding plateZymo-spin I -96
binding plate
形　状Shallow-WellDeep-Well
Binding plate の高さ19 mm35 mm
Binding plate とCollection
plate を組み合わせた時の高さ		43 mm60 mm
DNA 結合量／最小溶出量5 μg ／ 30 μl5 μg ／ 15 μl

Q-6. イルミナ社のテクノロジーに対応していますか？
A-6. イルミナ社の GoldenGate および Infinium アッセイに最適です。

Q-7. 変換処理を行った DNA はどのような解析法に使用できますか？
A-7. 標準的なシークエンシングの他、Ms-SNuPE（Methylation-sensitive Single-Nucleotide Primer Extension）、COBRA（Combined Bisulfite Restriction Analysis）、MSP（Methylation Sensitive PCR）や、質量分析による解析に使用できます。


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価格

[在庫・価格 ：2024年04月24日 00時00分現在]

※ 表示されている納期は弊社に在庫が無く、取り寄せた場合の納期目安となります。
詳細 商品名
  • 商品コード
  • メーカー
  • 包装
  • 価格
  • 在庫
  • 法規制等
 納期 文献数
DNA Methylation-Gold Kit, EZ (50 reactions)
 2週間程度 ※※ 表示されている納期は弊社に在庫がなく、取り寄せた場合の目安納期となります。 0
説明文
メチル化DNA検出キット。DNAを化学的変性ではなく熱により変性させることにより，DNA変性と亜硫酸水素処理（バイサルファイト処理）を 1 ステップで行う。
別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 室温 法規備考
掲載カタログ ニュース2021年3月15日号 p.4
ニュース2020年5月1日号 p.6

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別包装品 別包装品あり
法規制等
保存条件 室温 法規備考
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法規制等 取扱注意
保存条件 室温 法規備考
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メチル化DNA検出キット。
法規制等 取扱注意
保存条件 室温 法規備考
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DNA Methylation-Gold Kit, EZ (50 reactions)

文献数： 0

説明文 メチル化DNA検出キット。DNAを化学的変性ではなく熱により変性させることにより，DNA変性と亜硫酸水素処理（バイサルファイト処理）を 1 ステップで行う。
別包装品 別包装品あり
法規制等
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別包装品 別包装品あり
法規制等
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※キット別売品については、EZ DNA Methylation Kit の記事をご参照下さい。その他の別売品についてはお問合せ下さい。

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お問い合わせ先

（テクニカルサポート 試薬担当）

reagent@funakoshi.co.jp

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